Анализ качества FastQ-файлов и исправление ошибок
29 Февраля 19:00 МСК
Описание:
На вебинаре вы научитесь:

  • Пользоваться программой FastQC для оценки качества секвенирования и интерпретировать ее вывод.

  • Фильтровать сырые прочтения секвенатора по качеству и длине, отрезать адаптеры и праймерные последовательности. Мы будем работать с реальными данными секвенирования с платформы Illumina.

  • Устанавливать программу FastQC, запускать ее и анализировать получаемый отчет. На основании этого отчета мы сможем понять, насколько качественно было проведено секвенирование и какие манипуляции с прочтениями необходимо совершить для дальнейшей обработки данных.

  • Запускать программы cutadapt и prinseqlite. Мы разберем их настраиваемые параметры, чтобы фильтровать некачественные части прочтений и оставлять только те данные, с которыми дальше можно работать.

Аудитория:

Вебинар будет полезен биологам, химикам, врачам и всем, кто хочет начать свой самостоятельный путь в обработке биологических данных.

ДАТА ПРОВЕДЕНИЯ: 29 ФЕВРАЛЯ 2024 г., НАЧАЛО В 19:00

СТОИМОСТЬ: 1490 РУБЛЕЙ
кнопка (2).png


Кто ведет лекцию?
Айгинин Андрей