• Пользоваться программой FastQC для оценки качества секвенирования и интерпретировать ее вывод.

• Фильтровать сырые прочтения секвенатора по качеству и длине, отрезать адаптеры и праймерные последовательности. Мы будем работать с реальными данными секвенирования с платформы Illumina.

• Устанавливать программу FastQC, запускать ее и анализировать получаемый отчет. На основании этого отчета мы сможем понять, насколько качественно было проведено секвенирование и какие манипуляции с прочтениями необходимо совершить для дальнейшей обработки данных.

• Запускать программы cutadapt и prinseqlite. Мы разберем их настраиваемые параметры, чтобы фильтровать некачественные части прочтений и оставлять только те данные, с которыми дальше можно работать.

Аудитория:

Вебинар будет полезен биологам, химикам, врачам и всем, кто хочет начать свой самостоятельный путь в обработке биологических данных.