Геномы западных желтых павианов содержат гены трех близких видов

Исследование полногеномных данных 255 диких особей павианов прояснило популяционную структуру и эволюционную историю этих приматов. Оказалось, что за потоки генов между популяциями ответственны преимущественно самцы. Также авторы впервые описали смешение трех линий нечеловекообразных обезьян.

Credit:
123rf.com

Павианы (род Papio) представляют из себя крайне разнообразную кладу приматов, в которой наблюдаются активные потоки генов между шестью признанными в настоящее время видами. Ранее ученые уже исследовали генетическое разнообразие рода, однако они обычно ограничивались одной-двумя популяциями на вид, что не позволяет выделишь крупномасштабные географические паттерны. Новое масштабное исследование, опубликованное в тематическом номере журнала Science, пролило свет на эволюционную историю этих приматов.

Международная группа ученых проанализировала данные полногеномного секвенирования образцов, полученных от 225 диких особей павианов из 19 локалитетов.

Популяционно-генетический анализ показал, что, несмотря на хорошо описанные зоны гибридизации, в популяции павианов четко выделяются генетические кластеры, в большинстве своем соответствующие видам с определенной долей внутривидовой дифференциации. При этом некоторые виды анализа выделяли популяции желтых павианов (Papio cynocephalus) из западной Танзании в отдельную группу (отличную от восточных популяций этого вида). Более подробное изучение этой группы показало, что западные популяции желтых павианов являются продуктом смешения трех разных линий — собственно желтых павианов, павианов анубисов (Papio anubis) и бабуинов-кинда (Papio kindа). Это первый случай смешения трех генетических линий, описанный у нечеловекообразных приматов.

Филогенетический анализ, преимущественно по мтДНК, показал, что первичное разделение в кладе произошло на северную и южную группы в процессе миграции. По мтДНК до сих пор наблюдается разделение на две митохондриальных клады.

Ученые также обнаружили признаки того, что генетические потоки между популяциями обусловлены в первую очередь миграцией самцов — доля примеси «чужих» генетических кластеров в аутосомных хромосомах в большинстве случаев была выше, чем по X-хромосоме. Такое явление связано с тем, что самцы гемизиготны по X-хромосоме и при миграции приносят непропорционально больше «чужих» аутосомных генов, чем находящихся на X-хромосоме.

Интересны также данные, полученные относительно происхождения бабуинов кинда. Ранее выдвигались предположения, что эта группа — продукт недавнего смешения. Однако по результатам данной работы бабуины кинда являются самостоятельной хорошо сформированной группой. Анализ Y-хромосомы показал, что это сестринская группа по отношению к остальным павианам. По X-хромосоме и аутосомам было установлено, что они оказываются внутри южной клады. Полученные результаты указывают на то, что бабуины кинда являются базальной ветвью павианов, которая затем гибрдизировалась с новообразованными группами.

Наконец, авторы описали современные миграционные потоки между популяциями, а также подтвердили генетическими данными существование нескольких зон гибридизации, раннее только предполагавшихся по морфологическим данным.

Исследователи считают, что сложная популяционная структура павианов может служить хорошей моделью для изучения популяционных процессов в других группах приматов. Интересны также параллели между эволюцией линий павианов и человека.

На бабуинов действует скрытый отбор против межвидового скрещивания

Источник:

Sørensen E.F., et al. Genome-wide coancestry reveals details of ancient and recent male-driven reticulation in baboons // Science 380, eabn8153, published June 2, 2023. DOI: 10.1126/science.abn8153

Добавить в избранное