Тезаурус

Hi-C — финальная модификация метода фиксации конформации хромосом (англ. Chromosome Сonformation Сapture, 3C) — метод анализа трехмерной структуры хромосом в ядре клетки. Изучение пространственной структуры хромосом имеет большое значение для понимания механизмов регуляции экспрессии генов, репликации и репарации ДНК, рекомбинации. Принцип метода следующий: делается ряд рестрикций и последующих лигирований в ДНК, предварительно обработанной формальдегидом. Формальдегид «сшивает» все близкорасположенные участки ДНК, а рестрикции и лигирования позволяют изолировать эти участки. Таким образом создается библиотека 3/4/5/HI-C, которая секвенируется и анализируется при помощи компьютерных статистических программ. Анализ выдает не только то, в каком участке генома находится интересующий ген, но и его взаиморасположение с другими участками. Разные методики позволяют получить различные данные: 3С — взаиморасположение одного гена-мишени и еще какого-либо одного, 4С — взаиморасположение одного гена относительно всех взаимодействующих с ним участков, 5С — нескольких генов относительно всех взаимодействующих с ними. Hi-C позволяет узнать практически все пространственные взаимодействия в геноме. Данный метод уникален также тем, что совместим с секвенаторами последнего поколения, что обеспечивает высокую разрешающую способность.

Схема этапов Hi-C