PacBio представляет платформу для коротких прочтений

На ежегодном собрании Advances in Genome Biology and Technology Янг Ким, старший менеджер по продуктам в Pacific Biosciences предоставил информацию по платформе секвенирования Onso с короткими прочтениями, которая вскоре должна поступить в продажу. Комплект на 300 циклов с емкостью от 120 до 150 гигабаз будет стоить 1995 долларов (около 15 долларов за гигабазу); стоимость комплекта на 200 циклов с емкостью от 80 до 100 гигабаз — 1695 долларов (около 19 долларов за гигабазу). По словам Кима, фирма оптимизирует плотность кластеров, чтобы получить 800 млн считываний на проточную ячейку.

Янг Ким показал данные двух внутренних бета-тестирований, которые показали, что 90% секвенированных оснований имеют показатели качества, значительно превышающие Q40 (точность 99,99%). Он заявил, что в случае использования для раковых панелей, определяющих низкочастотные мутации, или других анализов типа «иголка в стоге сена» эта точность при более низком охвате обеспечивает такой же результат, как у других платформ для короткого считывания при высоком охвате. Ким продемонстрировал данные двух неназванных таргетных раковых панелей, для которых два неуказанных конкурента обычно используют покрытия 25 000 и 35 000. Onso обнаруживает мутации с аналогичной чувствительностью при покрытиях 6250 и 8750 соответственно, позволяя снизить расходы более чем вдвое. Кроме того, Ким показал данные исследования 10 000 отдельных клеток с использованием набора для анализа экспрессии генов 10x Genomics.


PacBio на JPM Health 2023

Добавить в избранное

Вам будет интересно