Структурные вариации в генах STK26 и DPP4 ассоциированы с тяжестью COVID-19
Международная команда ученых идентифицировала структурные вариации человеческого генома, потенциально ассоциированные с тяжестью COVID-19. Работа выполнена на образцах от 52 пациентов с тяжелой формой коронавирусной инфекции. Для поиска редких структурных вариаций ученые использовали метод оптического геномного картирования. Они обнаружили семь структурных вариаций, затрагивающих гены врожденного иммунитета и воспалительного ответа, а также гены контроля репликации и распространения вируса. Наиболее значимыми кандидатами оказались структурные вариации в генах STK26 и DPP4. STK26 экспрессируется в иммунных клетках и участвует в ответе на инфекцию. DPP4 кодирует пептидазу, которая вовлечена в активацию T-клеток. Авторы считают, что для комплексной оценки генетических детерминант тяжести COVID-19 необходимо не только секвенировать геномы, но также анализировать структурные вариации. Работа опубликована в iScience.