Супербактерии возвращаются в американские больницы в результате пандемии

Норовирусы подразделяются на 10 геногрупп (GI-GX), которые далее делятся на генотипы на основе двойной систематики: по гену капсидного белка VP1 и домену РНК-зависимой РНК-полимеразы в области RdRp. Классификация норовирусов важна, поскольку они часто рекомбинируют, что может повлиять на трансмиссивность. Специалисты из ФГБУ ЦСП ФМБА России и Детской городской клинической больницы № 9 имени Г.Н. Сперанского разработали систему для высокоточного генотипирования норовируса путем амплификации региона RdRp–VP1, нанопорового секвенирования и биоинформатического анализа.

Ранее опубликованные протоколы для типирования норовирусов основаны на амплификации коротких фрагментов (500–700 п.н.), не охватывающих сайт рекомбинации RdRp–VP1, а секвенирование по Сэнгеру не выявляет смешанные инфекции или минорные варианты. Новая система генотипирования позволяет полностью амплифицировать геномную область RdRp–VP1 размером ~3,2 кб за одну реакцию ПЦР, охватывая «горячую точку» рекомбинации между этими функциональными доменами. Благодаря этому становится возможным чувствительное выявление смешанных инфекций и рекомбинантных вариантов даже при концентрации 1% для минорных генотипов.

Систему валидировали с помощью ретроспективного анализа 115 случаев острого гастроэнтерита у детей в Москве в 2021–2025 гг. Анализ показал, что преобладал норовирус GII.4[P16], а генотип GII.17[P17] стал вторым по распространенности после 2021 года. Напротив, частота встречаемости ранее распространенных генотипов GII.4[P31] и GII.3[P12] резко снизилась. Смешанные инфекции были выявлены в 4% случаев. Благодаря полученным данным удалось удвоить количество длинных (>3000 п.н.) геномных последовательностей NoV-GII из России в общедоступных базах данных. Новая система подходит для высокоточного эпиднадзора, своевременного выявления новых штаммов и принятия мер для защиты общественного здоровья.

Европейский центр профилактики и контроля заболеваний (ECDC) сообщает, что грибок Candidozyma auris продолжает быстро распространяться по больницам Европы, представляя серьезную угрозу для пациентов. Число случаев заболевания растет, масштабы вспышек увеличиваются, а в ряде стран продолжаются случаи локальной передачи инфекции. Это четвертое посвященное данному патогену исследование ECDC.

Candidozyma auris (ранее Candida auris) — патогенный грибок, встречающийся в медицинских учреждениях. Многие штаммы устойчивы к противогрибковым препаратам, и и может вызывать тяжелые инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом. Его способность сохраняться на различных поверхностях и передаваться между пациентами делает борьбу с ним особенно сложной. Исследование ECDC охватило 36 стран. По полученным данным, в период с 2013 по 2023 год в странах ЕС и Европейской экономической зоны было зарегистрировано более 4 000 случаев инфекции, из них 1 346 — только в 2023 году в 18 странах. Это самый высокий показатель с 2014 года, когда инфекция впервые была зарегистрирована в Европе. Большинство случаев за десятилетие приходится на пять стран — Испанию (1 807 случаев), Грецию (852), Италию (712), Румынию (404) и Германию (120).

Несмотря на рост числа случаев заболевания, система эпидемиологического надзора за C. auris сейчас есть только в 17 из 36 стран-участниц, принятые меры предотвращения — в 15 из них, хотя доступ к лабораторным микологическим тестам имеется в 29 странах. Без систематического мониторинга и обязательной отчетности масштабы проблемы могут быть занижены. Предоставленные ECDC данные подчеркивают важность раннего выявления и контроля передачи инфекции во избежание ее быстрого распространения.

Выпуск неместных видов в дикую природу ассоциирован с повышенным риском зоонозных инфекций. К такому выводу пришли ученые из Великобритании, которые обнаружили связь между распространенностью бореллий, переносимых клещами, и завозом фазанов.

Фазаны — не аборигенный для Великобритании вид, но около 47 миллионов этих птиц ежегодно выпускают для любительской охоты. Исследователи проанализировали клещей, переносящих бактерий рода Borrelia (возбудителя болезни Лайма), в местах выпуска фазанов. Они изучили 25 лесных массивов на юго-западе Англии, где выпускают птиц, и в 25 контрольных лесах поблизости — в радиусе до двух километров, — где фазанов не выпускают. Оказалось, что на территории, где ежегодно выпускают фазанов для охоты, боррелии были почти в 2,5 раза более распространены, чем в лесах, где этого не происходит (7,8% против 3,2%). Кроме того, в местах, где выпускали фазанов, были более многочисленны взрослые особи клещей, но не их нимфы. При этом фазаны считаются компетентными хозяевами бореллий — вероятность заражения и передачи у них относительно высока. Ученые полагают, что намеренно выпускаемые неместные виды могут способствовать распространению зоонозных инфекций, хотя и признают, что данных о частоте передачи заболевания человеку у них пока нет.

21 января 2025 года стало известно о вспышке неизвестной болезни в Демократической Республике Конго. Центр вспышки находится в деревне Болоко (медико-санитарная зона Боломба), где ранее в январе трое детей съели мертвую летучую мышь, после чего у них развились геморрагические симптомы, и они погибли. Впоследствии болезнь развилась еще у 12 жителей деревни (восемь из них погибли), а также в ближайшей деревне Данда (два случая заражения и одна смерть). Симптомы включают лихорадку, головную боль, ломоту в теле, скованность шеи, кашель, кровотечение и желудочно-кишечные симптомы. 

Уже 9 февраля начали поступать данные о второй вспышке в деревне Бромате (медико-санитарная зона Басанкусу). Изначально сообщалось о 32 случаях заражения и 20 смертях. К 15 февраля было известно о 419 случаях и 45 смертях, к 19 февраля — о 955 случаях и 60 смертях. В половине случаев смерть наступала в течение 48 часов после появления симптомов. Образцы 13 пациентов были направлены в Национальный институт биомедицинских исследований в Киншасе. Вирусы Марбург и Эбола в образцах отсутствовали. Более половины образцов были положительны на малярию, которая распространена в том регионе. Продолжается тестирование клинических образцов. Также будут проанализированы образцы продуктов питания, воды и окружающей среды.

Пока неясно, как связаны эти две вспышки. Затронутые медико-санитарные зоны находятся в 180 км друг от друга. В регион были направлены предметы первой необходимости медицинского назначения, включая наборы для тестирования. 

Российские ученые из ФИЦ фундаментальной и трансляционной медицины, ДГТУ (Ростов-на Дону), ГНЦ ВБ «Вектор» и других научных центров провели ПЦР-скрининг хантавирусов в образцах крови и фекалий летучих мышей из Ростовского центра реабилитации рукокрылых ДГТУ (грант РНФ 23-24-00276). Хантавирусы были обнаружены в образцах от рыжих вечерниц (Nyctalus noctula) с распространенностью 4,94% (4 из 81) в сыворотке крови и 1,1% (2 из 182) в фекалиях. Они в высокой степени гомологичны лоанвирусу Брно (Loanvirus brunaense), ранее найденному у N. noctula в Брно (Чехия). Этот лоанвирус распространен также в Германии, Австрии и Польше.

Новая находка подтверждает, что вирус специфичен к определенному виду летучих мышей (это необычная черта для хантавирусов рукокрылых) и распространен от Центральной Европы до юга России и Предкавказья.