Утренний кофе. Лучшие способы расстроить рецензента
Работы над созданием синтетических геномов эукариот продолжаются — в 2023 году в рамках проекта Synthetic Yeast Project был получен почти полный набор хромосом дрожжей Saccharomyces cerevisiae, а одной из новых задач стало создание генома человека. «Синтетический геном человека» (SynHG) — это пятилетний многоцентровый проект, в котором участвуют исследователи из университетов Кембриджа, Кента, Манчестера, Оксфорда и Имперского колледжа Лондона. Его руководитель говорит, что основная цель — расширить возможности медицины и найти принципиально новые подходы к терапии, хотя и не отрицает некоторых этических рисков.
Подробнее
Статья в Nature Communications описывает новые комплексы органелл — гемифузомы (hemifusome), — обнаруженные в клетках человека методом криоэлектронной томографии. Это особые мембранные структуры, состоящие из частично слившихся везикул. Оказалось, что гемифузомы составляют до 10% везикулярных органелл на периферии клетки, но не участвуют в канонических путях эндоцитоза. По их морфологии и наличию везикул внутри авторы предполагают, что эти структуры служат платформами для биогенеза везикул.
Подробнее
Специалист по биостатистике из Астонского университета рассказал о самых распространенных ошибках, с которыми он сталкивался как рецензент в научных журналах. Проанализировав более 200 статей, он опубликовал список из 10 ошибок при составлении научных публикаций, надеясь, что поможет будущим исследователям избежать их. В список вошли упоминания причинно-следственных связей в работах, которые показали только ассоциацию, смешение разных регрессионных моделей (например, с несколькими зависимыми переменными или с несколькими предикторами), а также несоблюдение структуры аннотаций в статье.
Подробнее
Рептилиям необходимы внешние источники тепла, чтобы поддерживать функции организма, однако слишком высокая температура увеличивает риск обезвоживания. Ученые проанализировали популяции карликового синеязыкого сцинка (Tiliqua adelaidensis) — эндемичной ящерицы Австралии, находящейся под угрозой исчезновения. Они выяснили, что поведение северных и южных популяций различается — северные сцинки чаще предпочитали вылезать из нор на поверхность, но были активны только при достаточной влажности. Когда северных ящериц переселили южнее, в более мягкий климат, первое время они прятались в укрытиях и оставались требовательны к влажности, но спустя два года адаптировались. Авторы рассматривают переселение сцинков как способ спасти вид от вымирания.
Подробнее
Полигенная адаптация, при которой отбор действует сразу на множество вариантов, — важный эволюционный механизм, но его трудно обнаружить. Авторы статьи в Science проанализировали, как менялся геном европейского ясеня (Fraxinus excelsior), который в последние десятилетия подвергался сильному давлению патогенного грибка Hymenoscyphus fraxineus. Они составили список из примерно восьми тысяч генетических вариантов, для которых обнаружились различия в частотах аллелей между молодыми и взрослыми деревьями. Моделирование показало, что под давлением патогена исчез 31% ювенильной популяции ясеня, а с ним и аллели, снижающие приспособленность в новых условияз. Иными словами, полигенная адаптивная микроэволюция произошла за одно поколение.
Подробнее