Вебинары по быстрой детекции специфических иммунных клеток и секвенированию ДНК из окружающей среды состоятся в январе

Быстрое обнаружение антигенспецифичных В- и Т-клеток методом баркодирования клеток с помощью присоединения антигена (BEAM).

Сессия 1: 19 января 20:00 Мск

Сессия 2: 20 января 06:00 Мск

Организатор 10x Genomics, язык вебинара — английский.

Спикеры:

Bruce Adams, PhD, Cell Biology Staff Scientist, 10x Genomics.

Nur-Taz Rahman, PhD, Applied Bioinformatics Scientist, 10x Genomics.

Зарегистрироваться>>

BEAM — это новый метод обнаружения антигенспецифичных В- и Т-клеток, который преуспевает там, где традиционные методы терпят неудачу. Он представляет собой мультиплексный скрининг антигенов, который позволяет быстро обнаруживать антигенспецифичные клонотипы В-клеток (BEAM-Ab) и Т-клеток (BEAM-T).

Метод основан на проверенном рабочем процессе профилирования иммунных клеток и позволяет проводить скрининг BCR/TCR на наличие предполагаемых антигенов в сочетании с экспрессией генов, секвенированием V(D)J и экспрессией поверхностных маркеров.

С помощью BEAM вы сможете:

·         идентифицировать и охарактеризовать редкие типы клеток и биомаркеры

·         провести анализ микроокружения тканей, прогрессирования заболевания и иммунного ответа на лекарственные средства

·         провести масштабный поиск антител и TCR для новых антигенов

·         охарактеризовать иммунный ответ на инфекцию путем измерения клональной экспансии и фенотипов иммунных клеток

·         профилировать тысячи генов на уровне отдельной клетки путем штрихкодирования мРНК на 5’-конце для объективной характеристики типов клеток и их состояний

·         одновременно получить профиль иммунного репертуара (BCR/TCR) и экспрессии генов из одной и той же клетки, чтобы обеспечить корреляцию клонотипа с соответствующим подтипом клетки

·         получить парные рецепторные последовательности полной длины из Т-клеток и/или В-клеток с полным разрешением изотипа, обеспечив таким образом функциональные данные для обнаружения антител/TCR

·         объединить анализ экспрессии генов с обнаружением сотен поверхностных белков при высоком разрешении для многопараметрической цитометрии

·         Использовать таргетные панели для исследования экспрессии генов, чтобы сосредоточиться на наиболее важных генах и ускорить ваши исследования.

Присоединяйтесь к вебинару, чтобы узнать подробности!

Нанопоровое секвенирование ДНК из образцов окружающей среды: в лаборатории и в полевых условиях

26 января 18:00 Мск

Организатор Oxford Nanopore Technologies, язык вебинара — английский.

Спикеры:

Лара Урбан, главный исследователь Пионерского кампуса Гельмгольца, института искусственного интеллекта им. Гельмгольца и Школы естественных наук Мюнхенского технического университета.

Дэвид Вернер, профессор моделирования экологических систем Ньюкаслского университета.

Зарегистрироваться>>

Неинвазивный динамический мониторинг какапо, находящегося под угрозой исчезновения, в режиме реального времени

Лара Урбан расскажет об использовании неинвазивных геномных подходов в режиме реального времени для мониторинга одной из последних выживших популяций какапо (Strigops habroptilus), находящихся под угрозой исчезновения.

На примере какапо вы узнаете, как:

·         разработать протокол метабаркодирования ДНК из образцов окружающей среды для анализа распределения видов позвоночных с использованием образцов почвы;

·         применить нанопоровое секвенирование в реальном времени для извлечения видоспецифичной ДНК из почвы;

·         Идентифицировать присутствие особей по полученным данным.

Лаборатория молекулярной микробиологии в одном чемодане

Дэвид Вернер опишет определение характеристик бактериального сообщества с помощью анализа ДНК из образцов окружающей среды с использованием только портативного оборудования.

Команда Вернера собрала лабораторию-чемодан, которая включает секвенатор MinION и приборы, необходимые для концентрирования биомассы, выделения, очистки и контроля качества ДНК, а также для подготовки библиотеки для секвенирования.

При помощи этой портативной лаборатории на станции очистки сточных вод в Великобритании и в управлении водоснабжения и канализации Аддис-Абебы в Эфиопии всего за один день были выполнены все этапы пробоподготовки и секвенирования гена 16S рРНК, в том числе отбор проб, выделение и очистка ДНК, ПЦР-амплификация, подготовка библиотек и само секвенирование.

Таксономические данные стали доступны в течение 24–72 часов в зависимости от скорости Интернета.

«Лаборатория в чемодане» также использовалась в Танзании для изучения воздействия выгребных ям на бактериологическую опасность неглубоких и глубоких грунтовых вод под неофициальным поселением.

В этой части вебинара вы узнаете:

·         из чего состоит портативная лаборатория для молекулярной микробиологии;

·         как валидировать результаты с использованием известных стандартов ДНК и обычных лабораторных методов;

·         как отслеживать источники загрязнения фекалиями и проводить количественную оценку микробного риска;

·         как опыт исследований в Эфиопии, Танзании и Великобритании поможет в вашей работе.

Подключайтесь, чтобы узнать об опыте ученых в работе с ДНК окружающей среды.