Анализ мастер-регуляторов транскрипции может помочь подобрать эффективный противоопухолевый препарат

На конференции «Клиническая диагностика и персонализированная медицина» завершает работу секция «Персонализированная медицина: клинические случаи и технологии». Один из участников, Наталья Сушенцева, биолог научно-исследовательской лаборатории трансляционной медицины СПб ГБУЗ «Городская больница № 40», выступила с докладом об эффективности терапии аденокарциомы кишечника в зависимости от ее молекулярного профиля (по ее собственным словам — о том, что было бы, если бы нас лечили машины).

Сушенцева отметила, что принятая сейчас парадигма лечения онкозаболеваний «от гена к лекарству» несовершенна, так как не дает информации о потенциально эффективной терапии при мутациях с негативным прогнозом ответа. Можно пойти другим путем, «снизу», а именно с транскриптома и сдвигов уровней экспрессии. Этот путь выбрала группа Сушенцевой в своем исследовании. Команда искала мастер-регуляторы транскрипции, которые могли бы вернуть патологическое воздействие транскрипционных факторов на метаболизм к норме.

Исследование охватило трех пациентов с колоректальным раком, близкими мутационными профилями опухолей и схожими исходными условиями. В 2018 году всем им была проведена операция и назначена терапия. При этом два пациента к настоящему времени скончались, а третий жив и отвечает на терапию, несмотря на изначально плохой прогноз. В поисках причин таких различий ученые секвенировали РНК опухолей и обратились к ПО для работы с транскриптомными данными. Анализ мастер-регуляторов транскрипции показал, что сработать могли бы совершенно не те препараты, которые были назначены исходя из мутационного профиля. В случае с выжившим пациентом программа поддержала выбор врачей.

По словам Сушенцевой, возможно, компьютер лечил бы нас лучше. Не исключено, что в будущем компьютерная диагностика будет играть большую роль в персонализации терапия.

После доклада возникла дискуссия о препаратах, назначенных пациентом. Один из слушателей предположил, что представленные данные о схемах терапии неполны.

Добавить в избранное

Вам будет интересно

08.10.2026
111
0

Кахексия, или тяжелое истощение, поражает многих онкобольных — с ней связаны до половины смертей от рака. Одобренных методов лечения пока нет. Биотехнологический стартап OnVagus сообщил, что получил одобрение на начало клинического испытания неинвазивного устройства для борьбы с этим состоянием.

Устройство OnVagus предназначено для электрической стимуляции блуждающего нерва, который проводит сигналы между мозгом и многими внутренними органами. Механизм, связывающий активность блуждающего нерва и кахексию, был описан в прошлом году в Cell. Авторы статьи показали на мышах, что блокада блуждающего нерва замедляет прогрессию кахексии и снижает ее тяжесть. Теперь устройство, которое оказывает такой эффект с помощью электрических стимулов, начнут испытывать на пациентах.

В оценку безопасности планируют пригласить 10 пациентов с раком поджелудочной железы и кахексией, включение первого ожидается уже в этом месяце. Безопасность и удобство будут оценивать в течение восьми недель, также планируется оценить облегчение симптомов кахексии и изменение уровней биомаркеров. Если предварительные результаты подтвердят безопасность, команда приступит к рандомизированному двойному слепому исследованию — на 120 пациентах оценят эффект действующего устройства по сравнению с его имитацией.

01.09.2026
356
0

Компания BioNTech прекращает клинические исследования (КИ) фазы 2 аутогена цевумерана (BNT122/RO7198457) — мРНК-препарата для персонализированной иммунотерапии рака. В рамках исследования он применялся как адъювантная монотерапия (то есть без ингибиторов контрольных точек) у пациентов с колоректальным раком II или III стадии, положительным по циркулирующей опухолевой ДНК, после хирургического удаления опухоли. Аутоген цевумеран разрабатывается совместно компаниями BioNTech и Genentech, входящей в группу Roche.

Колоректальный рак — иммунологически «холодный», слабо реагирующий на иммунотерапию и связанный с высоким риском метастатического рецидива. В ходе КИ оценивалась способность аутогена цевумерана предотвратить рецидив у этой группы пациентов по сравнению с выжидательной тактикой (текущим стандартом лечения).

Как сообщается в пресс-релизе, независимый Совет по мониторингу безопасности данных (DSMB) выявил «численный дисбаланс» в общей выживаемости между группами лечения в данной популяции пациентов, отметил, что продолжение исследования вряд ли изменит результаты по эффективности, и рекомендовал завершить КИ. В то же время тревожных сигналов, связанных с безопасностью, не выявлено.

Другое КИ аутогена цевумерана — в комбинации с ингибированием контрольных точек и химиотерапией при адъювантной панкреатической протоковой аденокарциноме — продолжается в соответствии с планом.

«Хотя этот результат не соответствует нашим ожиданиям (…), он дает научное представление о проблемах лечения иммунорезистентных типов опухолей с иммуносупрессивной микросредой и поможет в дальнейшем развитии экспериментальных иммунотерапевтических мРНК-препаратов для лечения рака. Мы по-прежнему привержены мРНК как ключевому элементу нашей онкологической стратегии и нашим новым комбинированным подходам», — сказала Озлем Тюреджи, директор по медицине BioNTech.

В марте 2026 года было объявлено, что компанию BioNTech покидают ее соучредители супруги Угур Шахин и Озлем Тюреджи. В настоящее время происходит передача полномочий. Новым гендиректором BioNTech с начала 2027 года станет Гвидо Элкерс из шведской компании Orphan Biovitrum AB.

29.07.2026
306
0

Меланома американских сомиков оказалась трансмиссивным раком — это четвертый тип таких опухолей во всем мире и первый у рыб. Результаты исследования, подтверждающие это, опубликованы в Nature. 

Аномально частые случаи меланом у американских сомиков (Ameiurus nebulosus) в озере Мемфремейгог, расположенного на границе США и Канады, наблюдались с 2012 года. Ученые задокументировали их у 23–37% рыб, отловленных в период с 2014 по 2017 год. Полногеномное секвенирование опухолей, определенных по данным гистологии, указало на их происхождение из клональной линии. Митохондриальные геномы отдельных опухолей были ближе друг к другу, чем к митогеномам хозяев. Однонуклеотидные варианты (SNV) и структурные вариации в ядерном геноме также оказались общими для многих опухолей, но отсутствовали в нормальной ткани рыб-хозяев. Мутации могут накапливаться в опухолевой ткани, но, по словам авторов, их частота значительно превышала уровни, характерные для незаразного рака — речь идет о сотнях тысяч таких генетических вариантов. Иными словами, опухоль была генетически слабо связана с самой рыбой. 

Частая встречаемость опухолей в популяции могла бы объясняться наличием онкогенного вируса или иного патогена, провоцирующего развитие рака, однако их ученые не обнаружили. Они приходят к выводу, что меланома этих сомиков представляет собой трансмиссивную опухоль, которая произошла из клональной линии раковых клеток и распространилась в популяции рыб. Ранее трансмиссивный рак был задокументирован у собак, тасманийских дьяволов и нескольких видов двустворчатых моллюсков. 

06.07.2026
222
0

Первичные опухоли костей удаляют хирургически, однако может возникнуть местный рецидив, приводящий к ампутации. Также возможно отторжение имплантатов из-за инфекции. Международная группа исследователей предложила использовать усовершенствованный синтетический трансплантационный материал. В матрицу «Биостекло 45S5», состоящую из SiO2, CaO, Na2O и P2O5, они включили оксид галлия. В результате получили многофункциональный материал, который одновременно уничтожает раковые клетки, предотвращает бактериальные инфекции и восстанавливает недостающую костную ткань.

По словам авторов, биоматериал действует как система для локальной доставки лекарств. Он доставляет ионы кальция, фосфата и кремния, необходимые для восстановления здоровой ткани.

Секвенирование РНК подтвердило, что клетки рака поглощают в 4–8 раз больше галлия, чем здоровые клетки, так как у них в избытке экспрессируются рецепторы трансферрина для обеспечения быстрого роста. Попав внутрь клетки, галлий имитирует железо, но не может участвовать в важных окислительно-восстановительных реакциях. Это вызывает окислительный стресс и клеточный кризис, который запускает в раковых клетках апоптоз и ферроптоз. Здоровые клетки защищаются с помощью естественных антиоксидантных механизмов. Дополнительно достаточно высокое содержание галлия подавляет рост патогенов, таких как Pseudomonas aeruginosa. Со временем стекло разрушается, освобождая место для новой костной ткани.

26.06.2026
369
0

Журнал Nature Medicine отозвал статью, в которой утверждалось, что у пациентов с раком легких, получавших иммунотерапию утром, а не после 15:00, вероятность роста опухолей была вдвое ниже, а продолжительность жизни увеличилась почти на год. Это исследование широко обсуждалось в прессе и социальных сетях после его публикации в феврале. Если бы его результаты подтвердились, это изменило бы формат лечения пациентов с раком. Но публикация сразу вызвала сомнения у ряда специалистов.

На PubPeer и в социальных сетях исследователи заявили, что результаты, возможно, слишком хороши, чтобы быть правдой. Были и другие тревожные сигналы. Например, ни один из пациентов не выбыл из исследования из-за побочных эффектов, что необычно при лечении рака. Дизайн исследования и показатели результатов, которые должны быть утверждены до начала исследования, изменились в ходе работы. Кроме того, в клиническом исследовании применялись антитела, уровень которых в крови медленно снижается в течение нескольких недель, поэтому не существовало «многих убедительных биологически обоснованных гипотез» относительно того, почему введение препарата утром могло бы иметь значение, — заявил онколог Суманта Пал.

В результате редакторы журнала Nature сначала добавили к статье предупреждение, а после изучения дополнительных данных, предоставленных авторами, отозвали ее. Последний автор статьи, Юнчан Чжан из Онкологической больницы провинции Хунань, написал в электронном письме журналу Science, что внутренняя проверка подтвердила наличие ряда проблем в исследовании. «Мы признаем эти недостатки и искренне приносим извинения за любые неудобства, причиненные журналу и его читателям», — написал он.

Более ранние исследования указывали на пользу от проведения иммунотерапии по утрам. Метаанализ, опубликованный в журнале JAMA в мае, показал, что такой подход связан с лучшими результатами лечения ряда солидных опухолей. Однако он основывался в основном на ретроспективных исследованиях. Дополнительные проспективные исследования последних нескольких месяцев поставили под сомнение предполагаемую пользу утреннего лечения рака. Авторы работы, представленной в марте на Европейском конгрессе по раку легких пришли к выводу, что время суток, когда проводится иммунотерапия, не влияет на выживаемость. Авторы другой работы, представленной весной на ежегодном собрании Американского общества клинической онкологии, не выявили связи между утренним лечением и улучшением выживаемости у пациентов с раком молочной железы. Необходимо провести дополнительные исследования этого явления, написали они в электронном письме журналу Science.

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.