Бактерии съедают хлорохин в воде океанариума

Датские ученые проанализировали исходы для людей, попавших в отделение неотложной помощи с сепсисом. Результаты работы были представлены на конгрессе Европейского общества неотложной медицинской помощи. Всего 2110 пациентов с подозрением на инфекцию включили в исследование, из них у 714 развился сепсис. В течение двух лет (медиана) 361 человек (50,6%) погиб от различных причин, включая сепсис.

У людей старшего возраста каждый следующий год повышал риск смерти на 4%. Рак в анамнезе увеличивал риск более чем в два раза (121%), ишемическая болезнь сердца повышала риск смерти на 39%, деменция — на 90%, сепсис в течение предыдущих шести месяцев — на 48%. Пока исследователям не удалось создать модель, которая могла бы предсказать исход сепсиса в клинической практике. Нужно изучить дополнительные факторы, включая осложнения.

Некоторые штаммы Mycobacterium tuberculosis географически изолированы, другие широко распространены. Предполагалось, что изолированные штаммы лучше заражают людей, проживающих на «их» территориях, но доказать это сложно. В новой работе исследователи из Гарвардской медицинской школы и коллабораторы проанализировали медицинские данные 2279 человек из Нью-Йорка, Амстердама и Гамбурга, заразившихся туберкулезом, а также 12 749 их близких контактов. Авторы также секвенировали патоген и определяли вероятность его передачи.

Оказалось, что у контактных лиц риск заражения был на 14% ниже, а риск заболевания — на 45% ниже в случае географически изолированного штамма, если сравнивать с широко распространенной линией. Географически изолированный штамм бактерии скорее заразит человека из того же географического региона. Так, если человек, с которым контактирует носитель микобактерии, родом из того же региона, что и штамм патогена, вероятность заражения выше на 38% по сравнению со случаем, когда контактное лицо из другого региона. Если же мать и отец человека родились в одном регионе, а сам человек в другом, важно происхождение родителей. По мнению авторов, это указывает на существование совместной эволюции между людьми и микробами.

Лучшим предиктором того, заразит ли пациент контактное лицо, считается бактериальная нагрузка в дыхательной системе. Но совпадение места происхождения контактного лица и штамма бактерии было еще лучшим предиктором. Оно даже перевешивало наличие таких факторов риска, как диабет и другие хронические заболевания.

Роберт Фитак (Университет Центральной Флориды, Орландо) — сторонник гипотезы, согласно которой МТБ могут быть симбионтами животных, способных ориентироваться по геомагнитному полю. Он провел поиск в Архиве прочтений последовательностей (Sequence Read Archive, SRA) созданном Национальным центром биотехнологической информации. Этот общедоступный репозиторий недавно сделал возможными крупномасштабные интерактивные запросы через облачные среды и теперь предоставляет также информацию о таксономической принадлежности ридов. Фитак получил набор данных, который включает сотни миллионов последовательностей, принадлежащих 214 таксонам МТБ. Находки были ассоциированы с различными группами животных; особенно богатыми МТБ оказались рептилии и плоские черви.

Сейчас Фитак и его студенты ищут последовательности МТБ у зеленых и головастых морских черепах, которые ориентируются по магнитному полю во время миграций. У черепах исследуют «слезы» (секрет окологлазных солевых желез), так как их легко собирать, а протоки расположены близко к нервам.

В тропических лесах Малайзии обитает летучая мышь Dyacopterus spadiceus — единственный известный вид млекопитающих, самцы которых способны производить молоко. Ученые предполагают, что вскармливание только одним из родителей может быть эволюционной стратегией, сдерживающей распространение патогенных микроорганизмов среди млекопитающих.

При вскармливании новорожденных молоком происходит вертикальная передача микроорганизмов от родителя к потомству. Авторы статьи в Nature Communications построили математическую модель, с помощью которой показали, что такая передача от двух родителей позволяет патогенам распространяться в популяции хозяев. При этом передача только от одного родителя предотвращает подобное распространение. Поскольку передача микроорганизмов у плацентарных млекопитающих происходит во время рождения от матери к детенышу, последующая передача микробиома через молоко также должна происходить от матери — это объясняет, почему у млекопитающих происходит отбор против лактации самцов. Таким образом, патогенные бактерии способствуют отбору генов млекопитающих, поддерживающих передачу микробиоты только от одного из родителей.

Исследователи отредактировали геном тихоходки с помощью метода DIPA-CRISPR (direct parental CRISPR). Они работали с видом Ramazzottius varieornatus, который состоит только из самок, размножающихся бесполым способом. Авторы хотят выявить гены, отвечающие за высокую устойчивость тихоходки к стрессорам. Подробнее.

При анализе современных и исторических геномов бактерии Pseudomonas viridiflava, патогена Arabidopsis thaliana, ученые обнаружили, что она способна «захватывать» гены бактериофагов, кодирующие токсин. Это помогает ей контролировать численность других близкородственных бактерий. При этом токсин не влияет на потенциально полезные бактерии растений. Авторы считают, что это открытие поможет подобрать альтернативу антибиотикам. Подробнее.

Для начала движения клетке необходимо нарушить симметрию. Чтобы изучить этот процесс, исследователи получили круглую минимальную синтетическую клетку с двойной мембранной, фосфолипидами, очищенными белками, солями и АТФ. В центр клетки поместили белок FKBP, а на мембрану — FRB; они работают как молекулярные переключатели. Под действием рапамицина FKBP связывает FRB и запускает полимеризацию актина. Клетка приобретает вытянутую форму. Авторы планируют дать клетке возможность двигаться. Подробнее. 

Мышам с опухолями не давали есть в течение 24 часов дважды в неделю. Это не снизило их вес, но сильно повлияло на естественные киллеры. Они «научились» использовать жирные кислоты как альтернативу глюкозе в качестве источника энергии. Это значительно оптимизировало их противораковую реакцию, так как опухолевое микроокружение также богато липидами. Более того, перепрограммирование естественных киллеров под действием голодания позволило им вырабатывать больше цитокинов, находясь в опухоли. Подробнее. 

Ученые выявили у мышей 2700 энхансеров, которые влияют на экспрессию генов, отвечающих за рост. У человека подобных энхансеров обнаружилось 2400. Для поиска они использовали метод, позволяющий получить мышиные эмбрионы с флуоресцентными костями. Подробнее.