Давление отбора в вакцинированной популяции благоприятствует вариантам коронавируса, уклоняющимся от антител
Ученые из Калифорнийского университета в Сан-Франциско секвенировали геномы SARS-CoV-2 более чем у тысячи пациентов с COVID-19, заболевших в период с февраля по июнь 2021 года, когда в районе залива Сан-Франциско циркулировали наряду с другими вариантами коронавируса штаммы эпсилон, альфа и дельта. Среди пациентов 125 были инфицированы несмотря на предшествующую вакцинацию.
Варианты вируса, имеющие хотя бы одну мутацию, ассоциированную с уклонением от нейтрализующих антител (L452R/Q, E484K/Q, F490S) намного чаще встречались у вакцинированных индивидов, чем у невакцинированных, — 78% против 48%. Это показывает, как изменяется давление отбора: вирусы, которые уклоняются от иммунного ответа, получают преимущество в вакцинированном сообществе (в августе-2021 в данном регионе было привито более 70% населения). Для мутаций, повышающих инфекционность, разница в частоте между привитыми и непривитыми заболевшими не была такой значительной.
Вирусные нагрузки у привитых, болеющих с симптомами, и непривитых заболевших оказались сопоставимыми. Это позволяет предположить, что симптоматические вакцинированные могут активно распространять COVID-19.