Меню
Все темы
HYBRiD — простой метод для того, чтобы сделать большой биологический образец прозрачным
Новый метод HYBRiD (hydrogel-based reinforcement of three-dimensional imaging solvent-cleared organs (DISCO)) позволяет делать прозрачными большие биологические образцы и даже целые организмы. Растворитель вымывает все молекулы, которые делают ткань непрозрачной, такие как жиры, сохраняя белки и структурные элементы. После этого можно использовать флуоресцентные метки для визуализации таргетов.
Уже существуют методы, позволяющие делать прозрачным мозг и изучать нервные соединения. Однако они плохо работают на образцах других тканей. HYBRiD последовательно использует органические растворители и детергенты на водной основе, а также гидрогель для сохранения нужных молекул. Он проще предыдущих методов и подходит для рутинных исследований. Новый подход применили для визуализации инфицированных SARS-CoV-2 клеток в груди мыши.
Вам будет интересно
672
0
На встрече специалистов, работающих с нанопоровым секвенированием, в Хьюстоне 7 декабря старший вице-президент Oxford Nanopore по управлению продуктами и программами Розмари Синклер Докос и старший вице-президент по R&D Лакмал Джаясингхе представили новые улучшения в точности секвенирования ДНК. Это прежде всего достижение рекордного для нанопора показателя Q28 (99,8 %) средней точности для единичных молекул благодаря машинному обучению и улучшенным моделям. Самое длинное прочтение с точностью Q30 (99,9%) в наборе данных — 1,1 мегабазы. Команда подробно описала новый метод устранения ошибок в гомополимерных областях, который в сочетании с другими обновлениями платформы увеличил точность консенсуса человеческих последовательностей до Q50.
Дополнительные обновления платформы включают улучшения секвенирования РНК.
Поскольку Oxford Nanopore продолжает расширять круг пользователей на рынках клинических и промышленных приложений, команда поделилась новостями о линейке продуктов Q-Line для прикладных задач. Также объявлено о доступе к бета-версии TurBOT (автоматизированное решение для секвенирования образцов с интегрированным секвенатором MinION) — очередной этап сотрудничества с Tecan.
932
0
На секции обсуждались новейшие научные разработки в области диагностики «на чипах» и пути их адаптации для использования в местах оказания медицинской помощи. К.ф.м.н. Дмитрий Багров (биологический факультет МГУ имени М.В. Ломоносова) рассказал о перспективах применения электроформованных мембран в биосенсорах. Мембраны, сформированные из ультратонких полимерных волокон методом электроспиннинга, можно использовать как подложки в планшетах или микрофлюидных устройствах или для повышения пределов обнаружения аналита за счет фильтрации.
К.ф.м.н. Дмитрий Нечипуренко (физический факультет МГУ) представил концепцию простого микрофлюидного устройства для простой оценки гемостаза (свертываемости крови): каналы на чипе пересекают полоску коллагена, на которой образуются тромбоподобные структуры.
Татьяна Ведехина (ФНКЦ физико-химической биологии ФХМ ФМБА России) рассказала о белковых микрочипах, несущих белки коронавируса SARS-CoV-2, для профилирования антительного ответа. Перспективными себя показали нуклеокапсидный белок и рецептор-связывающий домен S-белка; авторы получили интересные результаты как для переболевших коронавирусной инфекцией, так и для привитых российскими вакцинами «Спутник V» и «Ковивак».
Заключительный доклад д.ф.м.н. Андрея Сарычева, главного научного сотрудника ФГБУ Института теоретической и прикладной электродинамики РАН, был посвящен детекции белков и вирусов методом гигантского комбинационного рассеяния (Surface-enhanced Raman spectroscopy, SERS). Усиление комбинационного рассеяния молекул, адсорбированных на металлических наноструктурированных поверхностях, настолько значительно, что позволяет обнаруживать единичные молекулы.
778
0
До старта конференции «Молекулярная диагностика 2021» остается чуть больше недели. В рамках конференции состоится выставка, на которой будут представлены ведущие биотехнологические компании. Не упустите свой шанс забрать тестовый образец реагентов на стенде «Биолабмикс»!
Заполните форму по ссылке и получите реагенты на «Молекулярной диагностике 2021», у представителя «Биолабмикса» в Санкт-Петербурге или курьерской доставкой до адреса.
Вся продукция компании представлена в каталоге.
По всем вопросам пишите на svt@biolabmix.ru
724
0
Ученые из Австралии сравнили три популярных протокола для полногеномного секвенирования SARS-CoV-2 в образцах с низкой вирусной нагрузкой. Оценивали чувствительность, специфичность и способность детектировать варианты, встречающиеся с низкой частотой. Результаты опубликованы в журнале Journal of Clinical Microbiology.
Авторы сравнили протоколы ARTIC v3, Respiratory Virus Oligo Panel (RVOP) и long-amp (pooled long-amplicon method). Секвенировали семь клинических образцов при серийном разведении. RVOP и long-amp хуже работают при низких вирусных нагрузках и низком качестве РНК, чем ARTIC v3. Чувствительность и покрытие ARTIC v3 можно повысить, модифицируя протокол. RVOP детектировал больше всего низкочастотных вариантов, однако некоторые из них оказались артефактами.
Авторы заключают, что ARTIC v3 — самый чувствительный и эффективный с точки зрения затрат протокол. Он лучше подходит для выявления вариантов, встречающихся с низкой частотой и для работы с образцами с низкой вирусной нагрузкой.
981
0
«Биолабмикс» — это биотехнологическая компания, производящая киты для выделения нуклеиновых кислот из различных образцов, ПЦР-наборы и другие реагенты для молекулярной биологии. Головной офис «Биолабмикса» находится в Новосибирске, однако в связи с расширением географии продаж компания открывает вакансии в других городах. В настоящее время открыта вакансия регионального представителя в Москве. Подробнее об условиях труда и требованиях к соискателям — на PCR.news.
