Подходы к поиску лекарственных мишеней важно комбинировать между собой

Для идентификации генов-мишеней лекарственных препаратов используют разные подходы: полногеномный поиск ассоциаций (GWAS), варианты анализа локусов количественных признаков (QTL), секвенирование экзомов или различные комбинации этих методов. Ученые из Швейцарии и Нидерландов сравнили эффективность современных методик поиска мишеней на 30 клинически значимых признаках.

Наиболее эффективным подходом для поиска лекарственных мишеней принято считать GWAS, однако авторы работы показали, что альтернативные варианты также представляют ценность для выявления механизмов заболеваний и потенциальных терапевтических мишеней. Важно понимать, что методы GWAS и QTL-GWAS фокусируются на распространенных генетических вариантах, тогда как полноэкзомное секвенирование учитывает только редкие варианты с частотой минорных аллелей менее 1 %.

Исследователи проанализировали списки генов, ассоциированных с заболеваниями по данным каждого из подходов, а затем оценили, насколько значимо эти списки обогащены лекарственными мишенями. После учета различий в размере выборки и количестве тестируемых генов для каждого метода авторы пришли к выводу, что GWAS превосходит eQTL-GWAS и pQTL-GWAS, но не экзомный подход, в определении лекарственных мишеней. Полученные результаты подчеркивают потенциальную важность комбинирования подходов — варианты QTL для понимания механизмов заболеван ий, полноэкзомное секвенирование для поиска редких ассоциаций или GWAS при недостатке данных QTL.

Добавить в избранное

Вам будет интересно