Меню
Все темы
Полногеномные последовательности распространенных на территории России изолятов M. pneumoniae выложили в открытый доступ
По данным Роспотребнадзора, в 2023 году в Москве был отмечен рост заболеваемости пневмонией, вызванной Mycoplasmoides pneumoniae. Показатель заболеваемости составил 48,75 на 100 000 населения, что в 12,8 раза выше, чем в 2022 году. Чаще всего болели дети. Изучение молекулярно-генетических особенностей и эволюции этих патогенных микроорганизмов в настоящее время особенно актуально. Однако для этого нужны полногеномные последовательности M. pneumoniae, а их количество крайне ограничено. Данные о геномах изолятов M. pneumoniae, циркулирующих на территории России, в открытых источниках до недавнего времени отсутствовали. Специалисты из ФГБУ ЦСП ФМБА России и коллабораторы получили полногеномные последовательности изолятов M. pneumoniae, актуальных для России, аннотировали их и изучили молекулярно-генетические характеристики.
Клинический материал был получен от педиатрических пациентов, поступивших в инфекционное отделение ГБУЗ «ДГКБ №9 им. Г.Н. Сперанского ДЗМ». Для трех образцов удалось получить культуры патогена, для двух — чистые культуры M. pneumoniae. Одна из культур содержала небольшое количество микоплазмы другого вида — M. salivarium, комменсала полости рта. Для каждого из трех образцов была получена полная последовательность кольцевых геномов M. pneumoniae. Теперь они доступны в базе данных NCBI GenBank. Авторы построили филогенетическое дерево с использованием геномных данных M. pneumoniae из открытых источников.
В геномах всех трех изолятов авторы выявили факторы вирулентности, типичные для M. pneumoniae: ген mgpA адгезина P1 подтипа 1, а также адгезинов p40/p90, p200, ген p30/p32, ген мембранного белка p65; гены внутренних компонент органеллы прикрепления hmw, hmw2, hmw3; и ген CARDS токсина MPN372. У одного изолята имелась редкая аминокислотная замена адгезина P1 179E>K, которая встречается лишь в пяти известных изолятах. У двух других изолятов была обнаружена замена 1239Q>E, не описанная ранее и приводящая к изменению заряда функциональной группы. В статье также детально описана методика культивирования M. pneumoniae.
Вам будет интересно
303
0
Известно, что недостаток сна ослабляет иммунную систему. Теперь исследователи из США показали, что этот эффект может быть опосредован изменениями в микробиоте. Эти изменения способствуют прогрессированию рака, нарушают циркадные ритмы и снижают эффективность химиотерапии. Результаты представлены на ежегодном собрании Американской ассоциации исследований рака в Сан-Диего.
Последствия длительного недостатка сна авторы проследили на мышиных моделях. Они собрали образцы кала у мышей, которым не давали спать, и трансплантировали их здоровым мышам, чья микробиота была уничтожена. Исследователи измерили рост опухоли и реакцию на 5-фторурацил, наиболее распространенный химиотерапевтический препарат. Они обнаружили, что у мышей, получивших микробиоту недосыпающих, наблюдалось более значительное прогрессирование рака. Химиотерапевтический препарат был менее эффективным, а количество иммунных клеток в микроокружении опухоли было снижено. Также была нарушена регуляция генов циркадных ритмов.
Хорошая новость состоит в том, что микробиоту можно изменить, поменяв образ жизни. В долгосрочной перспективе, возможно, появятся новые способы сбалансировать микробиоту, например, таргетное лекарство.
292
0
Журнал Beneficial Microbes открыл прием рукописей в спецвыпуск «Beneficial Wildlife Microbes», посвященный полезным микроорганизмам диких животных. Приглашаются авторы работ по выделению и характеристике таких микроорганизмов, разработке и испытанию пробиотиков и других подходов к модуляции микробиома, а также исследования микробных сообществ диких животных и их связи со здоровьем.
Журнал включен в Белый список (уровень 1), Colab. IF 3.1, Scopus/WoS Q2.
1081
0
Исследователи из США представили дезинфицирующий гель для рук, высвобождающий оксид азота (NO). По эффекту он сравним со спиртосодержащими дезинфицирующими средствами, но при этом сохраняет противомикробное действие в течение двух часов. В гель, который назвали NORel, входят также этанол, масло чайного дерева и глицерин.
NORel уничтожил более 97% бактерий и грибков, включая штаммы, устойчивые к антибиотикам, в опытах in vitro и ex vivo. В экспериментах с бактерией S. aureus, нанесенной на кожу кролика, гель был сравним с коммерческими продуктами, содержащими 62% этилового спирта, но сохранял защитное действие долгое время после того, как спирт улетучивался. В дальнейшем авторы планируют проверить действие NORel против вирусов, таких как SARS-CoV-2, а также продлить срок хранения.
878
0
Спорная статья была опубликована в 2010 году. Фелиса Волф-Саймон из Геологической службы США, работая по гранту NASA, вместе с коллегами выделила из образцов калифорнийского озера Моно, вода которого содержит высокие концентрации мышьяка, бактерию, получившую наименование GFAJ-1. Анализ гена рибосомной 16S РНК показал, что она принадлежит к роду Halomonas, однако авторы статьи в Science сообщали, что в ее ДНК вместо фосфатов якобы содержатся арсенаты AsO43–. Этот сенсационный результат сразу же был подвергнут жесткой критике. В частности, канадский микробиолог Розмэри Редфилд исследовала культуру GFAJ-1 и убедительно доказала, что мышьяка в ДНК бактерии нет.
Тем не менее статью отозвали только сейчас. Главный редактор Science Холден Торп объясняет, что в те годы журнал отзывал в основном статьи, нарушающие этические нормы, однако сейчас могут быть отозваны и статьи, основные выводы которых не подтверждаются экспериментами. Это формальное действие особенно важно в связи с ростом популярности инструментов на основе ИИ.
Авторы статьи заявили, что считают отзыв необоснованным: «Хотя наша работа могла быть написана и обсуждена более тщательно, мы считаем верными представленные данные».
В феврале 2025 года The New York Times опубликовала статью о Фелисе Волф-Саймон, карьера которой сильно пострадала после истории с мышьяковой ДНК: сейчас она получила краткосрочное финансирование для проведения новых исследований. После этого полемика вокруг статьи 2010 года возобновилась.
1054
0
Связь кишечной микробиоты с депрессивными состояниями изучается все активнее. Теперь ученые из Китая и США обнаружили ассоциацию между депрессией и разнообразием микробиома ротовой полости — второго по величине микробного сообщества организма после кишечника.
Авторы статьи в BMC Oral Health провели кросс-секционный анализ по данным Национального исследования здоровья и питания (NHANES, 2009–2012 годы). В него включили 15 018 участников средним возрастом около 42 лет. У них профилировали микробиом ротовой полости при помощи секвенирования генов 16S рибосомальной РНК. По этим данным ученые оценивали альфа- и бета-разнообразие микробного сообщества (видовое разнообразие в нем самом и по сравнению с другими микробиомами). Также исследователи оценили выраженность депрессивных симптомов у участников по шкале PHQ-9. Оказалось, что альфа-разнообразие отрицательно коррелировало с депрессией, то есть интенсивность депрессивных проявлений была связана с низким разнообразием микроорганизмов во рту. Механизмы, объясняющие такую связь, еще предстоит выявить.
