За время пандемии COVID-19 неоднократно появлялись сообщения об обнаружении РНК SARS-CoV-2 в сточных водах. Во многих населенных пунктах сточные воды сливаются напрямую в природные водоемы. Так происходит и в столице Эквадора, городе Кито. В базе medRxiv размещен
препринт эквадорских ученых об анализе проб речной воды в черте Кито на наличие РНК SARS-CoV-2. Пробы были отобраны 5 июня 2020 года, в период пика вспышки COVID-19 в этом городе, в трех районах города. ПЦР-анализ проводился с использованием наборов праймеров
N1 и N2 к
участкам генома SARS-CoV-2. Помимо этого оценивалось качество воды по нескольким параметрам. Ученые обнаружили сильное антропогенное
загрязнение речной воды, в том числе человеческими фекалиями. РНК коронавируса
была обнаружена во всех пробах. Авторы сопоставили ее концентрацию с числом зарегистрированных
к моменту отбора проб случаев COVID-19 в каждом районе и предположили, что реальное
количество больных коронавирусной инфекцией в городе было значительно выше.
Результаты работы говорят о потенциальной возможности распространения SARS-CoV-2 с
загрязненной пресной водой в странах с низким уровнем переработки сточных вод.
Вариант XDV.1 начал преобладать в Китае еще в июле,
отмечает австралийский специалист по визуализации данных Майк Хани. (Важно обратить внимание, что в летние месяцы было исследовано меньше образцов.) К началу августа общая частота его встречаемости в мире составляла
единицы процентов. Однако в Китае она превысила 50%.
Данные Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний (China CDC), опубликованные на прошлой неделе,
показали, что в июле было зарегистрировано в общей сложности 7042 случая заражения COVID-19 внутри страны — на 767 случаев больше, чем в предыдущем месяце. Рост числа случаев, вызванных XDV.1 и KP.2, не сопровождался увеличением числа тяжелых заболеваний.
XDV — продукт рекомбинации XDE (который сам является рекомбинантом GW.5.1 и FL.13.4) с JN.1. Линия XDV.1 также содержит мутацию в гене S-белка, вызывающую замену F456L, — та же мутация есть у вариантов FLip, FLiRT and FLuQE.
Всего 363 человека (средний возраст 52,4 года) приняли участие в исследовании. Они получали мРНК-вакцину от Pfizer-BioNTech или Moderna. Те, кто испытывал семь или более симптомов после второй дозы вакцины, имели почти в два раза больше нейтрализующих антител, чем те, кто не испытывал никаких симптомов.
Еще 40% участников носили устройство, которое считывало их температуру. У тех, у кого температура поднялась на один градус после второй дозы, спустя шесть месяцев уровень нейтрализующих антител был в три раза выше по сравнению с теми, у кого температура не выросла. Как
отмечают авторы, отсутствие симптомов не означает, что вакцина не сработала.
Исследователи из Университета штата Пенсильвания под руководством Курта Вандегрифта поставили перед собой амбициозную
задачу — выяснить, как SARS-CoV-2 распространяется среди диких животных Северной Америки и как эволюционирует в новых хозяевах. Они планируют собрать 24 000 образцов у 58 видов в течение следующих двух лет. Для этой работы им был выдан грант в 4,5 млн долларов от Министерства сельского хозяйства США. Искать будут не только вирус, но и антитела к нему — признаки перенесенных инфекций.
Конечно, эту задачу нельзя выполнить силами одной команды. Сотрудники природоохранных программ Калифорнии и Аляски пришлют образцы лис, медведей, кроликов, бобров и лосей. Охотники по всей стране согласились помочь в сборе образцов койотов, рысей и других животных. Компании по борьбе с вредителями готовы предоставить опоссумов, крыс, енотов и скунсов из десяти городов. Центры реабилитации животных передадут образцы белохвостых оленей, землероек, ласок и белок. Команда Вандегрифта собирается самостоятельно отлавливать полевок, сурков, бурундуков и дикобразов.
Случаи коронавирусной инфекции описаны не менее чем для 50 видов животных, в основном домашних питомцев, животных в зоопарках и на фермах. Отслеживать вирус в дикой природе намного сложнее. Однако. как показал пример белохвостых оленей, возможно не только заражение диких животных, но и передача вируса внутри популяции, а также обратное заражение человека. Эта работа поможет определить, в каких видах коронавирус персистирует и эволюционирует. Ученые надеются получить данные о многих видах в течение ближайших месяцев.
Авторы опросили 5112 жителей штата Квинсленд с симптомами респираторного заболевания с 29 мая по 25 июня 2022 года: у 2399 диагностировали COVID-19, у 995 — грипп, еще у 1718 — ни то, ни другое. Через год, в мае и июне 2023 года, участников снова спросили об их симптомах. Всего 16% (834 из 5112) участников продолжали испытывать симптомы болезни, у 3,6% (184 человек) они мешали им в повседневной жизни. Анализ показал, что люди, пережившие COVID-19, испытывали такие симптомы не чаще, чем пережившие другую болезнь (3% против 4,1%), включая грипп (3,4%).
Авторы призывают больше внимания уделять всем «послевирусным» синдромам. «Более того, мы считаем, что пора перестать использовать такие термины, как “долгий ковид”. Они дают ошибочное представление, что в долгосрочных симптомах, связанных с этим вирусом, есть что-то уникальное и исключительное. Эта терминология может вызвать ненужный страх, а в некоторых случаях и чрезмерную настороженность к длительным симптомам, которая может затруднить выздоровление», — сказал Джон Геррард, главный санитарный врач Квинсленда.
Исследователи проанализировали 717 образцов от 295 пациентов с COVID-19 и показали, что количество ферментативно активного растворимого ACE2 повышалось в 2–10 раз (до 1 мкг/мл) у пациентов с умеренным и тяжелым COVID-19. Уровень растворимого ACE2 отрицательно коррелировал с количеством нейтрализующих антител (способных взаимодействовать с рецепторсвязывающим мотивом) при тяжелом протекании COVID-19. В опытах in silico авторы показали, что растворимый ACE2 нарушает формирование герминативного центра (зоны фолликула периферической лимфоидной ткани, в которой пролиферируют В-лимфоциты) и подавляет выработку высокоаффинных антител. То есть ACE2 маскирует важнейший вирусный эпитоп от B-клеток и таким образом вмешивается в формирование нейтрализующих антител. Исследователи считают, что растворимый рецептор подавляет иммунитет при коронавирусной инфекции.
Это исследование разительно контрастирует с предыдущими, в которых растворимый ACE2 использовали для терапии COVID-19. Растворимая форма рецептора «соревнуется» с клеточными рецепторами и отвлекает на себя часть S-белков коронавируса. Ученые создавали инженерный белок ACE2, который связывается с S-белком SARS-CoV-2 эффективнее природного ACE2, а также доставляли растворимый ACE2 в виде мРНК. Однако
клиническое испытание не показало снижения виремии.