Утренний кофе. Бактерия против открытых ран

Канадские исследователи опросили 1082 студентов о том, как как они спят, и считают ли они, что пища, которую они едят на ночь, влияет на качество сна. Около 40% участников ответили, что поздние перекусы или какой-то определенный тип еды влияет на их сон, около 25% считают, что некоторые продукты заставляют их хуже спать. Большинство упоминало сладости, острые и молочные продукты. При анализе состояния здоровья опрошенных ученые обнаружили, что непереносимость лактозы была ассоциирована с худшим качеством сна и кошмарами. Они предположили, что употребление молочных продуктов при наличии непереносимости приводит к дискомфорту, который влияет на сон. Подробнее. 

Исследователи из США и Израиля проанализировали, как жара влияет на выработку молока коровами в Израиле на данных за 12 лет. Они также опросили 300 фермеров об эффективности применяемых ими методов охлаждения. Оказалось, что один день экстремальной жары может снизить выработку молока на 10%, а эффект сохраняется 10 дней и более. Молочные фермы Израиля одни из самых технологичных в мире, но даже в таких условиях фермеры считают, что современные методы охлаждения коровника недостаточно эффективны. Подробнее.

Грибы в почве влияют на рост растений; информация об их наличии и качестве может быть важной для принятия решений в сельском хозяйстве. Для поиска и идентификации микроорганизмов используют как оптические микроскопы, так и современные технологии, включая анализ ДНК. Но современные методы дороги и в первую очередь оценивают химический состав, а не сложную биологическую систему почвы. Исследователи из США обучили искусственный интеллект детектировать грибы по микрофотографиям образцов почвы. Их программа работает с доступными во многих микроскопах увеличениями 100x и 400x. Ученые планируют собрать роботизированную платформу, которая будет способна собирать и анализировать образцы почвы автоматически. Доклад на эту тему будет представлен на конференции Гольдшмидта в Праге 9 июля. Подробнее. 

Амброксол — популярный в Европе препарат против кашля — может помочь бороться с деменцией, вызванной болезнью Паркинсона. Таковы результаты небольшого клинического испытания канадских ученых, длившегося 12 месяцев при участии 55 человек. Препарат хорошо переносился в высоких дозах, он стабилизировал психиатрические симптомы и уровни маркера повреждения мозга. Примечательно, что в самой Канаде применение амброксола как препарата от кашля не одобрено. Подробнее. 

Точное измерение уровня натрия в крови необходимо для диагностики и лечения таких состояний, как обезвоживание, заболевания почек и некоторые неврологические и эндокринные расстройства. Исследователи из США разработали систему оптоакустической терагерцовой спектроскопии для долговременного неинвазивного мониторинга уровней натрия в крови. Терагерцовое излучение, которое находится между микроволнами и средней инфракрасной областью электромагнитного спектра, идеально подходит для биологических применений, поскольку оно не наносит вреда тканям, рассеивается меньше, чем ближний инфракрасный и видимый свет, и чувствительно к структурным и функциональным биологическим изменениям. При помощи оптоакустики ученым удалось преодолеть ограничения, связанные с обнаружением одного элемента в сложной биологической смеси и с глубиной тканей. Подробнее. 

Бейтсовская мимикрия, когда безобидный вид маскируется под ядовитый или несъедобный, — классический пример адаптации. Но почему мимикрия, которая защищает от хищника, не эволюционировала до совершенства? Авторы статьи в Nature провели эксперименты с макетами ос, напечатанными на 3D-принтере, и пришли к выводу, что точность связана с восприятием хищника. Птицы обращали внимание на тонкие детали, отличающие ядовитое насекомое от безобидного, тогда как других хищников (в основном беспозвоночных, например, богомолов и пауков) обмануть намного проще. Это объясняет, почему неточная мимикрия сохранилась в ходе эволюции. Подробнее

Ванильный ароматизатор широко используется в пищевой промышленности, фармацевтике и косметике. Основной природный источник этой ароматической добавки — Vanilla planifolia — культивируемое растение, однако дикие виды представляют собой генетический резервуар, важный для культурной ванили. При этом ваниль уязвима к переменам климатических условий. Ученые смоделировали два вероятных сценария изменений климата и пришли к выводу, что в будущем ареалы обитания 11 видов ванили и семи видов их опылителей могут разойтись в пространстве. Такое разобщение ставит популяции дикой ванили под угрозу. Подробнее

Растениям важно чувствовать, как меняется температура окружающей среды. Механизм, обеспечивающий термочувствительность в ночное время, уже описан, но высокие температуры могут возникать и днем. Авторы статьи в Nature Communications проверили, могут ли уже описанные термосенсоры — фитохром B (phyB) и ELF3 — работать и при освещении. Оказалось, что при слабом свете phyB и ELF3 контролировали реакцию на дневные изменения температуры, однако при высокой интенсивности освещения участие phyB становилось незначительным. Важную роль в регуляции их активности играет сахароза, которая выделяется при распаде крахмала в ответ на нагрев и вмешивается в phyB-зависимый механизм как антагонист этого компонента системы термочувствительности. Подробнее

Ученые из Скриппсовского океанографического института разработали подводный микроскоп для мониторинга фотосинтеза в кораллах in situ. Созданное устройство получило название Benthic Underwater Microscope imaging PAM (сокращенно BUMP). Оно позволяет с почти микронным пространственным разрешением регистрировать хлорофилл a в разных режимах (в том числе флуоресцентном). Предполагается, что дайверы будут погружаться с таким микроскопом, чтобы в природных условиях детально изучать структуру и эффективность фотосинтеза населяющих кораллы водорослей — это нужно для выяснения причин обесцвечивания кораллов. Подробнее

О первом полногеномном секвенировании древнего египтянина сообщают авторы статьи в Nature. Скелет принадлежал взрослому мужчине; возраст находки — 2855–2570 гг. до нашей эры (на это указал радиоуглеродный анализ). Он был извлечен из керамического горшка в скальной гробнице — такой способ захоронения мог способствовать сохранению ДНК и дал возможность впервые провести анализ древнеегипетских останков. В геноме преобладали варианты, унаследованные от неолитического населения Северной Африки, однако около 20% содержат следы происхождения из восточной части Плодородного полумесяца (в том числе Месопотамии). Это указывает на то, что контакты между этими территориями могли включать в себя миграцию людей, хотя для детального понимания необходимо больше древнеегипетских геномов. Подробнее

Работы над созданием синтетических геномов эукариот продолжаются — в 2023 году в рамках проекта Synthetic Yeast Project был получен почти полный набор хромосом дрожжей Saccharomyces cerevisiae, а одной из новых задач стало создание генома человека. «Синтетический геном человека» (SynHG) — это пятилетний многоцентровый проект, в котором участвуют исследователи из университетов Кембриджа, Кента, Манчестера, Оксфорда и Имперского колледжа Лондона. Его руководитель говорит, что основная цель — расширить возможности медицины и найти принципиально новые подходы к терапии, хотя и не отрицает некоторых этических рисков. Подробнее

Статья в Nature Communications описывает новые комплексы органелл — гемифузомы (hemifusome), — обнаруженные в клетках человека методом криоэлектронной томографии. Это особые мембранные структуры, состоящие из частично слившихся везикул. Оказалось, что гемифузомы составляют до 10% везикулярных органелл на периферии клетки, но не участвуют в канонических путях эндоцитоза. По их морфологии и наличию везикул внутри авторы предполагают, что эти структуры служат платформами для биогенеза везикул. Подробнее

Специалист по биостатистике из Астонского университета рассказал о самых распространенных ошибках, с которыми он сталкивался как рецензент в научных журналах. Проанализировав более 200 статей, он опубликовал список из 10 ошибок при составлении научных публикаций, надеясь, что поможет будущим исследователям избежать их. В список вошли упоминания причинно-следственных связей в работах, которые показали только ассоциацию, смешение разных регрессионных моделей (например, с несколькими зависимыми переменными или с несколькими предикторами), а также несоблюдение структуры аннотаций в статье. Подробнее

Рептилиям необходимы внешние источники тепла, чтобы поддерживать функции организма, однако слишком высокая температура увеличивает риск обезвоживания. Ученые проанализировали популяции карликового синеязыкого сцинка (Tiliqua adelaidensis) — эндемичной ящерицы Австралии, находящейся под угрозой исчезновения. Они выяснили, что поведение северных и южных популяций различается — северные сцинки чаще предпочитали вылезать из нор на поверхность, но были активны только при достаточной влажности. Когда северных ящериц переселили южнее, в более мягкий климат, первое время они прятались в укрытиях и оставались требовательны к влажности, но спустя два года адаптировались. Авторы рассматривают переселение сцинков как способ спасти вид от вымирания. Подробнее

Полигенная адаптация, при которой отбор действует сразу на множество вариантов, — важный эволюционный механизм, но его трудно обнаружить. Авторы статьи в Science проанализировали, как менялся геном европейского ясеня (Fraxinus excelsior), который в последние десятилетия подвергался сильному давлению патогенного грибка Hymenoscyphus fraxineus. Они составили список из примерно восьми тысяч генетических вариантов, для которых обнаружились различия в частотах аллелей между молодыми и взрослыми деревьями. Моделирование показало, что под давлением патогена исчез 31% ювенильной популяции ясеня, а с ним и аллели, снижающие приспособленность в новых условияз. Иными словами, полигенная адаптивная микроэволюция произошла за одно поколение. Подробнее

Во сне животные наиболее уязвимы. Домашние кошки проводят в таком уязвимом состоянии 60–65% своей жизни — они спят в среднем 12–16 часов в сутки. По этой причине кошки предпочитают отдыхать на возвышенных местах, однако авторы статьи в Current Biology выяснили, что это не единственная защитная стратегия. Проанализировав 408 видеороликов со спящими кошками, ученые обнаружили асимметрию позы для сна — 65,1% кошек предпочитали спать на левом боку. Предположительно, это связано с асимметрией полушарий мозга. Если кошка спала на левом боку, то проснувшись, она будет воспринимать обстановку левым зрительным полем. Сигнал от него поступает в правое полушарие мозга, которое в большей степени контролирует обработку угроз и быструю координацию при бегстве. Исследователи делают вывод, что сон на левом боку может быть эволюционной стратегией выживания, хотя нельзя исключать и другие причины. Подробнее

Для утилизации пластика все чаще предлагают использовать микроорганизмы, однако его необходимо переработать в полезный продукт, а это пока затруднительно. В Nature Chemistry предложен способ модифицировать кишечную палочку (Escherichia coli), чтобы с ее помощью из полиэтилентетрефталата (ПЭТ) — распространенного материала упаковок — получать парацетамол. В штамм E. coli, лишенный возможности синтезировать пара-аминобензоат нормальным путем, внедрили систему получения этого жизненно важного метаболита из ПЭТ. Продуцируемый бактериями пара-аминобензоат затем использовался для синтеза пара-ацетиламинофенола, известного как анальгетик и жаропонижающее средство парацетамол. Подробнее

Лишайник из пустыни Мохаве три месяца выживал под воздействием солнечной радиации, которая ранее считалась смертельной. Интенсивное УФ-облучение — фактор, из-за которого многие открытые недавно экзопланеты считаются непригодными для жизни. Однако авторы статьи в журнале Astrobiology в течение трех месяцев непрерывно облучали пустынный лишайник Clavascidium lacinulatum 254-нм УФ-излучением мощностью 55 Вт/м². Это инактивировало около 50% клеток водоросли-фотобионта, но вторая их половина сохранила жизнеспособность и могла размножаться. При этом те же водоросли, выращенные в чистой культуре, погибали при таком облучении за 60 секунд; не выживала и радиационно-устойчивая бактерия Deinococcus radiodurans. Лишайник выжил благодаря тому, что накапливал в коре вторичные фенольные метаболиты и гасил активные формы кислорода, которые генерировались под жестким УФ-облучением. Подробнее

Глубоководная добыча полезных ископаемых мешает жизни китов — к таким неутешительным выводам пришли исследователи, которые оценили шумовое загрязнение в восточной части Тихого океана. Дельфины и киты, в том числе кашалоты, которые находятся под угрозой исчезновения, полагаются на акустические сигналы. Разработка морского дна, которая ведется в зоне их обитания, нарушает нормальную коммуникацию этих животных, а промышленный шум от нее распространяется на сотни километров. Ученые предупреждают о масштабных экологических последствиях и призывают еще раз оценить все риски. Подробнее

Где граница между минимальной клеткой и вирусной частицей? Ученые из Японии и Канады усомнились в ее существовании, когда обнаружили Candidatus Sukunaarchaeum mirabile. Эта архея с рекордно маленьким геномом подозрительно напоминает вирус — у нее имеется только 189 генов, которые кодируют в основном белки для репликации собственного генома. Все остальное архея «заимствует» у своего симбиотического хозяина — водоросли-динофлагеллята Citharistes regius. Сам геном содержит 238 тысяч пар оснований — меньше половины того, что считалось минимальным природным клеточным геномом до этого. В нем нет практически никаких компонентов известных метаболических путей, и ученые говорят, что такая тесная зависимость от хозяина ставит под сомнение функциональные различия между минимальной клеточной жизнью и вирусами. Подробнее

Коллективное поведение бывает важно для выживания организмов. Немецкие ученые описали такое поведение у C. elegans — эти нематоды собираются в живые «башни», чтобы цепляться к насекомым и перемещаться на них для распространения или в попытке покинуть неблагоприятные условия. Считалось, что они способны к такому поведению только в лабораторных условиях, но ученые нашли свидетельства формирования башен и в природе, на гниющих фруктах в саду. При этом нематоды не просто сбивались в кучу, а направленно строили структуры, способные реагировать на внешние стимулы. Подробнее

Виртуальную реальность (VR) уже используют для реабилитации после инсульта, однако данных об эффективности различных ее вариантов для тех или иных случаев по-прежнему недостаточно. Систематический обзор Кокрейновского сотрудничества показал, что интерактивные видеоигры несколько эффективнее альтернативных методов лечения для восстановления подвижности рук и равновесия после перенесенного инсульта. Более выраженный эффект наблюдался, когда виртуальная реальность дополняла обычное лечение. А вот о влиянии VR на походку и общее качество жизни пациентов однозначных выводов сделать не удалось. Подробнее

Устойчивые к антибиотикам бактерии рода Pandoraea могут вызывать оппортунистические респираторные инфекции, особенно у пациентов с муковисцидозом. Оказалось, они не только представляют опасность, но и производят мощные антибактериальные соединения — пандорабактины. Анализ генома этих бактерий выявил консервативный кластер генов, которые обеспечивают синтез двух связывающих железо молекул — пандорабактинов А и B. Эти соединения позволяют бактериям активно поглощать железо из окружающей среды, чтобы выживать в легких человека, где железа немного, и отбирать этот микроэлемент у бактерий-конкурентов. Анализ мокроты пациентов с муковисцидозом показал, что Pandoraea spp. изменяют микробиоту легких при этом заболевании, в том числе вытесняя патогены родов Pseudomonas, Mycobacterium и Stenotrophomonas. Подробнее

Кислый вкус, как правило, непривлекателен для млекопитающих, вероятно, из-за ассоциации с незрелыми или испорченными фруктами. Однако птицы гораздо более толерантны к кислому, и авторы статьи в Science выяснили, почему. Рецептор отопетрин 1 (OTOP1) у птиц реагирует на кислоту иначе, чем у млекопитающих, — он ингибируется кислой средой. Активация канареечного аллеля OTOP1 у модельных мышей привела к тому, что мыши утратили отвращение к кислому вкусу. Мутация, связанная с этой особенностью, консервативна для всех певчих птиц, и, по-видимому, за время эволюционного развития позволила им разнообразить источники пищи. Подробнее

Бабочки-совки Agrotis infusa — эндемичный вид для Австралии. Каждую весну они перелетают на тысячу километров, чтобы спастись от жары, а осенью совершают обратную миграцию для размножения. Считалось, что направление они определяют по магнитному полю, однако авторы статьи в Nature показали, что важную роль также играет звездное небо. Поместив весенних и осенних бабочек в симулятор полета и обнулив магнитное поле, ученые выяснили, что мотыльки выбирают направление по изображению ночного неба. Зрительные интернейроны специфично реагировали на расположение звезд, ориентируя миграцию бабочек-совок в соответствии с сезоном. В сочетании с чувством магнитного поля это обеспечивает надежную систему для ночной навигации бабочек. Подробнее