В Стэнфорде прочитали последовательность мРНК вакцин против коронавируса

Эндрю Файр и Масса Шура из Стэнфорда с коллегами секвенировали РНК в составе вакцины Moderna, последовательность опубликовали на GitHub. Авторы исследования поясняют, что не потратили ни одной дозы вакцины, а взяли оставшиеся капли на дне флаконов из пунктов вакцинации Стэндфордского университета и Министерства по делам ветеранов США. По словам Шуры и Файра, FDA разрешило им получить эти остатки и одобрило решение опубликовать последовательность. Ответа от Moderna исследователи не получили.

РНК фрагментировали нагреванием до 94°C, праймировали случайными адапторами с гексамерными хвостами, амплифицировали с помощью Takara SMARTerer Stranded RNA-seq kit и секвенировали на MiSeq (Illumina). 

Последовательность мРНК вакцины BioNTech/Pfizer была опубликована ранее и обсуждалась. Чтобы убедиться в точности полученных данных, секвенировали и ее тоже.

РНК в составе вакцин одноцепочечная: двухцепочечная РНК вызывает нежелательные неспецифические эффекты. Большинство полученных ридов для обеих вакцин относилось к ожидаемой смысловой цепи РНК; присутствие незначительного количества ридов антисмысловой нити, скорее всего, не связано с присутствием дцРНК в вакцинах и нуждается в дальнейших исследованиях.

Авторы особо подчеркивают, что цель этой работы — не воспроизведение вакцины Moderna в «гаражных» условиях, а обеспечение доступа к последовательности в образовательных и научных целях — например, чтобы была возможность отличить последовательность РНК вакцины от вирусной РНК. В любом случае, вакцина содержит, помимо РНК, и другие важные компоненты.

Добавить в избранное

Вам будет интересно