В сточных водах Нью-Йорка нашли фрагменты генома неизвестной линии SARS-CoV-2

Команда под руководством ученых из Куинс-колледжа Городского университета Нью-Йорка обнаружила в сточных водах Нью-Йорк-Сити геномные последовательности, которые не соответствуют ни одной известной линии коронавируса SARS-CoV-2.

Авторы проводили глубокое секвенирование кодирующей последовательности рецепторсвязывающего домена S-белка SARS-CoV-2 и обратили внимание на загадочные линии SARS-CoV-2, которые отсутствуют в базе данных GISAID. Эти линии содержат мутации, редко встречающиеся в клинических образцах, например Q493K, Q498Y, E484A и T572N, а также имеют много общих мутаций с омикроном. Некоторые из мутаций расширяют тропность псевдовирусов, имеющих подобный S-белок: такие псевдовирусы могут инфицировать клетки не только с человеческим, но и с мышиным или крысиным рецептором ACE2. Кроме того, эти псевдовирусы устойчивы к нейтрализующим моноклональным антителам.

Источником криптической линии может быть как инфицированный человек, так и животное, например крыса. Сомнительно, что загадочный вирус может представлять опасность для людей, поскольку он циркулирует в течение как минимум года. Как сообщили исследователи The New York Times, эта линия неоднократно обнаруживалась на нескольких очистных сооружениях, и они обратились с запросами в медицинские учреждения этих районов, но ответов не получили.

«На сегодня мы не видели этих вариантов у пациентов в Нью-Йорке», — сказал Майкл Ланца, представитель Департамента здравоохранения и психической гигиены Нью-Йорка. Однако аналогичные последовательности были найдены в одном из калифорнийских канализационных стоков, сказала Роуз Кантор, микробиолог из Калифорнийского университета в Беркли.


Добавить в избранное

Вам будет интересно