В Японии предложен новый способ детекции коронавируса в сточных водах

Эпидемиология, основанная на анализе сточных вод (wastewater-based epidemiology, WBE), помогает отслеживать распространение SARS-CoV-2 в популяциях. Особенно важно, что и бессимптомные люди выделяют вирус, который может детектироваться в стоках. Однако чувствительность анализа не так высока, как хотелось бы. Ученые из Университета Хоккайдо и компании Shionogi & Co, Ltd. разработали простой, быстрый и высокочувствительный метод обнаружения SARS-CoV-2 в сточных водах, который назвали EPISENS-S.

Во время пандемии COVID-19 в Японии было самое низкое число случаев заболевания на душу населения, низкой была и нагрузка в сточных водах. Но авторы показали в предыдущей работе, что коронавирус связывается с твердыми частицами, и в дальнейшем изучали твердую фазу. Метод EPISENS-S включает центрифугирование проб сточных вод и выделение из осадка тотальной РНК; затем проводится обратная транскрипция для получения кДНК. В контрольном наборе образцов концентрировали вирус с помощью осаждения полиэтиленгликолем, затем проводили экстракцию РНК и обратную транскрипцию (метод анализа, распространенный в Японии сейчас). ДНК, полученную каждым из этих способов, амплифицировали с помощью количественной ПЦР. EPISENS-S оказался примерно в 100 раз чувствительнее.

Метод может быть адаптирован для отслеживания других вирусных заболеваний с низким числом инфекций и низкой вирусной нагрузкой, подчеркивают авторы.

Добавить в избранное

Вам будет интересно