Секвенирование генома египтянина периода Древнего царства подтвердило связи Египта с Ближним Востоком

Исследователи из Великобритании секвенировали полный геном египтянина, жившего 4500–4800 лет назад. Его останки были помещены в керамический сосуд и находились в скальной гробнице. Как выяснилось, такой способ погребения благоприятствует сохранности ДНК.

Древнее царство (2686–2125 гг. до н. э.) — период в истории Древнего Египта, который последовал за объединением Верхнего и Нижнего Египта. Это было централизованное аграрное государство, с неограниченной властью монарха и разветвленным аппаратом управления. Об истории и культуре этого периода — «эпохи строительства пирамид» — известно многое, но генетические характеристики жителей Древнего царства до сих по не были получены. Частично секвенированы ядерные геномы лишь трех древних египтян, и все они жили позднее 1000 года до н.э. Проблемой остается плохая сохранность ДНК в жарком климате Египта. Хотя первые (и не особенно удачные) попытки выделить ДНК из останков древних людей Сванте Паабо сделал еще в 1980-х гг. именно с египетской мумией, полных геномов жителей Древнего Египта получить не удавалось.

Считается, что население Древнего Египта происходило от местного населения, имевшего культурные связи с ближневосточными популяциями. Такие важные технологии, как гончарный круг, вероятно, пришли в Египет из Месопотамии, письменность возникла в том и другом регионе одновременно. Остается неясным, было ли проникновение инноваций в Египет чистой «культурной диффузией» или же оно было связано с миграциями людей.

Новый секвенированный геном принадлежит мужчине, который, по данным радиоуглеродного анализа, жил между 2855 и 2570 гг. до н. э., то есть в конце Раннего царства либо в начале Древнего. Его останки были запечатаны в керамическом сосуде, который поместили в скальную гробницу в Нувайрате (примерно 260 км к югу от Каира). Люди, захороненные в гробницах, обустройство которых требовало значительных ресурсов, могли принадлежать к высокому социальному классу, предполагают авторы. Материальная культура захоронения соответствует датировке (Третья или Четвертая династии, самые ранние этапы Древнего царства).

Скелет мужчины нашел в начале ХХ века археолог Джон Гарстанг из Ливерпульского университета; полевые работы финансировал Комитет по раскопкам Бени-Хасан. Наиболее значимые артефакты Египетская служба древностей резервировала для музея в Каире, но эта находка была передана Ливерпульскому университету, а с 1950 года скелет мужчины хранился в музее Ливерпуля. Благодаря сделанным на месте фотографиям (негативы на стеклянных пластинах) сейчас есть возможность реконструировать археологический контекст находки.

 Скальные гробницы в Нувайрате. Credit: Nature (2025). DOI:  10.1038/s41586-025-09195-5 |  CC BY 4.0

Керамический сосуд, в котором были обнаружены останки человека.

Возраст индивида из Нувайрата оценивается в 44–64 года, с учетом изношенности зубов и признаков возрастного остеоартрита вероятнее верхняя граница. Он был небольшого роста — до 160 см. Палеопатологические данные указывают на то, что человек долгое время занимался физическим трудом — это противоречит «элитарности» захоронения. Не исключено, что он был гончаром: результаты анализа нагрузок соответствуют древнеегипетских изображений этого ремесла.

ДНК получали из семи образцов зубной ткани. Две из семи библиотек выбрали для дальнейшего анализа. Авторы использовали специальные методы для восстановления и секвенирования ультракоротких, сильно деградированных фрагментов древней ДНК и в итоге получили около 8,3 млрд прочтений с признаками подлинной древней ДНК. Геном был секвенирован с двукратным покрытием.

Прогнозирование фенотипических признаков на основе анализа генома может давать ошибки в малоизученных популяциях, но есть основания предположить, что у человека из Нувайрата были карие глаза, каштановые волосы и достаточно темная кожа. Генетические данные также подтверждают его принадлежность к мужскому полу, установленную по строению скелета.

Авторы статьи сравнили полученные данные с геномами 3233 современных и 805 древних людей. Моделирование происхождения индивида указывало на то, что большая часть генома из Нувайрата содержит генетические варианты, характерные для неолитического населения Северной Африки (80%). Но присутствовал и второй предковый компонент: около 20% генома лучше всего соответствовали неолитическим геномам из восточной части Плодородного полумесяца (древней Месопотамии).

Таким образом, генетические данные дополняют существующие археологические свидетельства взаимного влияния между этим регионом и Египтом. Теперь можно предположить, что контакты не ограничивались обменом предметами культуры и технологиями, но также включали миграцию людей.

Хотя не очевидно, что человек из Нувайрата был типичным представителем популяции, это открытие — существенный шаг вперед в понимании генетических особенностей Египта периода Древнего Царства. Кроме того, данная работа показала, что останки из керамических сосудов могут содержать качественную ДНК.

Анализ древней ДНК опроверг гипотезу «экологического самоубийства» жителей острова Пасхи