Впервые исследованы геномы людей из черноморской древнегреческой колонии

Российские генетики из Университета «Сириус» и Института общей генетики РАН (группа под руководством академика РАН Евгения Рогаева) провели палеогеномное исследование двух индивидов из захоронения эллинистического типа в Фанагории. Статья с результатами работы вышла в сборнике «Краткие сообщения Института археологии».

Фанагория — древнегреческая колония, располагавшаяся на берегу Керченского пролива, на Таманском полуострове. Ее основание в VI веке до н.э. связывают с греческими переселенцами с территории Малой Азии. В начале IV века до н.э. Фанагория вошла в состав Боспорского царства, стала его второй столицей, а к началу нашей эры — наиболее значительным политически и экономически городом. Как формировалось население Фанагории при ее основании, до сих пор окончательно не выяснено, поскольку греческие переселенцы прибыли на территорию, где обитали местные племена: скифы, меоты, сарматы, синды и, очевидно, с ними взаимодействовали. На вопросы о происхождения фанагорийцев мог ответить палеогеномный анализ.

Генетики исследовали костные останки двух индивидов из эллинистического склепа № 247, обнаруженного Фанагорийской экспедицией Института археологии РАН в 2015 году. Мужчина и женщина были расположены в погребальной камере близко друг к другу, рука об руку, что, вероятно, отражало их близость при жизни. Погребальный инвентарь в камере, представленный большим количеством посуды, был типичен для эллинистических склепов Азиатского Боспора. По комплексу керамики склеп датировали II веком до н.э., к этому же времени относится и монета, найденная у черепа мужчины.

Согласно антропологическому описанию, и мужчина, и женщина были захоронены в возрасте старше 50 лет. Образцы их костей и зубов ранее подвергались изотопному анализу для изучения питания и мобильности населения Фанагории, и оказалось, что мужчина и женщина в детстве придерживались разных стратегий питания. Это могло объясняться их разным происхождением.

ДНК из костных фрагментов извлекали и анализировали на базе Университета «Сириус». Секвенирование проводили на платформах Illumina MiSeq и Illumina NovaSeq 6000. Полученные прочтения картировали относительно референсного (GRCh37) и митохондриального (мтДНК, NC_012920.1) геномов человека.

Генетический пол обоих индивидов совпал с результатами антропологических описаний. Реконструировали полные последовательности мтДНК и определили митохондриальные гаплогруппы: для женщины (образец Fan23) — H6a1a4d, для мужчины (образец Fan24) — H5ac. Таким образом, они не состояли в родстве по материнской линии. Анализ родства по данным полногеномного секвенирования также показал, что мужчина и женщина не являются родственниками первой, второй или третьей степени. Для мужчины также определили гаплогруппу Y-хромосомы — G-FGC21495 (G2a2b2a1a1a1b1b).

При помощи метода главных компонент исследователи провели популяционный анализ, который показал, что генетические профили индивидов значительно различаются. На графике главных компонент образец мужчины располагался в кластере современных кавказских популяций, наиболее близок он оказался к образцам с территории Турции. Образец женщины располагался вблизи современных популяций центра и севера Русской равнины.

Далее авторы применили метод f4 статистики, чтобы оценить потенциальный генетический вклад древних популяций в геном индивидов. Анализ показал, что в геноме мужчины значительно больше общих аллелей с древними группами, населявшими территорию Малой Азии и Ближнего Востока от неолита до раннего железного века. В то же время образец женщины был более всего сходен с древними популяциями Восточной и Северной Европы. Авторы статьи подчеркивают, что ни один из индивидов не демонстрировал значимого сходства с древними популяциями Греции бронзового и раннего железного века.

Учитывая тот факт, что по результатам изотопного анализа женщина отличалась от большинства жителей Фанагории по типу питания, авторы предположили, что она могла быть мигрантом. При этом, поскольку по изотопам стронция ее показатели не выходят за пределы локальной изменчивости, скорее всего, она была переселена в детстве. Ее митохондриальная гаплогруппа (H6a1a4) распространена преимущественно у жителей Восточной Европы (главным образом России), в меньшей степени — Центральной и Северной Европы. Последовательности, наиболее близкие к ее мтДНК, встречаются у современных жителей России, Польши, Дании и Финляндии. Таким образом, вероятный регион ее происхождения — Центральная или Северо-Восточная Европа.

Что касается мужчины, то по митохондриальной гаплогруппе он наиболее близок к друзам, проживающим на севере Израиля, а его Y-хромосомная гаплогруппа более всего распространена на территории Турции. По полногеномным маркерам выявляется его сходство с древним населением Малой Азии и Ближнего Востока. Возможно, это сходство стало результатом миграции населения Малой Азии в период Великой греческой колонизации. Но авторы предупреждают, что однозначные выводы не могут быть сделаны на основе анализа единичного образца.

Полученные данные доказывают генетическую гетерогенность людей, захороненных в эллинистическом склепе Фанагории. Несмотря на разное происхождение — мужчина имел предков с Ближнего Востока, а женщина из Восточной/Северной Европы — они принадлежали к одной культуре и, вероятно, состояли в супружеском союзе. Очевидно, что фанагорийское общество было открытым по отношению к разнонаправленным миграциям.

Как отмечает один из авторов статьи Андрей Манахов, представляющий университет «Сириус» и ИОГен РАН: «Это пионерское для данного региона и периода исследование. Ранее образцы из черноморских греческих колоний методами палеогеномики не изучались. В базах данных был представлен лишь один образец из Пантикапея — европейской столицы Боспорского царства. При поддержке РНФ и федеральной территории “Сириус” будут продолжены геномные исследования на территории Фанагории и всего Краснодарского края. Здесь расположено огромное количество археологических комплексов, предоставляющих богатейший материал».

Анализ 200 геномов жителей средневековой Руси заполняет обширный пробел в генетической летописи