Прокариотическая ДНК-полимераза хуже работает в невесомости

Канадские ученые установили в самолет, имитирующий условия невесомости за счет параболической траектории полета, полуавтоматический прибор, который позволил изучить активность ДНК-полимеразы Escherichia coli. В условиях микрогравитации точность работы фрагментов Кленова с 3'–5' экзонуклеазной активностью и без снизилась в 1,1 и 2,4 раза соответственно.

Credit:
nicoelnino | 123rf.com

У организмов, находящихся в космосе, ДНК мутирует чаще, чем на Земле, в первую очередь из-за воздействия космического излучения. Однако до сих пор неизвестно, как микрогравитация влияет на способность ДНК-полимеразы реплицировать ДНК и репарировать повреждения. Понимание того, как невесомость воздействует на целостность генома, важно для будущих долговременных космических миссий.

В поисках ответа на этот вопрос канадские ученые спроектировали небольшую полуавтоматическую лабораторию, которую установили в самолет для имитации условий невесомости. С ее помощью можно заставить ДНК-полимеразу Escherichia coli реплицировать фрагмент ДНК из 1000 нуклеотидов за тот период времени, когда предметы в самолете находятся в условиях микрогравитации. Лабораторию сделали достаточно простой, чтобы с ней мог работать исследователь, испытывающий тошноту в полете. Использовали фрагменты Кленова с 3'–5' экзонуклеазной активностью и без. В конце эксперимента подсчитывали количество замен, инсерций и делеций.

Авторы показали, что для полимеразы с 3'–5' экзонуклеазной активностью точность репликации уменьшилась в 1,1 раз, а без экзонуклеазной активности — в 2,4 раза, когда речь идет о заменах. Делеции происходили в 1,1 и 1,5 раз чаще. Инсерции встречались слишком редко для статистического анализа.

Таким образом, невесомость отрицательно воздействовала на точность прокариотической ДНК-полимеразы. Можно предположить, что микрогравитация — это ДНК-стрессор, но механизм ее действия неясен. Даже 3'–5' экзонуклеазная активность не могла полностью компенсировать ее эффект. Авторы предполагают, что проблема может быть в изменении конформации фермента и субстрата или в снижении конвективного потока, который влияет на локальную концентрацию dNTP. Пока неизвестно, распространяется ли действие микрогравитации на другие про- и эукариотические полимеразы. Есть опасения, что эффект сохранится для полимераз в митохондриях человека. Уже сейчас известно, что митохондрии в условиях микрогравитации производят больше активных форм кислорода.

Источник

Rosenstein A.H., Walker V.K. Fidelity of a Bacterial DNA Polymerase in Microgravity, a Model for Human Health in Space // Frontiers in Cell and Developmental Biology (2021), published November 29, 2021, DOI: 10.3389/fcell.2021.702849

Добавить в избранное

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.