Детально исследованы структуры S-белков новых штаммов коронавируса

В статье, опубликованной в Science, представлены крио-ЭМ структуры S-белка штаммов коронавируса B.1.1.7 (альфа) и B.1.351 (бета) и рассмотрено влияние мутаций на их биохимические и антигенные свойства.

У вируса B.1.1.7 мутации, приводящие к заменам A570D и S982A, изменяют конформацию S-белка таким образом, что рецептор-связывающий мотив (RBM) становится более доступным для клеточного рецептора ACE2. Замена N501Y также увеличивает сродство рецепторсвязывающего домена RBD к рецептору. Комбинация этих замен может позволить вирусу B.1.1.7 инфицировать типы клеток с более низкими уровнями ACE2, чем у клеток эпителия носа и бронхов, а это, по мнению авторов, объясняет повышенный (незначительно) риск смерти у пациентов, инфицированных этим вариантом. Мутации в B.1.1.7 не вызывали серьезных структурных перестроек в RBD и N-концевом домене, поэтому чувствительность варианта к нейтрализующим антителам изменилась незначительно.

В S-белке варианта B.1.351 замены N501Y, K417N и E484K также не вызвали серьезных структурных изменений в RBD, однако потеря солевых мостиков между K417 и аминокислотными остатками ACE2 ослабила повышенное сродство к рецепторам, созданное N501Y. С другой стороны, K417N и E484K, вероятно, препятствуют связыванию нейтрализующих антител с эпитопами RBD. Мутации в N-концевом домене значительно снижают эффективность нейтрализующих антител против эпитопов к этому домену. Вариант B.1.351, по-видимому, эволюционировал под давлением иммунной системы, что привело к изменениям в двух важных участках, распознаваемых антителами, но параллельно снизилась способность связываться с клетками — то есть развитие устойчивости к нейтрализующим антителам сопровождалась некоторым уменьшением приспособленности вируса.

Если SARS-CoV-2 станет сезонным, стратегии, разработанные против других патогенов человека, таких как ВИЧ-1, вирус гепатита С и вирус гриппа, могут быть применимы для контроля COVID-19, отмечают авторы.

Добавить в избранное

Вам будет интересно