Модель левого желудочка может перекачивать жидкость

Шолто Дэвид, молекулярный биолог, известный своими расследованиями ошибок и фальсификаций в научных статьях, обнаружил очередную проблему — более чем в 50 работах по клеточной сенесценции, вероятно, использовались не те антитела для идентификации ключевого белка.  

Характерный признаков сенесцентных («стареющих») клеток — активность фермента β-галактозидазы. На этом основан один из методов их выявления в культуре — обработка хромогенным субстратом X-gal приведет к тому, что в сенесцентных клетках он расщепится β-галактозидазой и образует нерастворимый осадок синего цвета. Этот фермент можно выявлять и другими методами, например, иммуноокрашиванием или вестерн-блоттингом, то есть с помощью антитела. И Шолто Дэвид пишет в своем блоге о том, что авторы ряда статей сообщают об использовании антитела, специфичного к β-галактозидазе кишечной палочки — ферменту с той же функцией и сильно отличающейся последовательностью. Между β-галактозидазой у кишечной палочки и млекопитающих недостаточно гомологии (около 20%), поэтому антитело к первому из этих белков не будет связываться со вторым. 

Работы, где была замечена ошибка в выборе антител к β-галактозидазе, Дэвид собрал в общедоступный список — сейчас он насчитывает 54 публикации.  Первую из таких статей, вышедшую в Cell в 2016 году, исследователю прислали вскоре после того, как в июне он рассказал об еще одной (более масштабной) путанице с антителами.   

Ранее он писал, что более чем в трехстах работах произошла путаница, и вместо онкосупрессора p16 ученые «искали» в сенесцентных или опухолевых клетках компонент актинового цитоскелета с похожим названием. Вместо антител к p16-INK4a — это полное название онкосупрессора — во многих работах упоминались антитела к p16-ARC, который не участвует в контроле клеточного цикла или старении. Некорректное использование Дэвид нашел в 95% случаев, просмотрев 334 доступных статьи — сам он называет это «поистине поразительной ошибкой».    

Повышенная температура тела — классический механизм борьбы животных с инфекционными заболеваниями. У млекопитающих и птиц она повышается за счет физиологических механизмов, а эктотермные животные — рыбы, амфибии и рептилии — могут искать более теплую среду. (Это описано, например, для рыб.) Авторы статьи в BMC Biology продемонстрировали обратный пример — инфицированная амфибия ищет прохладную среду, чтобы снизить температуру тела. Эта стратегия, известная как поведенческое охлаждение, ранее наблюдалась у нескольких видов членистоногих, а также у крыс.

В эксперименте участвовали головастики прыткой лягушки (Rana dalmatina), инфицированные ранавирусами — опасными патогенами амфибий. Одна группа головастиков могла перемещаться в искусственном температурном градиенте, другую содержали при постоянной пониженной температуре. Зараженные головастики в воде с температурным градиентом предпочитали более прохладную воду, чем их здоровые собратья. Более того, чем выше была вирусная нагрузка у особи, тем ниже комфортная для нее температура. Со временем возрастала точность регуляции — головастик оставался в узком температурном диапазоне, избегая и пагубного чрезмерного холода. У головастиков, содержавшихся в прохладной воде, была значительно более низкая вирусная нагрузка к концу пятидневного эксперимента.

Кажущийся парадокс объясняется особенностями ранавируса, который использовали ученые. Он размножается быстрее при более высоких температурах, поэтому охлаждение дает дополнительное преимущество больной особи.

Ранавирусы представляют серьезную угрозу для различных видов амфибий. Результаты данного исследования показывают, что температурные градиенты в водоемах играют важную роль в их защите от инфекции, а изменение климата может ухудшить шансы популяции на выживание.

Британское издательство Taylor & Francis с 2023 года регулярно публикует краткие пересказы научных статей, написанные простым языком (Plain Language Summaries of Publications, PLSP), в первую очередь по медицине. «Пациенты, политики, лица, осуществляющие уход, и врачи общей практики теперь могут быть в курсе последних медицинских статей», — говорилось в анонсе. Статьи адресованы специалистам, и другим людям их язык непонятен. Это препятствует коммуникации с пациентом и не соответствует практике совместного принятия решений о лечении. Информация об исследованиях широко доступна через интернет, но остается непонятной для большинства людей.

PLSP находятся в открытом доступе, имеют собственные цифровые идентификаторы (DOI). При наличии разрешения могут быть сделаны популярные обзоры исследовательских статей, опубликованных в любом рецензируемом журнале.

Теперь Taylor & Francis анонсировало обзоры, написанные простым языком (Plain Language Reviews, PLR). В них не просто пересказывается отдельная статья: данные научного исследования или клинических испытаний дополнены информаций из множества связанных рецензируемых статей, которые дают контекст для основного исследования. В отличие от правил для PLSP, среди соавторов PLR не обязательно должен быть кто-то из авторов исходной статьи,

Подробнее о том, как издательство предлагает писать обзоры научных исследований для широкого круга.

Пол детенышей большинства черепах зависит от температуры почвы, в которой инкубируются яйца: в теплых местах выводятся самки, а в прохладных — самцы. Согласно исследованию эволюционных биологов из Университета штата Айова, за это отвечают первичные реснички на поверхности клеток, которые служат «антеннами» для восприятия внешних стимулов.

В ходе эволюции у некоторых видов черепах появились половые хромосомы. Ученые исследовали транскрипционные факторы вместе с группами генов, активность которых они регулируют, у двух видов — расписных черепах Chrysemys picta с температурным определением пола и колючего трионикса Apalone spinifera, у которого есть половые хромосомы типа ZZ/ZW. Их задачей было выяснить, какие белки и структуры могут опосредовать влияние температуры на пол потомства.

У расписных черепах и триониксов обнаружили 89 общих транскрипционных факторов, 50 из них регулировали одни и те же наборы генов. Те транскрипционные факторы, у которых генные наборы и их функции существенно изменились, влияли в том числе на экспрессию термочувствительных генов, связанных с первичными ресничками. Некоторые гены-мишени у расписных черепах обеспечивали функциональность чувствительной реснички, а у триониксов — ее структуру и формирование.

Первичные реснички воспринимают стимулы из окружающей среды, в том числе изменения температуры, и управляют сигнальными путями, изменяющими активность генов. Известно, что первичные реснички участвуют в развитии мочеполовой системы млекопитающих. Многие из выявленных транскрипционных факторов также связаны с половым развитием. Однако для подтверждения гипотезы о том, что клеточные реснички играют роль в определении пола у черепах, необходимы дальнейшие исследования на большем количестве видов. Их результаты могут быть важны и для здоровья человека, отмечается в пресс-релизе. Дисфункция ресничек связана не только с гипогонадизмом и нарушениями мочеполовой системы, но и с многими другими заболеваниями, включая рак.

Дильдрин — мощный инсектицид, применявшийся для борьбы с комарами в эндемичных по малярии районах более полувека назад. Его наносили на стены в помещениях. Позднее в большинстве стран его перестали использовать из-за токсичности, а также потому, что у комаров появились мутации устойчивости. Но одна из мутаций сохраняется у представителей рода Anopheles до сих пор, хотя должна была исчезнуть в отсутствие фактора отбора. Как установили авторы препринта, опубликованного на bioRxiv, эта мутация также улучшает чувствительность к звукам.

Об истории открытия пишет журнал Science. Продукт гена Rdl (Resistance to dieldrin), в котором находится мутация, ГАМК-зависимый хлоридный канал RDL— модулирует слуховую чувствительность комара. Испанский нейробиолог Марта Андрес вместе с коллегами показала, что при химическом блокировании активности RDL насекомые сильнее реагировали на звуки. От Диего Айалы, специалиста по экологии переносчиков заболеваний из Университета Монпелье (Франция), Марта Андрес узнала, что в Африке к югу от Сахары в городских и сельских популяциях комаров вариант Rdl, связанный с устойчивостью к пестициду, распространяется по-разному: в городах его больше. Улучшенный слух является преимуществом, когда комар ищет самку по слабому звуку полета в шумном городе, поэтому возник вопрос, не улучшает ли мутация слух насекомых.

Действительно, в экспериментальных условиях самцы с мутацией устойчивости чаще летели к динамику, издающему «комариный» звук на частоте 300–550 Гц. Они одинаково успешно спаривались с самками и при включенном звуке на уровне 93 децибел, имитирующем городской шум, и без него, тогда как у самцов без этой мутации успех спаривания снижался в шумной среде. Таким образом, мутация устойчивости стала давать преимущество при половом отборе в антропогенном ландшафте.