Новый метод изотермической амплификации может вытеснить классические амплификаторы

Ученые из Университета Джонса Хопкинса с коллегами из других научных центров США разработали новый метод изотермической амплификации, использующий инженерную хеликазу PcrA M6 и белок SSB, который связывает одноцепочечную ДНК. Метод получил название SHARP (SSB-Helicase Assisted Rapid PCR). Реакция протекает при 65°C. Хеликаза расплетает ДНК, на одноцепочечные фрагменты садится белок SSB, после чего происходит отжиг праймеров и начинает работать полимераза. Ученые утверждают, что новая хеликаза заменяет нагрев, который использует для денатурации ДНК в классической ПЦР, что позволяет повысить скорость и эффективность амплификации. С помощью SHARP можно получать ампликоны размером до 6 000 п. о. Ученые продемонстрировали возможность использования метода для амплификации таргетных участков ДНК из человеческих клеток и для оценки последствий редактирования генома с помощью системы CRISPR-Cas9. По их словам, SHARP имеет преимущества перед другими методами изотермической амплификации, одно из которых — значительно увеличенная длина продуктов реакции.

В настоящее время идет работа над коммерциализацией технологии. Ученые из лаборатории профессора Универсистета Джинса Хопкинса Тэкджипа Ха создают стартап SHARP Diagnostics. Их бизнес-план получил награду на соревновании HopStart. По словам Ха, статья о новом методе, опубликованная в Nature Communications, вызвала живой интерес в научном сообществе. «Если можно будет заменить ПЦР-машины этим методом в большинстве приложений, для которых люди используют ПЦР, это будет большим достижением», — говорит он.

Добавить в избранное

Вам будет интересно