Ученые ищут причину вспышки тяжелого гепатита у маленьких детей в Европе и США

Норовирусы подразделяются на 10 геногрупп (GI-GX), которые далее делятся на генотипы на основе двойной систематики: по гену капсидного белка VP1 и домену РНК-зависимой РНК-полимеразы в области RdRp. Классификация норовирусов важна, поскольку они часто рекомбинируют, что может повлиять на трансмиссивность. Специалисты из ФГБУ ЦСП ФМБА России и Детской городской клинической больницы № 9 имени Г.Н. Сперанского разработали систему для высокоточного генотипирования норовируса путем амплификации региона RdRp–VP1, нанопорового секвенирования и биоинформатического анализа.

Ранее опубликованные протоколы для типирования норовирусов основаны на амплификации коротких фрагментов (500–700 п.н.), не охватывающих сайт рекомбинации RdRp–VP1, а секвенирование по Сэнгеру не выявляет смешанные инфекции или минорные варианты. Новая система генотипирования позволяет полностью амплифицировать геномную область RdRp–VP1 размером ~3,2 кб за одну реакцию ПЦР, охватывая «горячую точку» рекомбинации между этими функциональными доменами. Благодаря этому становится возможным чувствительное выявление смешанных инфекций и рекомбинантных вариантов даже при концентрации 1% для минорных генотипов.

Систему валидировали с помощью ретроспективного анализа 115 случаев острого гастроэнтерита у детей в Москве в 2021–2025 гг. Анализ показал, что преобладал норовирус GII.4[P16], а генотип GII.17[P17] стал вторым по распространенности после 2021 года. Напротив, частота встречаемости ранее распространенных генотипов GII.4[P31] и GII.3[P12] резко снизилась. Смешанные инфекции были выявлены в 4% случаев. Благодаря полученным данным удалось удвоить количество длинных (>3000 п.н.) геномных последовательностей NoV-GII из России в общедоступных базах данных. Новая система подходит для высокоточного эпиднадзора, своевременного выявления новых штаммов и принятия мер для защиты общественного здоровья.

Исследователи из Китая обнаружили, что силикатные мембраны, применяемые для выделения нуклеиновых кислот, могут стать источником парвовирусов и других вирусных загрязнений. Контаминация способна создать ложные ассоциации между вирусами и хозяевами в метагеномных исследованиях, затруднить диагностику и мониторинг.

В нескольких регионах Китая в ходе метагеномных исследований ученые выявили десятки парвовирусных последовательностей, схожих с геномами вирусов летучих мышей, птиц, панголинов и других животных. Дополнительный анализ показал, что источником этих последовательностей были не пациенты, а колонки для выделения нуклеиновых кислот и некоторые типы пробирок. Тестирование 28 наборов для выделения продемонстрировало контаминацию 13-ю вирусными семействами, в первую очередь Parvoviridae.

Авторы создали базу данных Panoramic Virus Discovery Data Chain (PVDDC), чтобы отслеживать вирусные геномы, протоколы лабораторных исследований, реагенты и организмы-хозяева. ChatGPT‐4o помог отследить контаминацию. Исследователи также запустили базу данных парвовирусов ParvoDB — общедоступную платформу с инструментами для поиска штаммов парвовирусов человека и отслеживания контаминаций. Для многих ассоциаций между парвовирусами и человеком из общедоступных баз данных нет надежных экспериментальных доказательств, то есть они могут быть результатом загрязнения реагентов.

Вирусы простого герпеса вызывают высыпания на губах (обычно HSV1) и гениталиях (HSV2). После исчезновения симптомов первичной инфекции вирусы остаются в латентном состоянии в нервной системе и могут периодически активироваться. Некоторые исследования показали связь герпеса с болезнью Альцгеймера. Так, ДНК HSV1 часто ассоциирована с амилоидными бляшками, а у людей, лечившихся от герпеса, вероятность последующего развития болезни Альцгеймера была ниже, чем у людей с положительным результатом теста на вирус, не получавших терапии. Однако клиническое испытание показало, что противовирусный препарат валацикловир не влиял на течение болезни Альцгеймера, по крайней мере на ранних стадиях. Результаты испытания были представлены на международной конференции Ассоциации болезни Альцгеймера.

В исследовании приняли участие 120 людей, средний возраст которых составил 71 год. У всех участников была диагностирована ранняя стадия болезни Альцгеймера или легкие когнитивные нарушения, при этом результаты визуализации или анализы крови указывали на болезнь Альцгеймера. У всех участников были обнаружены антитела к вирусу герпеса (в основном HSV1, в некоторых случаях HSV2). Они принимали валацикловир или плацебо ежедневно. Исследователи тестировали память пациентов и проводили визуализацию мозга для выявления отложений амилоида и тау-белка. Через 18 месяцев они обнаружили, что пациенты, принимавшие плацебо, показали несколько лучшие результаты в когнитивных тестах, чем пациенты из группы, принимавшей валацикловир, однако по другим показателям существенных различий не наблюдалось. По словам авторов, препараты, воздействующие на герпес, не могут быть рекомендованы для лечения пациентов с болезнью Альцгеймера и признаками предшествующей инфекции.

Компания Gilead Sciences объявила о том, что FDA одобрило применение Yeztugo (ленакапавира) для доконтактной профилактики ВИЧ-инфекции. Ленакапавир — это ингибитор капсида ВИЧ-1 с длинным периодом полувыведения, который требуется вводить с помощью подкожной инъекции дважды в год. Одобрение получено для взрослых и подростков, весящих по крайней мере 35 кг. Создатели ленакапавира надеются, что снижение числа необходимых доз побудит больше человек воспользоваться доконтактной профилактикой. Они работают со страховщиками и системами здравоохранения, чтобы добиться минимальной стоимости препарата для потребителя. В идеале — сделать его бесплатным, в том числе для тех, у кого нет страховки.

Одобрение было получено в результате успеха клинических испытаний 3 фазы PURPOSE 1 и PURPOSE 2. В первом испытании не заразился ни один из 2134 участников, во втором заразились двое из 2179, что все же лучше, чем ежедневный прием Truvada. Значительных побочных эффектов выявлено не было.

Коронавирус Ближневосточного респираторного синдрома MERS-CoV был впервые обнаружен на Ближнем Востоке в 2012 году. Этот вирус вызывает у людей тяжелое респираторное заболевание с высокой смертностью. MERS-CoV относится к подроду мербековирусов рода бета-коронавирусов. Были выявлены сотни мербековирусов у различных животных. Как это обычно и бывает, большая их часть была секвенирована, но не изолирована и не охарактеризована. Поэтому опасность большинства мербековирусов для человека оценить трудно. Исследователи из США разработали и применили новый подход для определения способа проникновения мербековирусов в клетки.

Вирус MERS-CoV использует дипептидилпептидазу IV (DPP4) в качестве рецептора для заражения клеток хозяина; исследования показали, что некоторые мербековирусы летучих мышей взаимодействуют не с DPP4, а, например, с ACE2. Рецепторсвязывающие домены (RBD) у мербековирусов разделяют на четыре клады по строению и сродству к рецепторам. Чтобы снизить стоимость синтеза вирусных генов, авторы конструировали рекомбинантные вирусы, заменяя участки, кодирующие RBD, в гене спайк-белка модельного вируса. Рецепторсвязывающие домены полученных псевдовирусов были идентичны RBD изучаемых мербековирусов. Их использовали для определения сродства к рецепторам клеток-хозяев. Этот подход назывался MerbecoType по аналогии с ранее разработанным авторами SarbecoType. С помощью этого метода авторы показали, что по крайней мере половина клад RBD мербековирусов использует ACE2 для проникновения в клетку, при этом вся группа вирусов HKU5 демонстрирует явное сродство к ACE2 их естественного вида-хозяина — летучих мышей Pipistrellus abramus.