Сродство мербековирусов к рецепторам определили методом MerbecoType
Коронавирус Ближневосточного респираторного синдрома MERS-CoV был впервые обнаружен на Ближнем Востоке в 2012 году. Этот вирус вызывает у людей тяжелое респираторное заболевание с высокой смертностью. MERS-CoV относится к подроду мербековирусов рода бета-коронавирусов. Были выявлены сотни мербековирусов у различных животных. Как это обычно и бывает, большая их часть была секвенирована, но не изолирована и не охарактеризована. Поэтому опасность большинства мербековирусов для человека оценить трудно. Исследователи из США разработали и применили новый подход для определения способа проникновения мербековирусов в клетки.
Вирус MERS-CoV использует дипептидилпептидазу IV (DPP4) в качестве рецептора для заражения клеток хозяина; исследования показали, что некоторые мербековирусы летучих мышей взаимодействуют не с DPP4, а, например, с ACE2. Рецепторсвязывающие домены (RBD) у мербековирусов разделяют на четыре клады по строению и сродству к рецепторам. Чтобы снизить стоимость синтеза вирусных генов, авторы конструировали рекомбинантные вирусы, заменяя участки, кодирующие RBD, в гене спайк-белка модельного вируса. Рецепторсвязывающие домены полученных псевдовирусов были идентичны RBD изучаемых мербековирусов. Их использовали для определения сродства к рецепторам клеток-хозяев. Этот подход назывался MerbecoType по аналогии с ранее разработанным авторами SarbecoType. С помощью этого метода авторы показали, что по крайней мере половина клад RBD мербековирусов использует ACE2 для проникновения в клетку, при этом вся группа вирусов HKU5 демонстрирует явное сродство к ACE2 их естественного вида-хозяина — летучих мышей Pipistrellus abramus.