Лабораторные расходники — возможный источник вирусных контаминаций

Исследователи из Китая обнаружили, что силикатные мембраны, применяемые для выделения нуклеиновых кислот, могут стать источником парвовирусов и других вирусных загрязнений. Контаминация способна создать ложные ассоциации между вирусами и хозяевами в метагеномных исследованиях, затруднить диагностику и мониторинг.

В нескольких регионах Китая в ходе метагеномных исследований ученые выявили десятки парвовирусных последовательностей, схожих с геномами вирусов летучих мышей, птиц, панголинов и других животных. Дополнительный анализ показал, что источником этих последовательностей были не пациенты, а колонки для выделения нуклеиновых кислот и некоторые типы пробирок. Тестирование 28 наборов для выделения продемонстрировало контаминацию 13-ю вирусными семействами, в первую очередь Parvoviridae.

Авторы создали базу данных Panoramic Virus Discovery Data Chain (PVDDC), чтобы отслеживать вирусные геномы, протоколы лабораторных исследований, реагенты и организмы-хозяева. ChatGPT‐4o помог отследить контаминацию. Исследователи также запустили базу данных парвовирусов ParvoDB — общедоступную платформу с инструментами для поиска штаммов парвовирусов человека и отслеживания контаминаций. Для многих ассоциаций между парвовирусами и человеком из общедоступных баз данных нет надежных экспериментальных доказательств, то есть они могут быть результатом загрязнения реагентов.

Добавить в избранное

Вам будет интересно

20.05.2026
111
0

20 мая 2026 года на 72-м году жизни скоропостижно скончался доктор медицинских наук, профессор, академик РАН Вадим Валентинович Покровский, специалист в области профилактики и лечения ВИЧ-инфекции, сын академика В.И. Покровского (1929—2020).

В 1988–2001 гг. В.В. Покровский занимал должность заведующего специализированной лабораторией эпидемиологии и профилактики СПИД ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, с 2001 года — заместитель директора и руководитель Федерального научно-методического центра по борьбе и профилактике ВИЧ-инфекции в том же учреждении. Под его руководством были разработаны и внедрены тест-системы для диагностики ВИЧ, гепатитов В, С, D. Вадим Валентинович также был членом Ученого совета и заведующим лабораторией постгеномных технологий в НИИ медицины труда им. А.Ф.Измерова.

В.В. Покровский впервые в СССР выявил ВИЧ-инфицированных и больных СПИДом. Он возглавлял расследование нозокомиальной вспышки ВИЧ-инфекции 1988 года в Элисте (Калмыкия) и организовал ее локализацию, участвовал в создании эпиднадзора за ВИЧ, разработке законодательства в данной области, организации системы оказания медицинской помощи людям, живущих с ВИЧ, подготовил множество специалистов.

В 2000 году В.В. Покровский получил Государственную премию РФ за внедрение в медицинскую практику Фосфазида — нуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы, применяемого в комбинированной антиретровирусной терапии ВИЧ и гепатита В.

24.02.2026
458
0

Малоизученный тип вируса семейства Orthomyxoviridae — вирус гриппа D — встречается в основном у сельскохозяйственных животных. Пока неясно, насколько он опасен для человека, однако он может передаваться от вида к виду, а работники животноводческих хозяйств часто имеют антитела к нему. Ученые из Университета Огайо и Детской исследовательской больницы Св. Иуды в Мемфисе (США) собрали панель изолятов вируса гриппа D, полученных в 2011–2020 гг. от свиней и крупного рогатого скота и оценили их способность инфицировать клетки дыхательных путей человека. Препринт статьи опубликован на bioRxiv.

Исследования проводили на иммортализованных линиях эпителиальных клеток легких, первичных хорошо дифференцированных клетках эпителия дыхательных путей, а также на тонких срезах легких. Вирус гриппа D размножался в клетках и тканях дыхательных путей человека, достигая таких же титров, как и человеческий вирус гриппа А.

Авторы также исследовали реакцию клеток дыхательных путей человека на вирус гриппа D. По сравнению с вирусом гриппа А он вызвал значительно меньшую активацию сигнального пути регуляторного фактора интерферона (IRF), меньшую индукцию IFN-

01.11.2025
810
0

Норовирусы подразделяются на 10 геногрупп (GI-GX), которые далее делятся на генотипы на основе двойной систематики: по гену капсидного белка VP1 и домену РНК-зависимой РНК-полимеразы в области RdRp. Классификация норовирусов важна, поскольку они часто рекомбинируют, что может повлиять на трансмиссивность. Специалисты из ФГБУ ЦСП ФМБА России и Детской городской клинической больницы № 9 имени Г.Н. Сперанского разработали систему для высокоточного генотипирования норовируса путем амплификации региона RdRp–VP1, нанопорового секвенирования и биоинформатического анализа.

Ранее опубликованные протоколы для типирования норовирусов основаны на амплификации коротких фрагментов (500–700 п.н.), не охватывающих сайт рекомбинации RdRp–VP1, а секвенирование по Сэнгеру не выявляет смешанные инфекции или минорные варианты. Новая система генотипирования позволяет полностью амплифицировать геномную область RdRp–VP1 размером ~3,2 кб за одну реакцию ПЦР, охватывая «горячую точку» рекомбинации между этими функциональными доменами. Благодаря этому становится возможным чувствительное выявление смешанных инфекций и рекомбинантных вариантов даже при концентрации 1% для минорных генотипов.

Систему валидировали с помощью ретроспективного анализа 115 случаев острого гастроэнтерита у детей в Москве в 2021–2025 гг. Анализ показал, что преобладал норовирус GII.4[P16], а генотип GII.17[P17] стал вторым по распространенности после 2021 года. Напротив, частота встречаемости ранее распространенных генотипов GII.4[P31] и GII.3[P12] резко снизилась. Смешанные инфекции были выявлены в 4% случаев. Благодаря полученным данным удалось удвоить количество длинных (>3000 п.н.) геномных последовательностей NoV-GII из России в общедоступных базах данных. Новая система подходит для высокоточного эпиднадзора, своевременного выявления новых штаммов и принятия мер для защиты общественного здоровья.

30.07.2025
1020
0

Вирусы простого герпеса вызывают высыпания на губах (обычно HSV1) и гениталиях (HSV2). После исчезновения симптомов первичной инфекции вирусы остаются в латентном состоянии в нервной системе и могут периодически активироваться. Некоторые исследования показали связь герпеса с болезнью Альцгеймера. Так, ДНК HSV1 часто ассоциирована с амилоидными бляшками, а у людей, лечившихся от герпеса, вероятность последующего развития болезни Альцгеймера была ниже, чем у людей с положительным результатом теста на вирус, не получавших терапии. Однако клиническое испытание показало, что противовирусный препарат валацикловир не влиял на течение болезни Альцгеймера, по крайней мере на ранних стадиях. Результаты испытания были представлены на международной конференции Ассоциации болезни Альцгеймера.

В исследовании приняли участие 120 людей, средний возраст которых составил 71 год. У всех участников была диагностирована ранняя стадия болезни Альцгеймера или легкие когнитивные нарушения, при этом результаты визуализации или анализы крови указывали на болезнь Альцгеймера. У всех участников были обнаружены антитела к вирусу герпеса (в основном HSV1, в некоторых случаях HSV2). Они принимали валацикловир или плацебо ежедневно. Исследователи тестировали память пациентов и проводили визуализацию мозга для выявления отложений амилоида и тау-белка. Через 18 месяцев они обнаружили, что пациенты, принимавшие плацебо, показали несколько лучшие результаты в когнитивных тестах, чем пациенты из группы, принимавшей валацикловир, однако по другим показателям существенных различий не наблюдалось. По словам авторов, препараты, воздействующие на герпес, не могут быть рекомендованы для лечения пациентов с болезнью Альцгеймера и признаками предшествующей инфекции.

20.06.2025
1348
0

Компания Gilead Sciences объявила о том, что FDA одобрило применение Yeztugo (ленакапавира) для доконтактной профилактики ВИЧ-инфекции. Ленакапавир — это ингибитор капсида ВИЧ-1 с длинным периодом полувыведения, который требуется вводить с помощью подкожной инъекции дважды в год. Одобрение получено для взрослых и подростков, весящих по крайней мере 35 кг. Создатели ленакапавира надеются, что снижение числа необходимых доз побудит больше человек воспользоваться доконтактной профилактикой. Они работают со страховщиками и системами здравоохранения, чтобы добиться минимальной стоимости препарата для потребителя. В идеале — сделать его бесплатным, в том числе для тех, у кого нет страховки.

Одобрение было получено в результате успеха клинических испытаний 3 фазы PURPOSE 1 и PURPOSE 2. В первом испытании не заразился ни один из 2134 участников, во втором заразились двое из 2179, что все же лучше, чем ежедневный прием Truvada. Значительных побочных эффектов выявлено не было.

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.