Анализ РНК-вирома городов и пригородов выявил 40 тысяч потенциальных новых вирусов

РНК-вирусы — неотъемлемая часть среды, окружающей человека и влияющей на его здоровье. Они также представляют собой одну из наиболее разнообразных эволюционно групп, однако значительная часть их разнообразия, иногда называемая вирусной «темной материей», не описана до сих пор. Чтобы восполнить этот пробел, авторы статьи в Nature Communications проанализировали РНК-виром и создали Атлас городских и пригородных РНК-вирусов.

Ученые проанализировали 2 922 метатранскриптома из различных городских сред, таких как транспортные узлы, больницы и банки, а также пригородных зон. Образцы собирали в 102 городах 31 страны. Всего анализ выявил 54 945 РНК-вирусов, 77% из которых ранее не были описаны — это более 40 тысяч новых операционных таксономических единиц (OTU) РНК-вирусов. По полученным последовательностям авторы построили филогенетическое древо, опираясь на РНК-зависимые РНК-полимеразы вирусов. Они выделили два новых предполагаемых типа (филума) РНК-вирусов, один потенциальный класс и несколько клад неустановленного таксономического ранга.

По базам данных спейсеров CRISPR исследователи оценили спектр возможных хозяев для примерно трети выявленных РНК-вирусов. В частности, они построили сеть взаимодействий с клинически значимыми патогенами группы ESKAPE и обнаружили 166 вирусов, связанных с четырьмя из шести видов этой группы. (Название ESKAPE представляет собой акроним, обозначающий шесть клинически значимых патогенов: Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp.). Исследователи подчеркивают экологическую сложность и разнообразие РНК-вирусов, а также призывают к их постоянному мониторингу в городской среде.


Добавить в избранное

Вам будет интересно

14.08.2026
97
0

Национальная служба здравоохранения Англии (NHS England) сообщила 11 августа, что с момента внедрения современных противовирусных препаратов в 2015 году более чем у 100 тысяч человек был диагностирован гепатит С, и они получают лечение, таким образом, Англия находится на пути к тому, чтобы стать одной из первых стран в мире, искоренивших это заболевание.

Вирус гепатита С без лечения может вызывать опасное для жизни повреждение печени, которое зачастую протекает бессимптомно до поздних стадий. Лечение включает 8-12-недельный курс пероральных препаратов, который приводит к выздоровлению более чем в 95% случаев.

Англия — одна из немногих стран в мире, которая уже превзошла целевой показатель, установленный Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) — лечение для 80% всех известных случаев заболевания. Смертность от вируса в стране за последние десять лет снизилась на 36%. Глобальная стратегия ВОЗ устанавливает следующие цели: снизить количество новых случаев заражения вирусом гепатита С по сравнению с 2015 годом на 90%, смертность — на 65%.

С 2022 года в рамках программы по тестированию NHS было выявлено 1900 новых случаев гепатита С. Пациентов в поликлиниках опрашивали, получали ли они переливание крови до 1996 года, чтобы выявить всех пострадавших во время скандала с зараженной кровью. (С 1970 по 1991 год десятки тысяч в Великобритании были инфицированы ВИЧ и вирусными гепатитами при переливании зараженной крови и ее продуктов; более 3000 человек умерло). Пациентам из групп риска, включая тех, кто проживал в странах Восточной Европы, также настоятельно рекомендуют пройти тестирование.

12.08.2026
95
0

Повышенная температура тела — классический механизм борьбы животных с инфекционными заболеваниями. У млекопитающих и птиц она повышается за счет физиологических механизмов, а эктотермные животные — рыбы, амфибии и рептилии — могут искать более теплую среду. (Это описано, например, для рыб.) Авторы статьи в BMC Biology продемонстрировали обратный пример — инфицированная амфибия ищет прохладную среду, чтобы снизить температуру тела. Эта стратегия, известная как поведенческое охлаждение, ранее наблюдалась у нескольких видов членистоногих, а также у крыс.

В эксперименте участвовали головастики прыткой лягушки (Rana dalmatina), инфицированные ранавирусами — опасными патогенами амфибий. Одна группа головастиков могла перемещаться в искусственном температурном градиенте, другую содержали при постоянной пониженной температуре. Зараженные головастики в воде с температурным градиентом предпочитали более прохладную воду, чем их здоровые собратья. Более того, чем выше была вирусная нагрузка у особи, тем ниже комфортная для нее температура. Со временем возрастала точность регуляции — головастик оставался в узком температурном диапазоне, избегая и пагубного чрезмерного холода. У головастиков, содержавшихся в прохладной воде, была значительно более низкая вирусная нагрузка к концу пятидневного эксперимента.

Кажущийся парадокс объясняется особенностями ранавируса, который использовали ученые. Он размножается быстрее при более высоких температурах, поэтому охлаждение дает дополнительное преимущество больной особи.

Ранавирусы представляют серьезную угрозу для различных видов амфибий. Результаты данного исследования показывают, что температурные градиенты в водоемах играют важную роль в их защите от инфекции, а изменение климата может ухудшить шансы популяции на выживание.


26.06.2026
142
0

В журнале The Lancet опубликован анализ доклада UNAIDS о ходе глобальной борьбы с ВИЧ. В 2025 году лечение получили больше людей, живущих с ВИЧ, чем когда-либо прежде. Число новых случаев заражения ВИЧ несколько снизилось, а смертность от СПИДа достигла самого низкого уровня за десятилетия. Но, по мнению докладчиков, глобальная борьба с ВИЧ находится под угрозой, поскольку инвестиции и политическая поддержка сокращаются.

В 2025 году в мире насчитывалось 40,9 млн человек, живущих с ВИЧ, больше, чем в 2024 году (40,6 млн) и 2010 году (32,5 млн). Этот рост во многом является результатом увеличения продолжительности жизни ВИЧ-инфицированных людей. Число смертей снизилось с 1,3 млн в 2010 году и с 600 тыс. в 2024 году до 570 тыс. в 2025 году. Прогресс в достижении целей UNAIDS 95-95-95 продолжается медленно: по оценкам, 88% людей с ВИЧ знают свой статус во всем мире, 89% из них получают лечение, у 95% людей, получающих лечение, вирусная нагрузка подавлена.

Количество новых случаев заражения ВИЧ сократилось на 43% в период с 2010 по 2025 год в странах Африки к югу от Сахары. Однако в других регионах, таких как Карибский бассейн, Восточная Европа, Центральная Азия, Ближний Восток и Северная Африка, эпидемии ВИЧ продолжают расти, а лечение и профилактика по-прежнему значительно отстают от целевых показателей.

В начале 2025 года была резко сокращена международная помощь в борьбе с ВИЧ, что отразилось на всех. Страны объединили усилия для поддержки программ по лечению, но многие профилактические программы испытывают трудности. Данные за 2025 год не отражают последствия сокращения финансирования, которые будут ощущаться еще долго. И это происходит в то время, когда было показано, что инъекционная доконтактная профилактика длительного действия может эффективно предотвратить заражение ВИЧ, и доступен целый ряд других вариантов профилактики. Тем не менее, в докладе UNAIDS содержится Глобальная стратегия по борьбе со СПИДом на 2026–2031 годы, в которой изложена амбициозная цель — обеспечить лечением 40 миллионов человек в течение следующих 5 лет.

20.05.2026
534
0

20 мая 2026 года на 72-м году жизни скоропостижно скончался доктор медицинских наук, профессор, академик РАН Вадим Валентинович Покровский, специалист в области профилактики и лечения ВИЧ-инфекции, сын академика В.И. Покровского (1929—2020).

В 1988–2001 гг. В.В. Покровский занимал должность заведующего специализированной лабораторией эпидемиологии и профилактики СПИД ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, с 2001 года — заместитель директора и руководитель Федерального научно-методического центра по борьбе и профилактике ВИЧ-инфекции в том же учреждении. Под его руководством были разработаны и внедрены тест-системы для диагностики ВИЧ, гепатитов В, С, D. Вадим Валентинович также был членом Ученого совета и заведующим лабораторией постгеномных технологий в НИИ медицины труда им. А.Ф.Измерова.

В.В. Покровский впервые в СССР выявил ВИЧ-инфицированных и больных СПИДом. Он возглавлял расследование нозокомиальной вспышки ВИЧ-инфекции 1988 года в Элисте (Калмыкия) и организовал ее локализацию, участвовал в создании эпиднадзора за ВИЧ, разработке законодательства в данной области, организации системы оказания медицинской помощи людям, живущих с ВИЧ, подготовил множество специалистов.

В 2000 году В.В. Покровский получил Государственную премию РФ за внедрение в медицинскую практику Фосфазида — нуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы, применяемого в комбинированной антиретровирусной терапии ВИЧ и гепатита В.

24.02.2026
570
0

Малоизученный тип вируса семейства Orthomyxoviridae — вирус гриппа D — встречается в основном у сельскохозяйственных животных. Пока неясно, насколько он опасен для человека, однако он может передаваться от вида к виду, а работники животноводческих хозяйств часто имеют антитела к нему. Ученые из Университета Огайо и Детской исследовательской больницы Св. Иуды в Мемфисе (США) собрали панель изолятов вируса гриппа D, полученных в 2011–2020 гг. от свиней и крупного рогатого скота и оценили их способность инфицировать клетки дыхательных путей человека. Препринт статьи опубликован на bioRxiv.

Исследования проводили на иммортализованных линиях эпителиальных клеток легких, первичных хорошо дифференцированных клетках эпителия дыхательных путей, а также на тонких срезах легких. Вирус гриппа D размножался в клетках и тканях дыхательных путей человека, достигая таких же титров, как и человеческий вирус гриппа А.

Авторы также исследовали реакцию клеток дыхательных путей человека на вирус гриппа D. По сравнению с вирусом гриппа А он вызвал значительно меньшую активацию сигнального пути регуляторного фактора интерферона (IRF), меньшую индукцию IFN-

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.