Ученые визуализировали главную протеазу коронавируса в клинических образцах с помощью флуоресцентно-меченых пептидов

Ученые из Польши, Германии и Бельгии синтезировали ингибитор главной протеазы (Mpro) SARS-CoV-2 и рассказали об этом в Nature Chemical Biology. Они отталкивались от литературных данных о том, что Mpro коронавирусов SARS-CoV и SARS-CoV-2 имеют много общих структурных и функциональных черт и обе разрезают пептидную связь, следующую за глутамином. Чтобы составить профили субстратной специфичности протеаз, ученые использовали подход HyCoSuL — гибридную комбинаторную библиотеку субстратов, которая состоит из тетрапептидов с различными аминокислотами в позициях P2–P4 и фиксированной аминокислотой в P1 (в данном случае в позиции P1 находился глутамин) и флуоресцентной меткой, активирующейся при разрезании пептида протеазой. На основе лучшего субстрата авторы сконструировали ингибитор Mpro SARS-CoV-2 и два зонда, определяющие активность протеазы. Противовирусное действие ингибитора была подтверждена на культуре клеток Huh7, зараженных SARS-CoV-2, а с помощью флуоресцентно-меченых пептидных зондов ученые визуализировали Mpro в клетках назофарингеального эпителия от пациента с подтвержденным COVID-19.

Главная протеза SARS-CoV-2 — привлекательная мишень для борьбы с вирусом. Ранее о синтезе панели ингибиторов Mpro сообщали исследователи из США. Другая команда предложила метод флуоресцентного скрининга потенциальных ингибиторов Mpro, основанный на репортерной системе с GFP.

Добавить в избранное

Вам будет интересно