Высокопроизводительная протеомика поможет в разработке противоядий от змеиных ядов

В Африке к югу от Сахары водится большое количество ядовитых змей. Каждый год в этом регионе от укусов змей страдают около 500 000 человек. Змеиные яды различаются по составу в зависимости от того, чем питается змея и от кого ей нужно защищаться. Эти различия важны и для врачей: от типа токсина зависят клинические проявления укуса. Однако существующие исследования состава ядов охватывают лишь небольшое количество видов змей. Датские ученые предложили решать эту проблему с помощью высокопроизводительной протеомики.

Они определили составы ядов 26 видов ядовитых змей, аспидов и гадюковых, имеющих наибольшую медицинскую значимость. Все образцы обрабатывались параллельно, в одном высокопроизводительном технологическом процессе. Кроме того, ученые проанализировали действие этих ядов in vitro. Результатом работы стали протеомные профили и функциональные профили для каждого из 26 ядов. Протеомы ядов змей Naja anchietae и Echis leucogaster были проанализированы впервые. По мнению авторов, полученные данные прольют свет на эволюцию ядов и будут полезны для разработки антидотов.

Добавить в избранное

Вам будет интересно

22.08.2023
513
0

Амилоидоз Аα-цепи фибриногена — редкое наследственное заболевание, при котором в почечных клубочках происходит отложение амилоидных фибрилл, индуцированное мутациями в гене соответствующего белка. У пациентов развивается болезнь почек, обычно прогрессирующая до терминальной стадии почечной недостаточности. До недавнего времени не было сообщений об этой патологии у других видов, кроме человека. Исследователи из Японии выполнили протеомный анализ образцов от 38 белок Sciurus lis, умерших в пяти зоопарках. Оказалось, что этот вид амилоидоза наблюдается у них удивительно часто (29 случаев из 38, или 76,3%). Среди особей старше 4 лет частота достигла 89%.

Масс-спектрометрия показала, что в амилоидогенезе у белок участвует С-концевая область Аα-цепи фибриногена, как и у людей. Однако у них, в отличие от людей, не было выявлено генных вариаций, отличающих амилоид-позитивные и амилоид-негативные белки; судя по всему, у японских белок это возрастное заболевание, присущее виду. Тем не менее они могут стать полезной моделью для поиска терапии этого заболевания, на данный момент неизлечимого.

12.10.2022
637
0

Illumina и AstraZeneca заключили стратегическое исследовательское партнерство по обнаружению мишеней для новых препаратов. Компании объединят возможности интерпретации генома на основе искусственного интеллекта (ИИ) и методы геномного анализа, что должно ускорить поиск.

Для интерпретации геномов партнеры будут использовать новое поколение инструментария Illumina на основе ИИ: PrimateAI и SpliceAI совместно с системой анализа AstraZeneca для открытия редких вариантов генов. Также будут применяться ИИ-платформы AstraZeneca — JARVIS и предикторы in silico. Анализ больших объемов мультиомных данных с помощью комбинированных инструментов будет проводиться в центре геномных исследований AstraZeneca.

«Благодаря выявлению генов, для которых есть доказательства причинно-следственной связи с заболеваниями человека, комбинированный подход к поиску имеет потенциал для определения приоритетных кандидатов в лекарства с повышенной вероятностью одобрения», — поясняет директор по стратегии и корпоративному развитию Illumina и исполняющий обязанности финансового директора Джойдип Госвами.

В случае успешного сотрудничества, финансовые детали которого не разглашаются, компании Illumina и AstraZeneca «оценят возможности для долгосрочного партнерства».

19.05.2022
606
0

Международная группа исследователей обнаружила в пещере на территории Лаоса зуб, который, возможно, принадлежал денисовцу. Костные останки этих древних людей ранее находили только в пещерах северной части Азии, прежде всего в Сибири. Коренной зуб находился в слое возрастом 131–164 000 лет — до того, как в регионе появились люди современного типа, отмечает Nature News.

Палеопротеомный анализ показал, что зуб принадлежал представителю рода Homo, а морфологический анализ исключил принадлежность H. floresiensis, H. luzonensis и H. sapiens. Вероятно, это зуб девушки (корень не полностью развит, а в эмали отсутствуют пептиды, ассоциированных с E-хромосомой). Морфология указывает на сочетание черт неандертальца и H. erectus, а также на сходство с зубами «денисовской челюсти» из Тибета. Если анализ ДНК подтвердит денисовское происхождение зуба, это будет вторая находка окаменелости денисовца за пределами Сибири.

«Это демонстрирует, что денисовцы, вероятно, жили также в Южной Азии. И это подтверждает результаты генетиков, которые говорят о том, что современные люди и денисовцы могли встретиться в Юго-Восточной Азии», — сказал автор исследования Клеман Занолли из Французского национального центра научных исследований и Университета Бордо. Миллионы современных людей из Азии, Океании и с островов Тихого океана несут следы денисовской ДНК в своих геномах.

01.11.2021
729
0

В среду, 10 ноября, швейцарская компания Buchi, производитель лабораторного оборудования, проведет вебинар об очистке, концентрировании и сушке белков и пептидов. Три эксперта компании расскажут, как настроить параметры для оптимизации процессов хроматографии, ротационного упаривания, лиофильной и распылительной сушки. В частности, будут освещены особенности распылительной и лиофильной сушки для приготовления лекарственных форм. Слушатели получат возможность повысить эффективность работы с белками и пептидами с помощью ценных советов и рекомендаций по каждой методике.

Вебинар пройдет с 13:00 до 14:00 по московскому времени на английском языке. Слушателям необходимо пройти бесплатную регистрацию по ссылке.

15.08.2021
719
0

Are you interested in cryo-EM and membrane proteins? WE ARE HIRING! Opening for a PhD position to work on the structure and function of human lipid transporters at VIB-VUB Center for Structural Biology in Brussels, Belgium.

What we offer VIB is an excellence-based entrepreneurial institute that focuses on translating basic scientific results into pharmaceutical, agricultural and industrial applications. VIB Center for Structural Biology Brussels is associated to the Vrije Universiteit Brussel (VUB) and houses research groups with a strong expertise in protein biochemistry, biophysics, nanobody technology, X-ray crystallography, NMR and electron microscopy.

Our group is interested in the structure and function of mammalian lipid transporters and in the membrane biology of the cell. In another line of research, we study the biophysics of ion channels of the endomembrane system and their role in neurodegenerative or neurological diseases such as Parkinson Disease. To advance our understanding in these fields we combine functional characterization (liposomal and cellular assays, fluorescence microscopy, electrophysiology) with a structural description of the involved proteins using cryo-EM and X-ray crystallography. Further details on available topics will be discussed during the interviews.

You will have access to state-of-the-art research facilities such as the VIB-VUB facility for Bio Electron Cryogenic Microscopy equipped with a 300 kV JEOL cryoARM300 electron microscope and K3 detector as well as the VIB Nanobody Core.

PhD students will have access to an extensive scientific and transferable skills training programs available through our affiliated institutes.

Start of the PhD student position can be negotiated, but ideally October or November 2021.

PhD students are further encouraged to apply for an FWO-fellowship to acquire their own funding (call deadline March 2022). Candidates will be assisted for the funding application.

Your profile

You are an enthusiastic, highly motivated and curiosity-driven personality with a strong background in biochemistry/biology/biotechnology and an interest in membrane proteins and organelle biology. Independent and critical thinking and good organizational skills are a prerequisite. You hold a university degree in biochemistry/biology or in a related discipline. Hands-on experience with either protein purification, cryo-EM or mammalian cell culture is required.

More information on the lab available at: vib.be/labs/brunner-lab

Motivated candidates are asked to apply online: vib.be/labs/brunner-lab