10x Genomics намерена подать в суд на Illumina за нарушение патентов

Зарегистрироваться

Реклама. Рекламодатель ООО «Скайджин» ИНН 7705997147

На первый взгляд миграция клеток мезодермы во время гаструляции выглядит неорганизованной. Авторы статьи в The EMBO Journal убедились в обратном — отследив раннее формирование сердца в мышином эмбрионе, они показали, что распределение клеток в зарождающихся сердечных камерах четко скоординировано во времени и пространстве.

Исследователи применили микроскопию плоскостного освещения (light-sheet microscopy), чтобы получить 3D-изображения сердца в эмбрионе мыши. Для удобства визуализации клетки были помечены флуоресцентными белками. Таким способом ученые отследили перемещение и деление отдельных клеток с шестого по восьмой дни эмбрионального развития — от гаструляции до формирования сердечной трубки.

Выяснилось, что в определенное время в формирующейся сердечной трубке закладывались прогениторные клетки, дающие начало исключительно миоцитам левого желудочка или предсердий. И те, и другие происходили из проксимальной мезодермы, но предшественники левого желудочка дифференцировались рано, формируя изгиб сердечной трубки, а предсердные предшественники затем образовывали области притока сердечной трубки. Также в сердце обнаружились короткоживущие мультипотентные прогениторы — их потомки активно мигрировали и давали начало различным клеткам в зависимости от области сердца, в которой завершалась их миграция. Присутствие таких мультипотентных клеток говорит о пластичности раннего развития. Наконец, авторы убедились, что сестринские клетки, происходящие от одного предшественника, координировались между собой теснее всего.

Регистрация открыта до 28 июня 2024 года.

Информация от Оргкомитета #ASCAinfo :

• лабораторные практики и мастер-классы, практикум и хакатон по биоинформатике идут параллельно; можно выбрать только одно мероприятие

• участие в лабораторных практиках, практикуме и хакатоне по биоинформатике – строго после предварительного отбора заявок

• если вы хотите принять участие в Круглом столе в качестве спикера, при регистрации, пожалуйста, укажите название доклада и прикрепите тезисы.

Реактивы для практик, как всегда, предоставляет компания SkyGen — лидер в области анализа единичных клеток в России.

Ждем ваших заявок, и до встречи в августе в Томске!

Реклама. Рекламодатель ООО "Скайджин" ИНН 7705997147

NanoString, которую Bruker приобрела после ее банкротства, планирует обратиться в Высший земельный суд Германии в Мюнхене с просьбой окончательно снять запрет на продажу ее продуктов CosMx Spatial Molecular Imager в Германии. Первоначально судебный запрет был вынесен в мае 2023 года Нижним земельным судом Мюнхена, но отменен в декабре Высшим земельным судом при условии выплаты залога.

В своем постановлении 7 мая Федеральный патентный суд Германии признал недействительным европейский патент 10x Genomics № 2794928B1 на территории Германии. 10x утверждала, что продукты NanoString CosMx SMI для детекции РНК нарушают этот патент. Решение Федерального патентного суда Германии опровергает это утверждение.

Банкротство NanoString отчасти произошло из-за выплаты 10x Genomics $31 млн по итогам патентного спора в США, связанного с платформой для пространственного профилирования РНК GeoMx.

В феврале Апелляционный суд Европейского единого патентного суда (UPC) отменил предварительный запрет, вынесенный мюнхенским отделением UPC в сентябре, на продажу продуктов CosMx SMI в 16 странах-членах UPC.

«Мы твердо убеждены, что патент ‘928, полученный известным доктором Джорджем Черчем из Гарварда, действителен и охватывает важные in situ технологии. Мы полны решимости доказать это», — заявила Кристен Кардилло, вице-президент по корпоративным коммуникациям 10x.

Детекция циркулирующих в крови опухолевых клеток позволит надежней выявить опухоль при скрининге, оценить ее стадию, ответ на лечение или прогрессию. Однако существующие методы идентификации этих клеток, основанные на экспрессии раковых антигенов, зачастую недостаточно эффективны. Одной из перспективных альтернатив может стать ИК-Фурье-спектроскопия (FTIR), позволяющая разделять клетки на основе их биохимического состава. Международный коллектив исследователей проверил, насколько надежен этот метод для детекции опухолевых клеток, и обнаружил, что он позволяет идентифицировать единичные клетки рака легкого в крови.

Авторы работы применили FTIR-микроспектроскопию в сочетании с классификатором случайного леса (Random Forest). Ученые руководствовались тем, что детекция циркулирующих опухолевых клеток подразумевает их выявление среди клеток крови, поэтому они взяли раковые клетки и смешали их с мононуклеарными клетками периферической крови. В исследовании использовались клеточные линии A549 (аденокарцинома) и CALU-1 (плоскоклеточная карцинома). Обучение классификатора проводили на тех же типах клеток — в обучающий набор вошли ИК-Фурье спектры отдельных клеток А549 и периферических мононуклеаров либо CALU-1 и периферических мононуклеаров. Предложенный исследователями метод позволил выявить отдельные раковые клетки в образцах в обоих случаях.

Ученые также проверили, сможет ли их методика детектировать клетки рака легкого, отличные от тех, что использовались в обучении классификатора. Для этого в обучающий набор включили спектры клеток А549, а затем использовали классификатор для детекции CALU-1 в образцах. Результаты показали, что FTIR-спектры А549 можно использовать для обучения классификатора и при необходимости детектировать клетки другого подтипа рака легких. Аналогичным образом, при обучении на CALU-1 метод позволял детектировать в образцах отдельные клетки А549.

Метод может стать скрининговым инструментом в тех случаях, когда для дальнейшей характеризации опухоли необходимы живые циркулирующие опухолевые клетки. Авторы исследования планируют проверить, применима ли их методика к другим типам опухолей, а также усовершенствовать предложенные в работе алгоритмы идентификации раковых клеток.