SkyGen приглашает на школу анализа единичных клеток ASCA WORKSHOP 2024 в Томске!

NanoString, которую Bruker приобрела после ее банкротства, планирует обратиться в Высший земельный суд Германии в Мюнхене с просьбой окончательно снять запрет на продажу ее продуктов CosMx Spatial Molecular Imager в Германии. Первоначально судебный запрет был вынесен в мае 2023 года Нижним земельным судом Мюнхена, но отменен в декабре Высшим земельным судом при условии выплаты залога.

В своем постановлении 7 мая Федеральный патентный суд Германии признал недействительным европейский патент 10x Genomics № 2794928B1 на территории Германии. 10x утверждала, что продукты NanoString CosMx SMI для детекции РНК нарушают этот патент. Решение Федерального патентного суда Германии опровергает это утверждение.

Банкротство NanoString отчасти произошло из-за выплаты 10x Genomics $31 млн по итогам патентного спора в США, связанного с платформой для пространственного профилирования РНК GeoMx.

В феврале Апелляционный суд Европейского единого патентного суда (UPC) отменил предварительный запрет, вынесенный мюнхенским отделением UPC в сентябре, на продажу продуктов CosMx SMI в 16 странах-членах UPC.

«Мы твердо убеждены, что патент ‘928, полученный известным доктором Джорджем Черчем из Гарварда, действителен и охватывает важные in situ технологии. Мы полны решимости доказать это», — заявила Кристен Кардилло, вице-президент по корпоративным коммуникациям 10x.

Детекция циркулирующих в крови опухолевых клеток позволит надежней выявить опухоль при скрининге, оценить ее стадию, ответ на лечение или прогрессию. Однако существующие методы идентификации этих клеток, основанные на экспрессии раковых антигенов, зачастую недостаточно эффективны. Одной из перспективных альтернатив может стать ИК-Фурье-спектроскопия (FTIR), позволяющая разделять клетки на основе их биохимического состава. Международный коллектив исследователей проверил, насколько надежен этот метод для детекции опухолевых клеток, и обнаружил, что он позволяет идентифицировать единичные клетки рака легкого в крови.

Авторы работы применили FTIR-микроспектроскопию в сочетании с классификатором случайного леса (Random Forest). Ученые руководствовались тем, что детекция циркулирующих опухолевых клеток подразумевает их выявление среди клеток крови, поэтому они взяли раковые клетки и смешали их с мононуклеарными клетками периферической крови. В исследовании использовались клеточные линии A549 (аденокарцинома) и CALU-1 (плоскоклеточная карцинома). Обучение классификатора проводили на тех же типах клеток — в обучающий набор вошли ИК-Фурье спектры отдельных клеток А549 и периферических мононуклеаров либо CALU-1 и периферических мононуклеаров. Предложенный исследователями метод позволил выявить отдельные раковые клетки в образцах в обоих случаях.

Ученые также проверили, сможет ли их методика детектировать клетки рака легкого, отличные от тех, что использовались в обучении классификатора. Для этого в обучающий набор включили спектры клеток А549, а затем использовали классификатор для детекции CALU-1 в образцах. Результаты показали, что FTIR-спектры А549 можно использовать для обучения классификатора и при необходимости детектировать клетки другого подтипа рака легких. Аналогичным образом, при обучении на CALU-1 метод позволял детектировать в образцах отдельные клетки А549.

Метод может стать скрининговым инструментом в тех случаях, когда для дальнейшей характеризации опухоли необходимы живые циркулирующие опухолевые клетки. Авторы исследования планируют проверить, применима ли их методика к другим типам опухолей, а также усовершенствовать предложенные в работе алгоритмы идентификации раковых клеток.