ASCA WORKSHOP 2024: секвенирование единичных клеток от SeekGene и SkyGen

erid: 2Vfnxwd92sA

Технологии анализа единичных клеток кардинально изменили возможности фундаментальной биологии и медицины и продолжают открывать новые горизонты перед исследователями. Пять лет назад они были новинкой, которой умели пользоваться немногие, теперь это «мастхэв». Секвенирование единичных клеток находит применение в молекулярной биология, онкологии, иммунологии, эмбриологии и морфологии и других областях.

 Евгений Денисов, д.б.н., зав. лабораторией биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии ТНИМЦ РАН, зав. лабораторией биологии единичных клеток РУДН

Главная цель ASCA WORKSHOP в России — знакомить отечественных исследователей с новейшими подходами в этой сфере, помогать освоить технологии, предоставлять возможность поработать с приборами и реагентами.

Специалисты компании SkyGen совместно с командой SeekGene провели в Томске обучающие практикумы.

Сотрудники SkyGen Максим Пальянов, Татьяна Буканова, Тимур Ягудин   

●       Впервые на школе был выполнен протокол Full-length single cell transcriptomics от SeekGene, который позволяет исследовать РНК не только с 3’- и 5’-концов, а с помощью технологии random primers получать транскрипты полной длины. Это дает возможность изучать характеристики экспрессии типов клеток с мутантными генами, изменения в сигнальных путях, сплайсинг-варианты.

 Александр Петров, руководитель продаж по СФО

●       Участники воркшопа по single-cell иммунному профилированию поставили протокол 5’-BCR и TCR с помощью наборов SeekOneDD Single Cell 5’ Transcriptome-seq Kit, SeekOneDD TCR/BCR amplification Kit и станции SeekOne DD. Протокол применяется для исследования гетерогенности Т- и В-клеток, разнообразия T- и B-клеточных рецепторов, антигенной специфичности, профилирования экспрессии генов и т.д.

●       Еще на одном мастер-классе компания SeekGene представила свою новинку для пространственной транскриптомики — SeekSpace, которая дает информацию о генетической экспрессии в образце ткани и отображает ее локализацию.

●       Руководитель научной поддержки SkyGen Тимур Ягудин провел воркшоп по нанопоровому секвенированию, поскольку теперь доступен протокол секвенирования библиотек единичных клеток на платформах третьего поколения.

Участники познакомились с первым отечественным нанопоровым секвенатором «Нанопорус» производства одноименной компании. Секвенатор «Нанопорус» обладает технологией длинных прочтений, имеет собственное автономное ПО, совместим с наборами и ячейками ONT и быстро доставляется в лаборатории.

●       На круглом столе специалист SkyGen по NGS и single cell Татьяна Буканова выступила с докладом «Never Stop Evolving: solutions for your best single-cell research». Темой доклада были последние новинки: счетчик клеток, наборы для анализа единичных клеток FFPE-образцов, наборы для пространственной транскриптомики и, конечно, протокол анализа single-cell библиотек на нанопоровых секвенаторах.

Узнать больше можно через менеджеров SkyGen:  sales@skygen.com