ПАП-мазок поможет выявить рак яичников
Рак яичников обычно диагностируют поздно, поэтому выживаемость у него низкая. Необходимы новые методы скрининга. Известно, что при раке яичников ПАП-мазки (которые обычно используют для выявления рака шейки матки) содержат опухолевую ДНК, причем она выявляется за годы до постановки диагноза. Итальянские ученые использовали показатель геномной нестабильности, чтобы отличить мазки женщин, у которых впоследствии диагностировали рак яичников, от мазков здоровых женщин. Специфичность, чувствительность и точность такого теста составили 96%, 75,38% и 81,11% соответственно.
Рак яичников, в том числе серозный рак яичников высокой степени злокачественности, обычно выявляют очень поздно. Это связано с отсутствием специфических симптомов на ранней стадии. Также нет одобренных методов скрининга. Раннее выявление рака яичников могло бы повысить выживаемость.
Недавно полученная информация об эволюции серозного рака яичников высокой степени злокачественности дает надежду на развитие новых методов скрининга. Чаще всего этот рак начинается не в яичниках, а в фаллопиевых трубах как серозная трубная интраэпителиальная карцинома (STIC). Для STIC характерны мутации в гене TP53 и анеуплоидия. Фаллопиевы трубы соединены с полостью матки, поэтому раковая ДНК может обнаруживаться в мазке Папаниколау (ПАП-мазке). Впервые это было показано еще в 2013 году. С тех пор исследователи сосредоточились на отслеживании мутаций в гене TP53. Однако у этого подхода есть недостатки. Для разработки диагностического теста необходимо знать, какие мутации произошли в опухоли. К тому же TP53 часто мутирует в нормальных тканях.
В новой работе исследователи из Италии пошли по другому пути. На основе изменений числа копий генов в соматических клетках (somatic copy number alterations, SCNA) в ДНК мазков они создали новый тест для раннего выявления рака яичников (Early oVArian cancer, EVA).
Авторы проанализировали 250 архивных мазков, полученные у 113 женщин без симптомов, у которых впоследствии выявили рак яичников, а также у 77 здоровых женщин. Все образцы разделили на две равнозначные группы, одну из которых использовали для создания теста, а вторую — для валидации.
SCNA редко обнаруживаются в здоровых тканях, но часто — в раковых. Исследователи использовали полногеномное секвенирование с низким покрытием на ДНК мазков и опухолей, чтобы вычислить SCNA. Чаще всего изменения затрагивали области 3q26.31/8q24.12 и 16q21/12q24.13. В большей части (89%) мазков женщин с раком были выявлены SCNA. В отдельных случаях нарушения детектировались за шесть лет до диагностики рака.
Однако SCNA менялись со временем и отличались от образца к образцу. Авторы решили обратить внимание не на конкретные SCNA, а на общую геномную нестабильность в виде оценки CPA (copy number profile abnormality). Чем выше CPA, тем больше геномная нестабильность. У здоровых женщин распределение CPA отличалось от женщин с раком. Авторы определили три интервала: отрицательный, неопределенный и положительный. После уточнения значений интервалов специфичность, чувствительность и точность теста составили 96%, 75,38% и 81,11% соответственно.
Авторы продемонстрировали возможность идентификации областей анеуплоидии в ДНК мазка, несмотря на высокую вариабельность профилей SCNA. Они считают, что создание теста для ранней детекции рака яичника на основе анализа ДНК из мазков возможно.
Источник:
Lara Paracchini, et al. Genomic instability analysis in DNA from Papanicolaou test provides proof-of-principle early diagnosis of high-grade serous ovarian cancer // Science Translational Medicine (2023), published 06 December 2023, DOI: DOI: 10.1126/scitranslmed.adi2556