Закисление цитоплазмы помогает бактериям пережить воздействие антибиотиков

Клетки E. coli, выжившие после воздействия антибиотиков в экспериментах по направленной эволюции, накапливают мутации в комплексе I дыхательной цепи переноса электронов. Мутации нарушают танспорт протонов, что приводит к увеличению кислотности цитоплазмы и остановке синтеза белков. Из-за этого антибиотики, нацеленные на синтез белка, теряют эффективность.

Бактериальные клетки с повышенной кислотностью цитоплазмы (желтые) и обычные.

Credit: KU Leuven | CC BY-SA | Пресс-релиз

Международная группа ученых обнаружила, что отклонения метаболического гомеостаза бактерий может приводить к развитию антибиотикорезистентности. В экспериментах на E. coli показано, что резистентность обеспечивают мутации в комплексе I — первом мультибелковом комплексе дыхательной цепи переноса электронов.

В предыдущей работе эти же авторы отметили, что в отдельно взятой клональной популяции бактерий при воздействии антимикробных препаратов никогда не погибает 100% клеток. Если многократно отбирать выжившие клетки, культивировать их, затем снова обрабатывать тем же препаратом, то в определенный момент чувствительными останутся только 50% всех клеток. Новая работа посвящена исследованию механизмов формирования резистентности. этому вопросу.

Ученые использовали 37 популяций лабораторного штамма E. coli, которые ранее подвергались воздействию антибиотиков амикацина, канамицина, тобрамицина или гентамицина. Для сравнения были добавлены три популяции уропатогенного штамма UTI89, которые эволюционировали в присутствии амикацина и в процессе эволюции значительно повысили резистентность к нему.

Полногеномное секвенирование 40 популяций E. coli, выполненное после завершения эволюции, выявило большое количество мутаций в 
опероне nuo. Этот оперон объединяет 13 генов, ответственных за комплекс I. Мутации чаще всего встречались в последовательностях мембранных компонентов комплекса, участвующих в переносе протонов. Дополнительные эксперименты подтвердили связь мутаций в nuo с резистентным фенотипом бактерии.

Оказалось, что нарушение переноса протонов приводит к увеличению кислотности цитоплазмы. При этом чем ниже были значения pH цитоплазмы, тем выше была устойчивость к антибиотикам. Протеомный анализ показал, что рост кислотности приводит к остановке синтеза белка и белкового обмена. Это делает бесполезными антимикробные препараты, такие как амикацин, для которых синтез белка служит мишенью.

Ученые также выяснили, что при повышении кислотности цитоплазмы активируется сигма-фактор RpoS — регулятор ответа на стресс. Выключение гена rpoS снижало устойчивость E. coli к антибиотикам.

Таким образом, в работе описана молекулярная основа резистентности, связанной с изменениями метаболизма бактерии. Авторы отмечают, что в экспериментах по направленной эволюции они получили множество других резистентных популяций с мутациями, затрагивающими в основном транспорт ионов или заряженных молекул, и собираются продолжить исследования.

Источник

Bram van der Bergh, et al. Mutations in respiratory complex I promote antibiotic persistence through alterations in intracellular acidity and protein synthesis // Nature Communications, published: 27 January 2022.; DOI: 10.1038/s41467-022-28141-x

Добавить в избранное

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.