J.P. Morgan Healthcare 2022. День первый: Seer, Twist, 10x, Guardant, Natera, Bruker, Adaptive, Qiagen, Sema4

Seer

Председатель и генеральный директор Seer Омид Фарохзад объявил, что компания начала широкие коммерческие продажи платформы Proteograph для протеомного анализа. По его словам, уже принято множество заказов.

Это случилось после года поставок платформ ряду пользователей в рамках программы раннего доступа. Пользователи изучали возможности системы в таких областях, как поиск биомаркеров, глубокое протеомное профилирование плазмы и гликопротеомика.

Фарохзад также рассказал о соглашении Seer с компанией Sciex, специализирующейся на масс-спектрометрии, и Discovery Life Sciences, одной из компаний программы раннего доступа. Соглашение предполагает создание Протеогеномного консорциума (Proteogenomics Consortium), цель которого — дать возможность специалистам по геномике включать в исследования протеомные данные. Консорциум должен достигнуть производительности, позволяющей обрабатывать 100 000 образцов в год. Он будет использовать систему Proteograph и масс-спектрометр ZenoTOF 7600. Консорциум начнет предлагать услугу по анализу во второй половине 2022 года.

Омид Фарохзад добавил, что Seer запустила программу Center of Excellence, в рамках которой компания будет предлагать свою технологию вместе с различными обслуживающими компаниями, в том числе с Evotec, южнокорейской Soulbrain, Biodesix, Discovery Life Sciences и Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute.

Система Proteograph основана на обогащении белков из образцов, таких как плазма человека, с использованием наночастиц. Это позволяет проводить более глубокий протеомный анализ с высокой производительностью. При инкубации с образцом наночастицы собирают на себя белки, которые формируют «корону». Это означает, что с помощью наночастиц белки можно вытаскивать из образца, а затем идентифицировать и определять из количество с помощью, например, масс-спектрометрии.

К началу 2022 года Seer провела несколько крупномасштамных исследований, используя эту технологию. Среди них исследование рака простаты, проведенное на 1 000 образцов сыворотки, в рамках которого велся поиск клинически значимых биомаркеров; мультиомное исследование биомаркеров рака в когорте из примерно 2 000 образцов; проект, посвященный старению, с 1 500 образцов.

Говоря о спросе на платформу Proteograph, Фарохзад отметил, что львиную долю первых продаж должна обеспечить промышленность, так как в академии цикл продаж более длительный.

В августе 2021 года Seer вышла на китайский рынок, заключив соглашение о продажах, маркетинге и поддержке клиентов с Enlight Medical. Финансовый директор Дэвид Хорн сказал, что компания ожидает скромные продажи в Китае в 2022 году, но интерес к Proteograph довольно высок. По его словам, COVID-19 создает трудности при поиске людей для обучения и установки приборов.

Seer учла фидбек ранних пользователей платформы и теперь разрабатывает подходы для снижения необходимого объема образца и числа инъекций для масс-спектрометрии на один эксперимент. Это позволит повысить производительность. Кроме того, компания ищет способы упростить интеграцию протеомных данных, полученных с помощью системы, с другими типами омиксных данных.

Twist Bioscience

Генеральный директор Twist Bioscience Эмили Лепруст представила новую химию для ферментативного синтеза ДНК, разработанную исследователями компании.

Новая химия значительно сокращает количество нукледотидтрифосфатов по сравнению с существующими методами. Это снижает стоимость и делает производство более устойчивым. Кроме того, технология не оставляет «шрамов», и полученная ДНК взаимозаменяема с природной ДНК.

По словам Лепруст, предыдущие методы ферментативного синтеза были больше подвержены ошибкам, давали более короткие олиги и обходились дороже. Ошибки допускались с частотой 1 на 400 п. о. против 1 на 2 000 п. о. при химическом синтезе. Олиги были короче 100 п. о. против 300 п. о. и стоили $50 за один олигонуклеотид по сравнению с $0,03. Эмили Лепруст считает, что новый метод ферментативного синтеза может быть полезным для хранения данных, что выльется в новую линейку продуктов. Однако компания не предоставила данных по частоте ошибок, длине олигов или стоимости нового ферментативного метода.

Twist продолжит использовать существующую фосфорамидитную химию, пока оптимизируется новый метод. По мнению компании, ферментативный синтез играет критическую роль для хранения данных в ДНК, создания праймеров и зондов для ПЦР, бесклеточного получения плазмидной ДНК, количественной ПЦР и других приложений. Компания с нетерпением ждет расширения своего рынка за счет предложения этих приложений как напрямую по своим каналам, так и через договоры об изготовлении оборудования.

Лепруст отмечает, что база для роста корового бизнеса заложена, и 2022 будет годом монетизации для биофармы. Компания подтвердила прогноз выручки за 2022 фискальный год — она должна составить $183–193 млн.

Биофармацевтический спинаут Twist, компания Revelar Biotherapeutics, выведет свое первое кандидатное терапевтическое антитело в клинику в первой половине 2022 года. Revelar лицензировала антитело для лечения COVID-19 при финансировании от Twist на сумму до $10 против до $100 на промежуточном этапе и средним однозначным числом млн. роялти.

Работа Twist над чипом для хранения данных в ДНК продожается.

Эмили Лепруст также подчеркнула партнерство с Pacific Biosciences и Singular Genomics, нацеленное на кастомизацию процессов обогащения мишеней секвенирования и подготовки библиотек для платформ этих компаний.

10x Genomics

Генеральный директор 10x Genomics Серж Саксонов представил несколько новых продуктов, которые компания планирует выпустить в этом и следующем году.

Компания выведет на клинический и трансляционный рынок новый кит для РНК-профилирования, который предназначен для работы с образцами, зафиксированными в параформальдегиде. Новая химия сделает проще сбор образцов в мультицентровых клинических исследованиях. По словам Саксонова, кит подходит для получения полных транскриптомов и для измерения некоторых белков по технологии баркодирования 10x. Старт продаж намечен на середину 2022 года.

Кроме того, в 2022 году появятся платформы для изучения антител и T-клеточных рецепторов — BEAM-Ab и BEAM-T соответственно. Совмещение баркодирования антигенов с софтом для анализа B- и T-клеточного связывания позволит масштабировать исследования. Саксонов отмечает, что BEAM-Ab — это эффективная платформа для всестороннего изучения антител. В собственном исследовании специалисты 10x искали антитела против SARS-CoV-2. В течение недели они обнаружили 55 человеческих нейтрализующих антител широкого спектра с пикомолярной аффинностью. Два из них проявляли панкоронавирусную активность.

Саксонов подтвердил, что инструмент CytAssist, совместимый с платформой для пространственной транскриптомики Visium и предназначенный для подготовки гистологических стекол, появится на рынке в этом году. К настоящему времени с помощью Visium сделано 185 научных работ, опубликованных в виде статей и препринтов.

Серж Саксонов также впервые представил платформу Xenium для анализа in situ. Платформа позволяет детектировать одноцепочечную ДНК, РНК и белки с субклеточным разрешением как в зафиксированных, так и в замороженных образцах. Компания планирует продавать как готовые, так и кастомизированные панели.

В 2020 году 10x приобрела ReadCoor и Cartana. С тех пор ее разработки в области анализа in situ считаются многообещающими. «Главная сложность при анализе in situ — работа с фундаментальной химией тканей. Поэтому мы уделяем этому так много внимания. Когда платформа попадет в руки пользователю, она будет работать», — говорит Саксонов.

Компания предоставит «технологический доступ» к платформе Xenium позже в этом году. Коммерческий запуск намечен на 2023 год.

10x отмечает снижение активности европейских клиентов в декабре, что связано с распространением варианта SARS-CoV-2 омикрон. Об этом рассказал финансовый директор компании Джастин МакАнир. «Нам предстоит увидеть значительные изменения в ситуации», — добавил он.

Саксонов отметил, что установленная база компании увеличилась до 3 500 инструментов. Он предположил, что из более чем 90 000 исследователей, которые подали заявки на гранты Национальных институтов здравоохранения, около 50 000 могут иметь преимущество благодаря использованию технологий единичных клеток.

Guardant Health

Через три года после выхода на биржу компания Guardant Health имеет 200 млн. застрахованных жизней, $1,7 млрд. на балансе и совокупный годовой рост в 59%. Более 250 000 тестов было заказано более чем 11 000 онкологов; компания работает с примерно сотней биофармацевтических партнеров.

Генеральный содиректор Guardant Хельми Элтухи отметил, что 18 месяцев назад компания предлагала единственный продукт, теперь же портфолио расширилось до пяти.

Продолжается активное внедрение жидкой биопсии Guardant 360. Компания также запустила тесты Guardant 360 Response, Tissue Next и Guardant Reveal. Диагностический тест Guardant 360 стал первым комплексным анализом жидкой биопсии, получившим одобрение FDA.

К настоящему времени компания опубликовала 250 работ, описывающих тесты и текущие клинические испытания. В 2022 году, с открытием предложений по всем типам ведения больных с раком, для Guardant должна начаться новая глава, считает генеральный содиректор АмирАли Таласаз.

Тест Guardant Reveal был запущен в 2021 году. Компания ожидает расширения его применения с колоректального рака до мультиракового тестирования. Этому должны поспособствовать результаты исследования ORACLE, посвященного 11 типам солидных опухолей. Исследование проходит в 30 учреждениях США и Испании, в нем участвуют более 1 000 пациентов. Результаты откроют 20-миллиардный рынок тестирования на минимальную остаточную болезнь.

Reveal уже хорошо показал себя при детекции минимальной остаточной болезни у пациентов с колоректальным раком и раком молочной железы. Интеграция геномных и эпигеномных сигналов циркулирующей опухолевой ДНК увеличивает чувствительность в 2,5 раза.

В 2022 году Guardant собирается запустить платформу Smart для жидкой биопсии. Она будет в 100 раз больше, чем 360, и чувствительность ее будет выше. Это позволит оценивать геномные, эпигеномные и иммунные сигнатуры.

По мнению Таласаза, к 2023 году бизнес-сегмент скрининга рака значительно вырастет. Guardant в 2022 году должна получить результаты клинического исследования ECLIPSE и подать в FDA заявку на одобрение теста Next Generation Guardant Shield во второй половине года. В первой половине года компания планирует запустить этот тест как LDT. Панель теста будет расширена с 500 килобаз до 16 мегабаз.

Кроме того, должно начаться проспективное исследование рака легкого SHIELD Lung с участием около 10 000 пациентов из группы высокого риска. Это поспособствует одобрению FDA и страховому покрытию Medicare и Medicaid.

Natera

Генеральный директор Natera Стив Чапмен рассказал о последних достижениях компании в области неинвазивной пренатальной диагностики и о подходах к тестированию при трансплантации и онкологии.

Компания опубликовала более 100 исследований своих продуктов, проведенных специалистами трех подразделений. В исследованиях приняли участие 1,3 млн. пациентов, проведено более 3 млн. тестов.

Прошедший год, по словам Чапмена, стал годом трансформации. Прирост в тестировании составил 52% в годовом сравнении. Исследование SMART вкупе с поддержкой пренатального тестирования Американским колледжем акушерства и гинекологии (ACOG) в августе 2020 года также способствовало росту. Natera ожидает дальнейшего продвижения на рынке беременностей среднего риска и 90-процентного проникновения на этот рынок в ближайшие годы.

Чапмен подробно описал потенциальный случай одобрения ACOG неинвазивного пренатального тестирования на делецию 22q11.2. Положительная прогностическая ценность теста составляет 53%, что вкупе с ранним вмешательством может предотвратить повреждение мозга у детей с этой делецией.

Стив Чапмен представил первые результаты исследования Trifecta, в котором оценивался тест Prospera, предназначенный для детекции отторжения донорской почки. Окончательные результаты ожидаются в текущем квартале. С тестами Prospera, в том числе с Prospera Heart и Prospera Lung, компания планирует открыть 50-миллиардный рынок тестирования реципиентов донорских органов.

Natera также ожидает результатов исследования Circulate-IDEA, в рамках которого оценивается тест на минимальную остаточную болезнь Signatera, предназначенный для пациентов с колоректальным раком. Результаты будут представлены через две недели на конференции ASCO-GI.

По словам Чапмена, цель, заданная для Signatera на следующие два года, — включение в рекомендации по колоректальному раку Национальной комплексной онкологической сети, а также страховое покрытие Medicare и Medicaid для колоректального рака и частное страховое покрытие для пяти других типов рака.

Bruker

Генеральный директор компании Bruker Фрэнк Локиен сообщил об ожидаемых финансовых результатах за четвертый квартал 2021 года — от 665 до 670 млн. долларов. В предыдущем году за тот же период финансовые результаты составили $627,5 млн., так что ожидается рост в 6­–7%. Органический рост в годовом сравнении составил 8–9%. Аналитики ожидают доход в $660,7 млн. за четвертый квартал.

Компания ждет доход в размере $2,4 млрд. за 2021 год, что соответствует прогнозам аналитиков и представляет собой рост в 21% по сравнению с $1,99 млрд. в предыдущем году; органический рост составил 18%.

Локиен объявил, что в 2021 году Bruker ожидает прибыль на акцию в $2,00, то есть в годовом сравнении рост составил более 50%. Аналитики называют цифру $2,09.

Bruker видит «возможности прорыва» в областях протеомики и пространственной биологии, которые являются частью инициатив проекта Accelerate 2.0.

Локиен отметил, что в 2021 году компания объявила о запуске кита MBT Sepsityper, который получил одобрение FDA. Этот кит работает с системой MALDI Biotyper, принадлежащей Bruker, и позволяет идентифицировать более 425 культивируемых микроорганизмов из образца крови менее, чем за 30 минут. Компания обучила более 100 клиентов работе с китом за прошлый год, причем как пользователей системы MALDI Biotyper, так и новых клиентов.

В 2021 году компания Bruker впервые продала более 600 единиц приборов MALDI Biotyper. К настоящему моменту компания установила более 5000 единиц; это их самая прибыльная часть бизнеса.

Компания Bruker разработала систему, пока только для исследований, которая позволяет быстро определить устойчивость к антибиотикам. Ее клинические испытания начнутся приблизительно в середине 2022 года.

В 2021 году также хорошо работало направление протеомики; предположительно, оно принесет компании $250 млн. или даже больше. На 30% выросли доходы от timsTOF платформы 4D-Proteomics для визуализации результатов масс-спектрометрии. Доходы превысили $100 млн.; было установлено 425 единиц.

Компания ожидает, что платформа timsTOF получит все большее распространение. Bruker уже получила десять заказов на новую платформу для изучения протеомики единичных клеток, которую компания запустила в прошлом июне.

Bruker запустила настольную систему Fourier 80 FT-NMR в Европе в 2020 году, в Америках — в первой половине 2021 года, в Азиатско-Тихоокеанском регионе — во второй половине 2021 года. Система стоит $100 000 или меньше в зависимости от конфигурации и автоматизации. Локиен считает, что она быстро найдет свое место в индустрии и в академических кругах. В 2021 году было продано 50 единиц прибора.

По словам аналитика SVB Leerink Пунита Суды, 2021 год был хорошим годом для Bruker, что объясняется оживлением индустрии и области исследований и спросом, рождаемым их растущим фармакологическим сегментом.

Финальный отчет по финансовым результатам за четвертый квартал и по итогам за 2021 год, а также планы на 2022 год будут готовы к середине февраля.

Adaptive Biotechnologies

Генеральный директор компании Adaptive Biotechnologies Чад Робинс описал ход развития двух основных направлений компании — иммунологии и тестирования на минимальную остаточную болезнь при раках крови.

В области иммунологии Adaptive Biotechnologies приобрела большой опыт в ходе пандемии COVID-19 и надеется использовать его для диагностики, исследований и разработки терапии других заболеваний.

По словам Робинса, проанализировав специфичные для COVID-19 данные по иммунным рецепторам, компания смогла запустить тест T-Detect для клинической диагностики, помочь разработчикам вакцин и институтам, которые измеряют T-клеточный иммунный ответ.

Концепцию, что один набор данных предоставляет множество возможностей, компания собирается повторить на других заболеваниях, озвучил Робинс.

На данный момент компания предлагает потребителям тест T-Detect, который помогает понять, болел ли человек COVID-19 или нет. В 2021 году тест заказали более 30 000 потребителей; спрос повышается после появления новых вариантов.

Следующий шаг компании — добавить возможность количественно измерять уровень и длительность T-клеточного иммунитета после болезни и вакцинации. В настоящее время вопрос обсуждается с FDA. Компания работает с учеными и представителями фармы над расширением возможностей теста, чтобы он мог показывать степень защищенности человека.

Профилирование рецепторов T-клеток, вовлеченных в ответ на COVID-19, легло в основу создания кандидатной вакцины от Nykode. Уже начались клинические испытания, первые результаты фазы 1/2 ожидаются к середине года.

Также подходят к концу соглашения Adaptive Biotechnologies и Genentech, касающиеся разработки T-клеточной терапии рака, после чего биофармацевтическая компания примет решение о продолжении сотрудничества.

В области аутоиммунных заболеваний Adaptive сосредоточилась на тех состояниях, для которых существует большой рынок для диагностики и терапии. По словам Робертса, есть «многообещающие сигналы» в области диагностики болезни Крона, колита, целиакии, рассеянного склероза и ревматоидного артрита.

Компания надеется подтвердить и валидировать эти «сигналы» в 2022 году, и, возможно, запустить первый аутоиммунный тест в 2023 году. Тест T-Detect для болезни Лайма уже технически валидирован и компания планирует его запуск во время следующего сезона заболевания.

По словам Робертса, в области детекции минимальной остаточной болезни система ClonoSeq от Adaptive продолжает лидировать на рынке. Все больше исследований демонстрируют пользу от тестирования пациентов на минимальную остаточную болезнь. Особо докладчик отметил результаты исследования MASTER.

Анализ исходов для пациентов со множественной миеломой позволяет предположить, что если тест Clonoseq отрицательный, то пациент может прекратить терапию, что избавит его от побочных эффектов, а систему здравоохранения — от дополнительной нагрузки.

Чтобы сохранить преимущество на рынке, компания Adaptive Biotechnologies инвестирует в получение новых данных. В ближайших планах — расширение в сторону изучения неходжкинской лимфомы. Робертс полагает, что детекция минимальной остаточной болезни может дополнить или заменить визуализацию при мониторинге нагрузки заболевания и для раннего обнаружения рецидива. Для достижения этих целей компания будет расширять штат, привлекая специалистов в области гематологии и менеджеров по работе с клиентами.

Qiagen

В начале генеральный директор Qiagen Тьерри Бернард повторил, что «COVID для них актуален, но они от него не зависят», как и в предыдущие два года.

В настоящее время 88% регулярных доходов компания получает от продажи расходников и связанных услуг, а 12% — от капитальных продаж и установки оборудования. В сферу интересов компании входят наука о жизни и молекулярная биология; целевой рынок оценивают в $6 млрд.

Данные о фактических доходах не раскрывались, однако Бернард сообщил, что доход за 2021 год превысил $2 млрд. Компания ожидает, что доходы от QIAstat достигнут $60 млн., а от NeuMoDx — $100 млн.

Компания запустила более десяти новых диагностических тестов и три новых прибора в 2021 году. Пандемия позволила расширить базу клиентов.

В 2021 году Qiagen запустила и улучшила прибор для пробоподготовки EZ2 Connect, а также разработала следующее поколение системы QIASymphony — QIASymphony Boost. В первую очередь обновление было вызвано нуждами лабораторий, работающих с жидкостной биопсией в больших объемах.

По словам Бернарда, QIAstat никогда не нагонит BioFire Diagnostics и их платформу FilmArray, но за второе место на рынке поборется. Он рассказал, какие тесты QIAstat разрабатывает к 2022 году. Это тесты на инфекции желудочно-кишечного тракта, менингиты/энцефалиты, а также панель идентификации культивируемых патогенов крови. Также в разработке тесты на инфекции мочевыводящих путей и патогены, вызывающие пневмонии.

Следующий шаг — система с высокой пропускной способностью QIAstat-Dx Rise, которую Qiagen намерена подать на утверждение в FDA в этом году. Эта система может процессировать 18 образцов, 56 тестов за восьмичасовой период, 160 тестов в день с автоматической загрузкой и выгрузкой картриджа.

Компания считает, что через год после выпуска прибора для цифровой ПЦР QIAcuity она поставит более 500 систем. В 40 из 52 лабораторий системы здравоохранения США, исследующих эпидемиологию по сточным водам, стоят приборы компании Qiagen. Теперь компании нужно сосредоточиться на неинвазивной пренатальной диагностике и совместном анализе ДНК и белков.

По мнению Бернарда, на следующем этапе пандемии внимание сместится с диагностики на наблюдение, мониторинг вариантов и тестирование сточных вод.

Sema4

Генеральный директор  Sema4 Эрик Шадт рассказал о том, что штат компании вырос до 1200 человек. Sema4 сотрудничает с такими системами здравоохранения, как Mount Sinai, NorthShore University HealthSystem, Advent Health и Avera и имеет доступ к деидентифицированным медицинским данным 12 млн. пациентов, включая 500 000 человек с известным геномным профилем.

Цель Sema4 — использовать доступные данные для построения моделей заболеваний, которые помогут при лечении пациентов и проведении клинических испытаний, снижая затраты и улучшая исходы. По словам Шадта, преимущество компании — широкий охват.

В качестве примера он привел программу оценки генетического здоровья, в которую включены 42 000 пациентов NorthShore. За шесть месяцев генетическое тестирование прошли 6400 человек, у 950 был выявлен наследственный высокий риск развития рака. Уже более 90% врачей NorthShore заказали генетическое тестирование у Sema4.

Компания сотрудничает не только с системами здравоохранения, но и с биофармакологическими компаниями, в основном в области анализа данных.

Финансовый директор Исаак Ро повторил, что в четвертом квартале компания ожидает доходы от $50 млн. до $52 млн., что выше, чем более ранние прогнозы ($46,6–49,6 млн). Также ожидается, что в четвертом квартале компания проведет 80 000 тестов, не включая тесты на COVID-19. На 31 декабря 2021 года компания имеет доступ к $125 млн. возобновляемого кредита, к которому они еще даже не притронулись.

В 2022 году компания планирует повысить надежность и степень автоматизации, уменьшить время тестирования и оптимизировать портфолио. Также планируется расширение в сферу тестирования при онкологических заболеваниях и усиление партнерства с фармакокомпаниями.

По материалам GenomeWeb