Коротко

В столице с 3 марта 2022 года отменяют QR-коды, написал в своем блоге Сергей Собянин. Снимаются все ограничения на посещение ресторанов и кафе, театров, музеев, а также концертных, развлекательных, культурных, зрелищных, просветительских и спортивных мероприятий. Домашний режим для москвичей старше 60 лет и граждан с хроническими заболеваниями вместо обязательного становится рекомендательным.

Ученые из США обнаружили и секвенировали вирус SARS-CoV-2 дельта, обнаруженный в фекалиях 11-летней домашней кошки. У хозяина кошки была подтвержденная коронавирусная инфекция. Ученые работали с двумя образцами кошачьих фекалий, отобранных с интервалом в неделю. Содержание вирусной РНК в смешанном образце было относительно высоким. Геномы коронавируса, полученные из кошки, всего на 4–14 SNP отличались от последовательностей штамма дельта линии AY.3 из человеческих образцов. В то же время кошачий SARS-CoV-2 имел несколько уникальных мутаций. По мнению авторов, результаты работы говорят о продолжающейся передаче вируса между людьми и животными и подчеркивают необходимость анализировать образцы фекалий при работе с домашними питомцами.

Это первый случай выявления дельты у домашней кошки. Ранее была описана тяжелая респираторная инфекция SARS-CoV-2 у кошки в Великобритании. Возможность заражения кошки коронавирусом продемонстрировали китайские ученые в 2020 году.

Организм отфильтровывает до 90% вводимой дозы лекарства. Чтобы повысить эффективность, разрабатывают таргетную доставку. Но пока носители часто накапливаются в печени, почках и селезенке. Есть нужда в создании новых носителей для таргетной доставки лекарств. Новый подход предлагает Минкю Ким, доцент кафедры материаловедения и инженерии Аризонского университета, получивший премию National Science Foundation CAREER. Для этого он разрабатывает микрочастицы, которые имитируют свойства красных кровяных телец. 

Эритроциты могут протискиваться через микрокапилляры, которые намного меньше в диаметре, чем сами клетки. Они также остаются в крови дольше, чем многие другие носители. Поэтому они так привлекают исследователей. Была даже идея использовать донорские эритроциты, но это сопряжено со значительными логистическими трудностями. Цель Кима — получить универсальную платформу, которую другие исследователи смогут приспособить для своих задач.

Лактоферрины — это гликопротеины молока млекопитающих, вовлеченные во врожденный иммунный ответ. Ранее в экспериментах in vitro было показано, что лактоферрин коровьего молока проявляет противовирусную активность. Его антивирусные свойства наблюдались и в клинических испытаниях. Так, при пероральном приеме бычий лактоферрин снижал тяжесть ротавирусной инфекции. В новой работе ученые проверили активность бычьего лактоферрина против SARS-CoV-2. В экспериментах на культуре человеческих клеток легких бычий лактоферрин ингибировал различные штаммы коронавируса, в том числе альфу, бету, гамму и дельту. Наибольшую эффективность препарат продемонстрировал против штамма альфа. Ученые также показали, что лактоферрин в жевательных таблетках, содержащих также глюкозу или сорбитол, имеет такую же противовирусную активность, что и чистый лактоферрин. По их мнению, свойства и низкая стоимость лактоферрина делают его привлекательным кандидатом для профилактики или терапии COVID-19.

Другая команда в экспериментах in vitro и in silico обнаружила, что коронавирус ингибирует биоактивная фракция экстракта коры дерева ним. Соединения, содержащиеся в экстракте, например, нимбин, 4-эпинимбин, нимоцинол и другие, с высокой аффинностью связываются с РНК-зависимой РНК-полимеразой и S-белком SARS-CoV-2.

В мангровых зарослях, произрастающих на побережье Карибского моря, обнаружили самую большую бактерию из известных на настоящий момент. Она напоминает нитку длиной до 2 см, что примерно в 5000 больше, чем многие другие микроорганизмы. Бактерия такая большая, что ее видно невооруженным глазом. Особый интерес представляет организация ее генома — он не располагается свободно в клетке, а заключен в мембрану, что обычно характерно для более сложных организмов. Геном бактерии очень велик, он состоит из 11 миллионов оснований и около 11 000 генов. Таким образом, найденная бактерия размывает границу между про- и эукариотами.

Сначала исследователи посчитали, что обнаруженные филаменты состояли из нескольких клеток, но в конце концов установили, что клетка одна. Более того, у этой клетки есть два мембранных мешка, один из которых содержит весь генетический материал клетки. Ученые предполагают, что второй мешок может быть причиной того, что эти бактерии выросли до таких размеров. Он занимает 73% объема клетки и предположительно содержит воду. Новый организм предложили назвать Thiomargarita magnifica.

В феврале 30 домов в городе Саут-Лейк-Тахо (Калифорния, США) были ограблены большим черным медведем. Предполагалось, что за все преступления ответственен один медведь. Его назвали Хэнк Танк (Hank the Tank). Администрация города получила разрешение жителей на расстановку ловушек. Если бы медведь попался, он был бы убит или перевезен в другое место.

Однако на прошлой неделе были получены доказательства тому, что Хэнк Танк работает не один. Ученые из Департамента рыбы и дикой природы Калифорнии (California Department of Fish and Wildlife) изучили образцы ДНК, полученные на месте грабежей, и обнаружили, что кроме Хэнка в дома вламываются еще как минимум два черных медведя. Решение об убийстве или перемещении Хэнка Танка отменили, но ловушки остаются на своих местах. Каждого пойманного медведя пометят, возьмут у него образец ДНК, и затем медведь будет выпущен в подходящую среду обитания.

Британская компания Norfolk Plant Sciences подала заявку на одобрение продаж фиолетовых генно-модифицированных томатов в США. Такие томаты содержат в 10 раз больше антиоксидантных пигментов антоцианов, чем другие известные варианты томатов с фиолетовыми плодами. Новое растение содержит два гена львиного зева и один ген кресс-салата. Эти гены экспрессируются только в плодах, воздействуя на имеющийся у томата путь синтеза антоцианов.

Norfolk Plant Sciences надеется продавать как семена томатов садовникам, так и плоды магазинам. Министерство сельского хозяйства США должно дать ответ на заявку в течение 180 дней.

Агентство по безопасности здравоохранения Великобритании признало BA.2 «изучаемым вариантом (VUI) в январе, после того, как он был обнаружен в Дании, Индии и Великобритании. В Дании тогда он вызывал около 65% новых случаев (подробнее о датском исследовании ВА.2 и ВА.1). В настоящее время, по данным GISAID, частота случаев коронавирусной инфекции, вызванной ВА.2, в Дании достигла 92%, в мире — 35%. Возникает вопрос, не повлияет ли это на возможную отмену ограничений, связанных с пандемией, которая во многих странах планировалась на ближайшее время.

Появляется все больше доказательств, что BA.2 имеет преимущества перед BA.1 за счет большей заразности, особенно в иммунной популяции. Тем не менее BA.2, как и BA.1, по-видимому, чаще вызывает легкое заболевание, чем дельта. Есть опасения, что BA.2 может лучше, чем BA.1, уклоняться от моноклональных антител, но их эффективность существенно снижена для всех линий омикрона.

Специалисты компании Living Carbon с помощью генетической инженерии создали быстрорастущее дерево с повышенной эффективностью фотосинтеза. За основу взяли гибрид осины обыкновенной (Populus tremula) и тополя серебристого (Populus alba). С помощью Agrobacterium tumefaciens в растение внедрили плазмиду, кодирующую интерферирующую РНК против транскрипта PotriPlgg1. Продукт транскрипта — белок-транслокатор гликолята/глицерата. Гликолят — это побочный продукт фотодыхания растений. РНК-интерференция, направленная на PotriPlgg1, уменьшает вывод гликолята из хлоропластов. В результате гликолят метаболизируется обратно до CO2 и фиксируется в цикле Кальвина — Бенсона.

Инженерные тополя выращивали в течение пяти месяцев. В качестве контроля использовали немодифицированные гибриды. К концу срока растения со сниженной экспрессией PotriPlgg1 накопили на 53% больше сухой надземной биомассы, чем контрольные. Это говорит о повышении эффективности фотосинтеза и ускоренном росте. По мнению авторов, модифицированный тополь может служить доказательством концепции использования инженерных растений в борьбе с последствиями изменения климата.

Работа размещена на bioRxiv.

Пандемия вынудила ученых чаще публиковать препринты и активнее ссылаться на них — быстрые изменения ситуации не позволяли ждать, пока статья пройдет рецензирование. Французские исследователи оценили масштабы цитирования препринтов в статьях о COVID-19, скорость публикации препринтов, а также сравнили препринты с их опубликованными версиями.

Среди 205 статей о COVID-19 в четырех крупных медицинских журналах (BMJ, Lancet, JAMA, NEJM) за 2020 год 60 (29,3%) цитировали хотя бы один препринт, опубликованный на сервере medRxiv. Из 182 процитированных препринтов 124 были опубликованы в рецензируемых журналах, а из них 51 (41,1%) — до того, как вышла цитирующая статья, то есть вполне возможно было сослаться на окончательную версию. Почти половина публикаций после рецензирования имела существенные отличия от препринта. Отличаться мог заголовок; в 40% статей, окончательная версия которых была доступна на момент подготовки цитирующей статьи, отличались данные, причем в 10% — и выводы. Со своей стороны, medRxiv не упомянул о публикации 53 (42,7%) препринтов.

Авторы исследования, результаты которого тоже опубликованы на medRxiv, призывают при подготовке статей четко указывать статус рукописей, не прошедших рецензирования, и не ссылаться на препринты, если доступна публикация в рецензируемом журнале.