Меню
Все темы
Руководитель Центра коллективного пользования научным оборудованием в биологическом институте
ФИЦ Биотехнологии РАН г. Москва, Ленинский проспект д. 33 стр. 2
Уникальная возможность для специалистов, знающих и любящих аналитические методы.
Требуемый опыт работы: более 6 лет
Полная занятость, полный день
Центр коллективного пользования «Промышленные биотехнологии» ФИЦ Биотехнологии РАН оснащен большим парком научного оборудования (с акцентом на жидкостную и газовую хроматографию, масс-спектрометрию и другие методы анализа биологических и химических объектов).
В составе ЦКП функционирует 6 отделений:
· Отделение хроматографических методов исследования
· Отделение химических методов анализа
· Отделение биоинженерии
· Отделение управляемого культивирования микроорганизмов
· Отделение масс-спектрометрического анализа и анализа низкомолекулярных метаболитов
· Отделение спектральных методов исследований
Коллектив ЦКП состоит из высококвалифицированных специалистов, выполняющих широкий спектр задач как для внутренних подразделений ФИЦ Биотехнологии РАН, так и для внешних заказчиков.
Также на базе ЦКП функционирует Испытательная лаборатория, аккредитованная Федеральной службой по аккредитации на техническую компетентность и независимость.
У вас будет большая степень свободы, включающая:
· планирование и организацию работы ЦКП (поиск и выполнение как внутренних, так и внешних заказов),
· разработку стратегии развития ЦКП – внедрение новых методик и протоколов, расширение спектра оказываемых услуг (мы оперативно рассмотрим интересные идеи, выделим необходимые для их реализации ресурсы)
· поддержка текущей команды и расширение ее состава.
Основные задачи руководителя ЦКП:
· отладить и вести прозрачный документооборот ЦКП (есть электронная система заявок, но требуется ее оптимизация и расширение, необходим контроль расходных материалов и реактивов, организация их закупки);
· разработать систему контроля работоспособности оборудования и его поддержки;
· контроль за трудовой дисциплиной сотрудников;
· контроль своевременного выполнения заявок.
Основные знания и навыки, необходимые для выполнения работы:
· знания в области и опыт применения широкого спектра аналитических методов, включая ВЭЖХ, ГХ, масс-спектрометрия и др.);
· правила разработки технической документации по проведению испытаний и оценке результатов исследований;
· особенности работы аккредитованной испытательной лаборатории;
· уверенное пользование ПК.
Важнейшие параметры квалификации:
· профильное высшее образование (биологическое, химическое, медицинское), приветствуется наличие ученой степени и опыта научной работы практический опыт работы в лаборатории (в особенности в области ВЭЖХ, ГХ, масс-спектрометрии)
· опыт руководства небольшими коллективами
· опыт работы с документами и информационными системами по автоматизации и документообороту
· суммарный опыт в описанных направлениях – не менее 5-6 лет.
Условия:
работа в Москве, в 7 минутах от м. Ленинский проспект
достойный фиксированный оклад
высокая удовлетворенность заказчиков, малое время простоя оборудования, расширения портфеля обеспечат вам существенные дополнительные премии
график работы: 5/2 с 9:30 до 18:00
оформление по ТК РФ.
Ключевые навыки - Организаторские навыки - Руководство коллективом - Химические методы анализа - Аналитические исследования - Научные исследования
Откликнуться на вакансию можно по телефону +7-926-2550496 (Алексей), а также по почте: lipus5737@gmail.com
Ученые из США оценили риск смерти в течение 12 месяцев после перенесенного COVID-19. Они проанализировали электронные медицинские карты 13 638 взрослых пациентов, которые были протестированы на SARS-CoV-2 в период с 1 января по 30 июня 2020 г. COVID-19 подтвердился у 424 из них, остальные 13 214 составили контрольную группу. В течение года после тестирования умерло 2 686 пациентов. Статистический анализ показал, что риск смерти по любой причине для пациентов, перенесших COVID-19, значительно выше, чем у пациентов с отрицательным тестом на коронавирус. Отношение рисков составило 3,33 для тяжелой коронавирусной инфекции и 2,83 для легкой или умеренной. Отдельный анализ рисков для пациентов в возрасте 65 лет и старше выявил увеличение риска смерти только после тяжелой формы COVID-19 (отношение рисков 2,17).
В 80% случаев смерть у переболевших COVID-19 наступала не из-за респираторных или сердечно-сосудистых осложнений, а из-за причин, которые не связывают напрямую с инфекцией. По мнению авторов, это говорит о серьезном ущербе, который COVID-19 наносит организму, и о необходимости уделять больше внимания долгосрочным последствиям заболевания. Кроме того, следует применять меры по предотвращению тяжелой формы инфекции и госпитализации. Одна из доступных мер — вакцинация.
II Российский Клинико-Лабораторный Симпозиум с международным участием «Высокопроизводительное секвенирование (NGS) в клинической онкологии» пройдет 8–9 декабря 2021 г. в онлайн-формате на платформе ZOOM. В рамках симпозиума специалисты обсудят технологический прогресс в области геномного анализа, «второе рождение» жидкостной биопсии в онкологии и другие темы.
Подробная информация о мероприятии и регистрация — по ссылке.
Junior/Middle/Senior - Bioinformatics - new Startup BioTools4You
Мы начинающий стартап с идеей создания продукта для биоинформатиков, объединяющего инструменты (тулы, пайплайны), нам требуются эксперты для сотрудничества и участия в создании продукта. Ставим перед собой задачу внести вклад в развитие, сплочение сообщества биоинформатиков по всему миру.
Локация: Любая
Требования:
Образование в области биоинформатики
Обязанности:
1. Консультирование по вопросам предметной области — биоинформатика.
2. Участие в наполнении и выверки контента (категории, тулы, пайплайны).
3. Участие в формировании различных функциональных возможностей продукта.
4. Участие в бета-тестировании системы и предоставление фидбэка.
5. Изучение конкурентов и предоставление обратной связи о их достоинствах и недостатках.
Дополнительно: Занятость: part time
Вилка ЗП: 1500–2000 р/час
Отправлять резюме и задать вопросы по вакансии: Telegram @muhinaai
Вакансия: Биоинформатик
Компания: Genotek
Локация: Москва
Задачи:
· полногеномный поиск ассоциаций (GWAS);
· полигенные шкалы риска (PRS);
· популяционная генетика (дальнее родство, ancestry inference).
· Участие в разработке ДНК-тестов ("Генетический паспорт") и научных публикациях (Nature, Scientific Reports, PLOS ONE т.д.)
Писать можно в Telegram: @alexrakitko
Детальное описание https://hh.ru/vacancy/49508564
Статины — препараты, снижающие уровень холестерина, — влияют на концентрацию простатического специфического антигена, который используют для скрининга на рак простаты. Финские ученые проверили, влияет ли прием статинов на результаты скрининга. Исследование проводили на данных 78 606 мужчин. Оказалось, что рак простаты высокого риска выявляется с одинаковой частотой у индивидов, принимающих и не принимающих статины. При этом у первых значительно реже выявляются опухоли низкого риска, которые не представляют угрозы здоровью, так как очень медленно растут. Ассоциаций статинов со смертностью от рака среди участников исследования выявлено не было.
По мнению авторов, статины помогают избежать гипердиагностики, не снижая выгоды от скрининга. Работа опубликована в JAMA Oncology.
Bioinformatics scientist (NGS)
з/п не указана
Требуемый опыт работы: 1–3 года
Полная занятость, гибкий график
BostonGene Corporation is pioneering the use of biomedical software for advanced patient analysis and personalized therapy decision making in the fight against cancer. Our unique solution continuously aggregates the latest cancer research and clinical information from around the world. BostonGene’s unique solution performs sophisticated analytics to aid clinicians in their evaluation of viable treatment options for each patient’s genetics, tumor and tumor microenvironment, clinical characteristics, and disease profile. BostonGene’s mission is to enable physicians to provide every patient with the highest probability of survival through optimal cancer treatments using advanced, personalized therapies via sophisticated analytics and integration of scientific and clinical knowledge.
BostonGene Tumor Portrait test, based on integrated genomic and transcriptomic analysis, propels precision medicine into daily practice and supports physicians in actualizing personalized therapy for cancer patients. The test uses whole exome (WES) and whole transcriptome (RNAseq or RNA-sequencing) sequencing to profile the tumor’s genomic, transcriptomic, microenvironment, and neoantigenic properties.
Responsibilities:
· Participate in the research on oncogenesis and tumor properties integrating WES, WGS, RNAseq, scRNAseq, and Methyl-seq data analysis;
· Develop algorithms and analyze NGS data (WES, WGS, RNAseq, scRNAseq, Methyl-seq);
· Study the basics of tumor oncogenesis, participate in projects aimed to discover personalized biomarkers of therapeutic efficacy;
· Analyze tumor biology;
· Analyze scientific literature and expand the BostonGene knowledge base on oncogenesis/tumor’s molecular and cellular characteristics;
· Analyze the [NM5] mechanism of action of drugs at the molecular and cellular level;
· Participate in the development of a model to describe the molecular and cellular properties of a tumor.
Requirements:
· Experience working with RNAseq data;
· knowledge of fundamentals of immunology/cell biology;
· knowledge of the molecular basics of modern targeted and immune antitumor therapies is encouraged;
· experience with scientific literature and scientific databases;
· fluency in English sufficient for fluent reading and understanding of scientific articles;
· background in experimental work in biochemistry /molecular biology is a plus;
· experience with Python/pandas, R;
· knowledge in machine learning is a plus.
We offer:
· Full-time position, permanent contract, flexible working hours, the possibility of fully remote work;
· Versatile professional environment: bioinformatics, biologists, physicians, and software developers who united to save people’s lives;
· The office is located in Moscow, Paveletskaya metro station;
· Competitive salary and medical insurance.
Ключевые навыки
Английский — B2 — Средне-продвинутый
Python
Английский язык
Bioinformatics
ML
Адрес
Москва, метро Павелецкая, Шлюзовая набережная, 6с4
Вакансия опубликована 30 ноября 2021 в Москве
Подробнее:
В 2014 году программа UNAIDS поставила цель, известную как 95-95-95: к 2030 году 95% ВИЧ-инфицированных должны знать свой ВИЧ-статус; 95% ВИЧ-положительных индивидов с известным статусом должны получать антиретровирусную терапию; у 95% пациентов на терапии должна наблюдаться супрессия вируса. Новая статья в The Lancet HIV освещает результаты глобального ретроспективного исследования вирусной супрессии у детей, подростков и взрослых, получающих АРТ.
Исследование охватило 21 594 детей и подростков в 22 странах и 255 662 взрослых в 30 странах. Супрессия вируса через 1 год терапии наблюдалась у 79% взрослых, через 2 года — у 72%, через 3 года — у 65%. Для детей и подростков значения этих показателей были равны 64%, 62% и 59% соответственно. По мнению авторов, доля взрослых ВИЧ-инфицированных, получающих АРТ и добившихся супрессии вируса, приближается к цели, заданной UNAIDS. У детей и подростков прогресс гораздо хуже, а значит, нужно менять подходы к работе с этими возрастными группами.
Ингибиторы протонной помпы (ИПП) применяют для терапии изжоги и язвы желудка. Их часто назначают пациентам, проходящим лечение от онкозаболеваний. ИПП изменяют структуру кишечной микробиоты. В настоящее время появляется все больше доказательств тому, что дисбиоз снижает эффективность ингибиторов контрольных точек иммунитета. Ученые из Австралии проанализировали постфактум данные фазы 3 клинических испытаний IMpower150, в которых оценивалась эффективность комбинированной терапии неплоскоклеточного немелкоклеточного рака легкого. Из 1202 участников 441 получал ИПП. Статистический анализ выявил независимую ассоциацию ИПП с худшим исходом терапии для пациентов, которым были назначены комбинации, включающие ингибитор PD-L1 атезолизумаб. При этом ИПП не влияли на выживаемость пациентов, принимавших комбинации с ингибитором VEGF бевацизумабом без атезолизумаба. Авторы делают вывод, что ИПП снижают эффективность ингибиторов контрольных точек иммунитета. По их мнению, онкологам пора пересмотреть неизбирательное назначение ИПП своим пациентам.
Хроническая изнуряющая болезнь (ХИБ) оленей — трансмиссивная губчатая энцефалопатия, вызываемая прионами. Она распространяется в Северной Америке с 1960-х гг. и недавно была зарегистрирована в Евразии. Чувствительность к ХИБ зависит от вариаций гена PRNP, кодирующего прион. Американские ученые секвенировали ген PRNP у 27 оленей Давида (Elaphurus davidianus) из зоопарков Огайо, Калифорнии и Нью-Йорка. Они идентифицировали два гаплотипа, Elad1 и Elad2, которые отличаются четырьмя SNP, при этом три из четырех SNP не синонимичны. В обоих гаплотипах обнаружены полиморфизмы, которые у других видов связаны со сниженной чувствительностью к ХИБ.
Гаплотипы имеют большее сходство с PRNP других оленевых, чем между собой. По мнению ученых, это может свидетельствовать о продолжительном балансирующем отборе локуса PRNP. Сохранение обоих гаплотипов может быть выгодно для популяции оленей Давида, так как вариации аминокислотного состава прионного белка сдерживают трансмиссию ХИБ.
Олени Давида почти полностью вымерли в XIX веке. Популяцию восстановили из 11 особей. В настоящее время в мире насчитывается около 3 000 оленей этого вида. По мнению ученых, результаты исследования вселяют надежду на то, что олени Давида справятся с ХИБ, если встретятся с ней.
