Коротко

Как сообщает The Japan News, в Японии началась продажа томата с отредактированным геномом, который содержит в пять раз больше гамма-аминомасляной кислоты, чем неотредактированный овощ. Считается, что ГАМК снижает кровяное давление. Томат разработан компанией Sanatech Seed, базирующейся в Токио. Увеличения содержания ГАМК добились с помощью удаления аутоингибиторного домена в геноме, ограничивающего выработку этого вещества. По данным другого источника, NHK, разрешение на продажу овоща было получено в декабре 2020 года, тогда же были подписаны контракты с фермерами, и сейчас томаты как раз созрели. Три килограмма томатов стоят примерно $68.

Томаты с высоким содержанием ГАМК — первый в Японии пищевой продукт с отредактированным геномом, который попадет на стол потребителю. Организмы с отредактированным геномом (genome-edited), в отличие от генно-модифицированных (genetically modified), считаются безопасными, так как в них не вносятся чужеродные гены.

Ранее сообщалось, что в Японии также рассматривается возможность одобрения отредактированного красного леща с увеличенной на 50% мышечной массой.

Отрыв зуба в результате травмы — частое повреждение у детей 7–9 лет. В этом возрасте корни зуба еще не сформированы до конца, и немедленная реплантация может спасти зуб. Однако реплантация связана с воспалением, которое препятствует восстановлению тканей пародонта и вызывает разрушение корней. Один из воспалительных сигнальных путей регулируется фактором транскрипции NF-κB. Японские ученые предположили, что приживлению потерянного зуба поспособствует ингибирование пути NF-κB. В качестве ингибитора они использовали олигодезоксинуклеотидные (ODN) ловушки — двухцепочечные молекулы ДНК, которые связываются с NF-κB и блокируют его взаимодействие с генами-мишенями. Носителем ODN стали наносферы из сополимера молочной и гликолевой кислот (PLGA). Систему протестировали на крысах. Животным удаляли верхние правые резцы, погружали их в физраствор, раствор ODN без носителя, PLGA без нагрузки или же в раствор, содержащий наносферы PLGA c ODN, и немедленно реплантировали. Крысы из группы ODN в PLGA-наносферах демонстрировали наибольшую толщину корней реплантированных зубов, у них не детектировалась резорбция корней и была снижена экспрессия провоспалительных цитокинов — участников NF-κB-пути. По мнению ученых, предложенная ими система доставки терапевтических ODN значительно повысит успешность реплантации зубов в клинике.

Исследование, проведенное в США, выявило связь между инфекциями нижних отделов дыхательных путей и обструктивным апноэ сна. Работа проводилась на 3 114 детях из Boston Birth Cohort. Авторы проанализировали клинические данные детей за первые пять лет жизни. По результатам статистического анализа, перенесенная в первые два года инфекция нижних дыхательных путей повышает риск апноэ в первые пять лет независимо от других факторов. В частности, тяжелый бронхиолит, вызванный респираторно-синцитиальным вирусом, увеличивал риск апноэ в два раза. По мнению авторов, полученные результаты могут лечь в основу новой парадигмы патогенеза и предотвращения педиатрического обструктивного апноэ сна. Работа опубликована в Sleep.

Французские ученые оценили иммуногенность одной и двух доз мРНК-вакцины BNT162b2 (Pfizer/BioNTech) для пациентов, перенесших трансплантацию аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. В исследовании приняли участие 117 человек в возрасте 20–75 лет без COVID-19 и реакции «трансплантат против хозяина» в анамнезе. Медианный интервал между двумя дозами составил 22 дня. К моменту второй инъекции 63 пациента (54%) выработали антитела к S-белку SARS-CoV-2. Второй анализ на антитела проводился через 18–77 дней после второй дозы. У 97 (83%) участников он дал положительный результат. С отсутствием антител ассоциировалась гаплотрансплантация, пересадка ГСК менее чем за год до иммунизации, лимфопения и прием иммуносупрессоров или химиотерапии во время иммунизации. Все участники перенесли вакцину хорошо. Авторы исследования отмечают, что уровень сероконверсии после двух доз в группе реципиентов ГСК был значительно выше, чем у реципиентов солидных органов. Чтобы составить полную картину ответа реципиентов ГСК на вакцину, необходимо также изучить реактивность их T-клеток.

Биотехнологическая компания Oxford Nanopore Technologies, флагман нанопорового секвенирования, на прошлой неделе подала регистрационный документ для первичного публичного размещения акций (IPO) на Лондонской фондовой бирже. В марте IP Group, крупнейший акционер Oxford Nanopore, оценила ее примерно в 2,27 миллиарда фунтов стерлингов (3,14 миллиарда долларов). Позже весной Oxford Nanopore привлекла еще 195 миллионов фунтов стерлингов от инвесторов.

«Мы считаем, что Oxford Nanopore идеально подходит как для подрыва существующих рынков, так и для создания совершенно новых. IPO станет шагом на пути к воплощению нашего видения в реальность, поддержкой наших амбициозных планов роста», — заявил генеральный директор Oxford Nanopore Гордон Сангера.

Компания планирует продавать как новые акции, так и акции существующих акционеров по оферте и намеревается разместить на Лондонской бирже не менее 25%. Дополнительная информация об IPO будет раскрыта позднее.

Руководство компании ожидает, что за полный 2021 год на общий доход Oxford Nanopore повлияет снижение тестирования на COVID-19 во второй половине года, которое началось после массовой вакцинации. Вместе с тем ожидается, что в 2021 году выручка от продажи инструментов для исследований в области биологических наук вырастет на 30–40%.

В понедельник, 13 сентября, компания Colossal получила стартовое финансирование в размере $15 млн. Компания собирается преодолеть эффект от изменения климата с помощью восстановления экосистемы, и начнет она с возвращения вымершего шерстистого мамонта в арктическую тундру. Проект предполагает получение гибрида слона и мамонта с помощью CRISPR-технологии, разработанной лабораторией Черча в Гарвардской медицинской школе. Принципиальная схема метода представлена на иллюстрации в The Guardian. Гибрид будет обладать чертами, необходимыми для выживания в Арктике. По условиям соглашения со спонсорами, Colossal будет эту технологию. Если все пойдет по плану, первые мамонтята появятся через шесть лет. В перспективе проект может поспособствовать развитию мультиплексной генетической инженерии, синтетической биологии и других новый областей биотехнологии. Colossal также заключила эксклюзивное лицензионное соглашение о коммерциализации технологий, которые будут разработаны в коллаборации с лабораторией Черча.

Журнал Lancet опубликовал мнение международной группы ученых, включающей экспертов из ВОЗ и FDA. Они считают, что в настоящее время, когда количество доз вакцин против коронавируса ограничено, для мировой эпидемиологической ситуации полезнее произвести как можно больше первичных вакцинаций, а не вводить бустерную дозу уже вакцинированным.

Исключением являются те группы, у которых первичная вакцинация не обеспечила достаточную защиту, например, люди с ослабленным иммунитетом. Но даже в этом случае пока неясно, что для них будет лучше, — бустерная доза той же вакцины или другая вакцина. 

Вакцины защищают от тяжелого протекания заболевания даже в случае заражения вариантами дельта и альфа. Со временем в крови вакцинированных уменьшается количество антител, но это не значит, что иммунитет исчезает. Есть еще клеточный иммунный ответ, долгоживущие клетки памяти.

Эксперты говорят о том, что нужно осторожно взвешивать риски и пользу. На данный момент свидетельств того, что бустерные дозы необходимы общей популяции, нет.

Биотехнологический стартап Mammoth Biosciences сообщил в конце прошлой недели, что в раундах финансирования серий C и D собрал 195 млн долларов, и это сделало его так называемой компанией-единорогом — стартапом, оцениваемым более чем в 1 миллиард долларов. Примеры единорогов — Uber и Dropbox.

Mammoth Biosciences основана в 2018 году, одним из сооснователей стала пионер CRISPR Дженнифер Дудна. В феврале 2018 года вышла статья Дудны и соавторов о диагностическом методе DETECTR, основанном на CRISPR-Cas12a. Во время пандемии Дудна и Mammoth активно работали над системами для диагностики COVID-19. Тест DETECTR CRISPR-Cas12 от Mammoth Biosciences получил разрешение FDA в сентябре 2020 года.

Mammoth планирует расширять свой набор инструментов CRISPR-систем. Упор будет сделан на терапевтическое редактирование генов in vivo, в частности, со сверхмалыми белками Cas, обнаруженными в лаборатории Дудны, на которые фирма получила эксклюзивную лицензию у Калифорнийского университета в Беркли — это в первую очередь нуклеазы огромных фагов Casɸ и нуклеазы Cas14. Сверхмалые нуклеазы помогут преодолеть проблемы с доставкой в клетки, которые возникают при использовании Cas9 и Cas12. Компания также продолжит разработку своей диагностической платформы на основе CRISPR.

Генеральный директор Mammoth Тревор Мартин заявил, что компания работает над платформой, которую он назвал CRISPR Plus, совмещающей активацию CRISPR, ингибирование CRISPR, редактирование оснований и другие функции. Она будет использовать те же сверхмалые нуклеазы.

Федеральный суд США постановил, что химия для секвенирования StandardMPS и CoolMPS китайской компании BGI нарушает несколько патентов Illumina. Судья окружного суда Северного округа Уильям Оррик удовлетворил запрос Illumina на вынесение решения в порядке упрощенного судопроизводства и отклонил встречный иск BGI к Illumina. Эксперты BGI не опровергали обвинения в нарушении патента. Они лишь указывали на то, что Illumina не смогла продемонстрировать отсутствие спорных моментов. При этом встречный иск, по словам судьи, основывался на ложных предположениях.

Эксперт по патентному праву и профессор Юридического колледжа Университета Иллинойса Якоб Шерков называет решение суда большой победой для Illumina. Это поспособствует укреплению компании на рынке США. Однако Шерков считает, что к такому решению привела недостаточно хорошая защита BGI. Сама BGI намеревается защищать свою интеллектуальную собственность и бороться за выбор на рынке.

Противостояние Illumina и BGI началось в 2019 году. В июне 2020 года Illumina добилась запрета на распространение секвенаторов BGI в США, а в январе 2021 года выиграла патентное дело против BGI в Великобритании. Тогда же, в январе 2021 года, BGI подала в суд на Illumina за нарушение антимонопольного законодательства.

Британские ученые выявили одобренные препараты, которые потенциально можно перенаправить на борьбу с SARS-CoV-2. Они провели скрининг 1 971 молекулы на клетках Vero и человеческих клеточных линиях с использованием инженерного варианта вируса с нанолюциферазной меткой (SARS-CoV-2-ΔOrf7a-NLuc). Активность нанолюциферазы служила маркером репликации SARS-CoV-2. Ученые определили 35 препаратов, которые снижали репликацию вируса при обработке клеток перед заражением. Размножение SARS-CoV-2 в уже инфицированных клетках эффективно сдерживали восемь лекарств: противомалярийный препарат амодиахин, антибиотик атоваквон, противотуберкулезный препарат бедаквилин, антигистаминное средство эбастин, ингибитор циклин-зависимой киназы LY2835219, блокатор кальциевых каналов манидипин, ингибитор деацетилаз гистонов панобиностат и витамин D3. Авторы подчеркивают, что эти препараты пока не тестировались на пациентах с COVID-19 и не являются альтернативой существующим схемам лечения и вакцинации. Работа опубликована в PLOS Pathogens.