Коротко

20 августа индийская фармацевтическая компания Zydus Cadila объявила о получении одобрения на использование в экстренной ситуации вакцины ZyCoV-D. Препарат стал первой в мире одобренной человеческой ДНК-вакциной против SARS-CoV-2; его могут получить люди от 12 лет и старше. До сих пор вакцины, основанные на плазмидной ДНК, были рарешены только для животных.

Вакцина представляет собой плазмиду, несущую ген S-белка SARS-CoV-2 и промотор к нему. Она доставляется внутрикожно с помощью аппликатора PharmaJet, не содержащего игл. Препарат вводится за счет узкого потока жидкости, который проникает через кожу. За счет этого плазмида попадает в область, богатую иммунными клетками, которые поглощают чужеродный объект. Это должно способствовать проникновению плазмиды в ядро клетки, что необходимо для продукции вирусного антигена.

Схема иммунизации состоит из трех доз: в нулевой, 28 и 56 дни. Согласно промежуточным результатам фазы 3 клинических испытаний, проведенных с участием 28 000 добровольцев, эффективность ZyCoV-D против симптоматического COVID-19, подтвержденного ПЦР-тестом, составляет 66,6%.

Исследователи из Эксетерского университета (Великобритания) при финансовой поддержке Совета по экономическим и социальным исследованиям проанализировали литературные данные и законодательство, а также опросили технологов и экспертов в области цифровой идентификации и сертификации и составили отчет о проблемах сертификатов о вакцинации против COVID-19 и коронавирусном статусе. По мнению авторов, существует три препятствия на пути к внедрению сертификатов по всему миру: отсутствие доверия, отсутствие мировых стандартов, отсутствие целостного подхода. Они призывают внедрить международные стандарты для записей о вакцинации и состоянии здоровья. Организации, выдающие сертификаты о вакцинации и коронавирусном статусе, должны соблюдать базовые принципы защиты данных, в том числе законность, справедливость и прозрачность, ограничение времени хранения, конфиденциальность, подотчетность и другие. Защита данных должна быть встроена в дизайн сертификатов по умолчанию. Кроме того, исследователи рекомендуют использовать сертификаты только во время пандемии и отказаться от них, как только ВОЗ объявит, что COVID-19 больше не является угрозой мировому общественному здравоохранению. Работа проведена в рамках программы UKRI по быстрому ответу на COVID-19.

Продолжается набор на 6-дневный интенсив по Python и Linux для биоинформатики и биологии. Курс подойдет для биологов, химиков, врачей, которым необходимо анализировать данные.

Если вы хотите повысить квалификацию своих сотрудников и расширить их функционал, вы можете оформить заявку как юридическое лицо.

Даты проведения: 27 сентября — 2 октября 2021

Формат: очно или онлайн на выбор

Практика: разбор примеров из молекулярной и структурной биологии

Результат: практическое применение полученных знаний сразу после прохождения курса, повышение качества работы и автоматизация рутинных задач

В программу входит:

• 20 часов практики

• 20 часов самостоятельных тренировок с код-ревью

• Практика по bash в реальном окружении на сервере

• Ежедневные лекционные материалы и готовые питоновские тетради с примерами кода + видеозаписи трансляций день в день

• Follow-up проект по окончании интенсива для закрепления навыков

• Живое общение и Telegram-чат с преподавателями и однокурсниками

Ознакомиться с программой, условиями обучения и зарегистрироваться можно по ссылке.

Для самостоятельных участников действуют специальные условия.

Для студентов дневных и вечерних отделений бакалавриата, магистратуры и специалитета — скидка 25%.

Организаторы курса: Blastim.ru и PCR.NEWS

Ученые из США проанализировали связь между вакцинацией от ВПЧ и заболеваемостью раком ротоглотки в будущем. Они работали с данными 69 562 пациентов, которым диагностировали рак ротоглотки в возрасте 34–83 лет, и с базами национальных программ вакцинации от ВПЧ, суммарно включающими данные 77 028 человек. Данные были собраны в период с 1 января 1992 года по 31 декабря 2017 года. Предсказательные модели, представленные в новой работе, рассчитаны на 2018–2045 гг. и учитывают два сценария: отсутствие вакцинации от ВПЧ и вакцинация от ВПЧ на современном уровне.

Было показано, что при современных темпах вакцинации в период с 2018 по 2045 гг. заболеваемость раком ротоглотки снизится в более молодой популяции (группы 36–45 лет и 46–55 лет), но продолжит расти у людей старшего возраста (70–83 года). К 2045 году вакцинация от ВПЧ должна значимо снизить заболеваемость у индивидов в возрасте 36–55 лет, но не 56 лет и старше. Такие результаты связаны с тем, что популяция более старшего возраста, не привитая от ВПЧ, остается в группе высокого риска рака ротоглотки. Работа опубликована в JAMA Oncology.

Исследователи одной из крупнейших некоммерческих медицинских организаций США Kaiser Permanente и Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) проводят масштабное исследование безопасности вакцин, которое будет продолжаться два года.

Первые результаты, собранные по 26 июня 2021 года, опубликованы в JAMA. Состояние здоровья людей, привитых мРНК-вакцинами против COVID-19 (Pfizer, Moderna) в течение 21 дня после дозы 1 или 2, сравнивали с другими вакцинированными, у которых в те же календарные даты шел 22–42-й день после дозы 1 или 2, а также с невакцинированными. Общее количество вакцинированных составило 6,2 миллиона для первой дозы любой мРНК-вакцины и 5,7 миллиона для второй дозы.

В медицинских картах пациентов искали 23 потенциальных нарушения здоровья, в том числе энцефалит, миелит, судороги, синдром Гийена–Барре; сердечно-сосудистые нарушения (острый инфаркт миокарда, инсульт и тромбоэмболия легочной артерии), а также паралич Белла, аппендицит, анафилаксию и мультисистемный воспалительный синдром. Статистической значимой связи между вакциной и любым из этих состояний не обнаружено.

Дополнительное исследование выявило 34 случая миокардита и перикардита у пациентов от 12 до 39 лет; 85% из них — мужчины, 82% были госпитализированы (в среднем на один день), и почти все выздоровели к моменту подведения итогов. Авторы подсчитали, что в возрастной группе от 12 до 39 лет существует незначительное повышение риска — 6,3 дополнительных случая миокардита на миллион доз в течение первой недели после вакцинации. Отмечается, что риск миокардита от COVID-19 значительно выше.

На этой неделе компания Johnson & Johnson обнародовала результаты фазы 2b клинических испытаний вакцины Imbokodo (HVTN 705/HPX2008), разработанной как средство профилактики ВИЧ-инфекции. В испытаниях приняли участие около 2 600 женщин из пяти стран Африки к югу от Сахары. В течение года участницы получили четыре инъекции вакцины или плацебо. Первичный анализ проводился через 24 месяца после первой дозы. Вакцина хорошо переносилась, однако ее эффективность составила всего 25,2% и была признана недостаточной. Испытания HVTN 705/HPX2008 остановлены.

Режим вакцинации Imbokodo предполагал четырехкратное введение аденовирусного вектора, содержащего «мозаику» иммуногенов разных подтипов ВИЧ (Ad26.Mos4.HIV). Кроме того, в третий и четвертый визиты участники получали растворимый белковый компонент Clade C gp140 с фосфатом алюминия в качестве адъюванта.

Фаза 3 клинических испытаний Mosaico, в которых тестируется другая схема вакцинации (четырехкратное введение Ad26.Mos4.HIV и введение растворимых белков Mosaic и тримерного Clade C gp140 с адъювантом в третий и четвертый визиты) на другой группе риска, продолжится.

В феврале прошлого года были остановлены испытания вакцины HVTN 702.

Вариант мю (B.1.621) SARS-CoV-2 добавлен в список «вариантов, вызывающих интерес» (variants of interest, VOI) 30 августа 2021 года, сообщает The Guardian. В этот список включают варианты с генетическими изменениями, способными повлиять на трансмиссивность, тяжесть заболевания, ускользание от иммунного ответа или терапии, а также, возможно, отвечающие за рост числа случаев. Если подобные изменения свойств вируса доказаны, штамм переходит в спиков «вариантов, вызывающих опасения» (VOC).

Впервые вариант мю идентифицирован в Колумбии в январе 2021 года и с тех пор детектирован в десятках стран. Доля этого варианта среди всех отсеквенированных штаммов в мире пока не превышает 0,1%, однако его распространенность в Колумбии и Эквадоре достигла 39 и 13%, соответственно. (В Колумбии привито около 30% населения, в Эквадоре более 50%.) Вирулентность и трансмиссивность штамма изучаются.

В S-белке штамма мю девять аминокислотных замен, среди них есть как общие с известными вариантами, вызывающими беспокойство (VOC), так и новые. В небольшом исследовании итальянских ученых показано, что сыворотки крови людей, вакцинированных Pfizer/BioNTech, эффективно нейтрализовали штамм мю, хотя некоторое снижение обратных титров нейтрализации наблюдалось.

Исследователи из Пенсильванского университета с коллегами предложили высокочувствительный метод детекции коронавирусного антигена в мазках из носоглотки, который назвали Microbubbling SARS-CoV-2 Antigen Assay (MSAA). Предел обнаружения — 0,5 пг/мл (10,6 фмоль/л) N-белка коронавируса, или 4000 копий/мл инактивированного SARS- CoV-2.

После того, как образец лизируется, N-белок взаимодействует с магнитными бусинами, несущими антитела, на чипе, и затем через другое антитело — с наночастицами платины, которые катализируют реакцию образования кислорода из H₂O₂. Авторы разработали автоматический классификатор микропузырьковых паттернов на чипе с использованием компьютерного зрения и машинного обучения. Результаты считываются с помощью смартфона. Метод позволяет не только качественно определять антиген, но и отслеживать ее количественную динамику у тяжелобольных и пациентов с иммунодефицитом.

MSAA при сравнении с качественным ОТ-ПЦР продемонстрировал положительное процентное соответствие (PPA) 97% и отрицательное процентное согласие (NPA) 97% в валидационном исследовании с 372 мазками. Общий объем микропузырьков, количественный маркер антигенной нагрузки, демонстрировал обратную корреляцию со значениями Ct и днями после появления симптомов.

Ученые из США проверили самодельный и коммерческий компосты на наличие возбудителей пищевых инфекций и инфекций, передающихся воздушно-капельным путем. С помощью количественной ПЦР они выявляли гены-маркеры пяти патогенов-оппортунистов: Salmonella enterica, Escherichia coli, Mycobacterium spp., Legionella pneumophila и Pseudomonas aeruginosa. Ни в одном из образцов не оказалось сальмонеллы и кишечной палочки, зато микобактерии обнаружились во всех образцах компоста, а также в образцах контрольной почвы. Обилие гена-маркера псевдомонады в двух образцах самодельного компоста было выше, чем в остальных образцах. Ген-маркер легионеллы же присутствовал в коммерческом, но не в самодельном компосте. Ученые также проверили распространенность генов антибиотикорезистентности. Относительное обилие таких генов было выше в образцах коммерческого компоста. Авторы делают вывод, что при работе с компостом риск вдохнуть возбудителя, передающегося воздушно-капельным путем (микобактерию, легионеллу или псевдомонаду) может быть выше, чем риск заразиться пищевой инфекцией. Однако они отмечают, что количественная ПЦР не отличает живых патогенов от мертвых. Ученые планируют улучшить метод таким образом, чтобы стала возможна детекция жизнеспособных клеток.

В среду, 25 августа, компания Johnson & Johnson обнародовала данные, подтверждающие действенность бустерной дозы вакцины против COVID-19, разработанной дочерней компанией J&J Janssen. В вакцине используется вектор на основе аденовируса 26, она предназначена для однократного введения. Ранее было показано, что нейтрализующие антитела после иммунизации сохраняются в течение восьми месяцев. Учитывая потенциальную необходимость в бустерных дозах, J&J провела два клинических испытания (фаза 1/2a) на пациентах, привитых одной дозой вакцины Janssen. Согласно промежуточным результатам, бустерная доза дает быстрое и значительное увеличение титров S-связывающих антител — их становится в девять раз больше, чем на 28 день после первой иммунизации. Такой эффект наблюдался как у молодых испытуемых (18–55 лет), так и у людей старше 65 лет. 26 августа результаты испытаний появились в базе medRxiv.