Меню
Все темы
Геном коронавируса из образца, взятого у женщины в Санкт-Петербурге 15 марта, отсеквенированный в НИИ гриппа им. А.А.Смородинцева и помещенный в открытую базу данных GISAID, близок к «европейским» геномам. Об этом сообщил Георгий Базыкин (зав. лабораторией молекулярной эволюции ИППИ РАН, профессор Сколковского института науки и технологий).
«Мы построили дерево всех полных последовательностей из GISAID (все complete high-coverage на 21.03.2020, из них 639 прошли фильтрацию по качеству) и посмотрели, куда «легла» питерская. (…) Оказалось, что она находится внутри большой преимущественно европейской клады, с большим числом базальных европейских последовательностей. Внутри нее она уверенно попадает в основание меньшей клады, от корня которой ее отделяют две "приватные" мутации, не встречающиеся в других последовательностях этой клады. Другие две мутации отделяют от этого корня последовательность, полученную 4-го марта у 86-летней женщины во Франции, и еще по одной мутации – каждую из двух клад, включающих множество последовательностей из Европы, США и других стран».
Георгий Базыкин также пишет, что эта картина может быть свидетельством в пользу завоза коронавируса из Европы в Россию, а присутствие в той же кладе последовательностей из штата Вашингтон (вторая вспышка, конец февраля — начало марта) говорит о возможности быстрого распространения европейских штаммов в разных направлениях. «Очень нужно больше секвенированных штаммов, чтобы узнать детали; по мере появления дополнительных данных картина будет уточняться», — добавил он.
Быстрое секвенирование во время пандемии дает новые возможности для понимания происходящего. Вчера Кари Стефансон, основатель и генеральный директор исландской биофармкомпании deCODE Genetics, сообщил о двух разных штаммах коронавируса, полученных от одного пациента.
Новый британский исследовательский консорциум получил 20 миллионов фунтов стерлингов (23,2 миллиона долларов США) для исследования распространения COVID-19 и эволюции возбудителя методом секвенирования геномов. Консорциум COVID-19 Genomics UK включает в себя Национальную службу здравоохранения Великобритании (NHS), агентства общественного здравоохранения и академические исследовательские институты. Финансовую поддержку осуществляют NHS, Public Health England, UK Research and Innovation и Wellcome Trust.
Для значительного числа образцов от пациентов с подтвержденными случаями COVID-19 будут сделано полногеномное секвенирование, заявил директор Института Сэнгера Майк Стрэттон. Секвенировать будут исследовательские центры более чем в десяти городах Великобритании. Результаты получат больницы, региональные центры NHS и правительство. Шарон Пикок, завкафедрой общественного здравоохранения и микробиологии в Кембриджском университете и директор Национальной службы инфекционных заболеваний, будет руководить консорциумом; Юэн Харрисон с медицинского факультета Кембриджа — научным проектом.
Консорциум собирается использовать протокол секвенирования нового поколения, которые разработал специально для вспышек инфекционных заболеваний Джош Квик из Университета Бирмингема. Метод работает с платформами секвенирования Illumina и Oxford Nanopore Technologies.
В Великобритании на 24 марта насчитывается 6726 случаев COVID-19 (23 марта зарегистрирован 981 случай) и 336 смертельных исходов. Премьер-министр Борис Джонсон объявил о введении строгого карантина: люди могут выходить из дома за покупками товаров первой необходимости, лечения, поездок на работу и с нее, если не могут работать дистанционно, а также для пробежек или другой физической активности раз в день. Собираться больше, чем по двое, запрещено, за исключением совместно проживающих.
Премьер-министр Михаил Мишустин 23 марта 2020 года провел заседание президиума Координационного совета при Правительстве РФ по борьбе с распространением новой коронавирусной инфекции на территории страны. На заседании принят ряд решений и поручений.
Минюст, МВД, Минэкономразвития, федеральные органы исполнительной власти должны до 25 марта представить предложения по ужесточению ответственности физических и юридических лиц за нарушение карантинных мер.
Роспотребнадзору поручено совместно с правительством Москвы и органами исполнительной власти субъектов РФ «разработать схему ускоренного развертывания дополнительных лабораторных мощностей по проведению тест-исследований населения на наличие новой коронавирусной инфекции с указанием референс-центров, на базе которых будет осуществляться подтверждение диагноза». Также поручено «принять исчерпывающие меры» по информированию населения о результатах анализов на наличие новой коронавирусной инфекции. Срок — 24 марта.
Минздрав и Роспотребнадзор также должны проработать информационную компанию по коронавирусу. Кроме того, ФАС России и Минкомсвязи проанализируют динамику цен на мобильную связь, а ФТС России будет еженедельно представлять в Правительство РФ данные по количеству грузового автотранспорта, въезжающего на территорию страны и очередях на пропускных пунктах.
Иммуногенность всех шести кандидатных вакцин исследуется на чувствительных к вирусу животных, включая низших приматов, с 16 марта, сообщает Роспотребнадзор. Прототипы вакцин основаны на шести различных технологических платформах: «как на основе широко применяемых рекомбинантных вирусных векторов гриппа, кори и везикулярного стоматита, так и на основе многообещающих технологий синтетических вакцин: мРНК-вакцины, пептидные вакцины и субъединичные вакцины. Для дизайна вакцин использовали современные биоинформационные системы, а конструирование и доведение до готовых прототипов проводили с помощью передовых наработок, в том числе в области обратной генетики».
