Анализ РНК показал, что животные с уханьского рынка были заражены вирусом

Генетические данные указывают на естественное происхождение коронавируса SARS-CoV-2. (Подробнее о последней работе, в которой анализировались образцы с рынка Хуанань в Ухане, на PCR.NEWS.) Однако до сих пор не доказано, что животные, чувствительные к коронавирусу, такие как енотовидные собаки, были инфицированы раньше людей. В частности, вирус не был найден в образцах животных с рынка.

Анализ последовательностей нуклеиновых кислот из этих образцов продолжается, так как объем данных очень велик. На конференции «Preparing for the Next Pandemic: Evolution, Pathogenesis and Virology of Coronaviruses» (Авадзи, Япония; программа в pdf) только что были представлены доказательства того, что некоторые из животных страдали от вирусной инфекции. Доказательства основаны на транскриптомике, и невозможно сказать, какой именно вирус вызвал инфекцию.

С докладом «Скрининг на восприимчивость и транскриптомные анализы идентифицируют потенциальных промежуточных хозяев SARS-CoV-2» выступила Анджела Расмуссен (Саскачеванский университет в Саскатуне, Канада), соавтор сентябрьской статьи в Cell об анализе образцов с рынка.

Исследователи проанализировали профили РНК из образцов с рынка от тех животных, которые в принципе восприимчивы к SARS-CoV-2: это американская норка (Neogale vison), горностай (Mustela erminea), гималайская циветта (Paguma larvata), енотовидная собака (Nyctereutes procyonoides), рыжая лисица (Vulpes vulpes) и свиной барсук (Arctonyx collaris). Вирусная инфекция сопровождается характерными изменениями в экспрессии генов, в частности, тех, которые отвечают за иммунный ответ на вирус. Особенности транскриптома клеток человека и животных, зараженных SARS-CoV-2 и родственными коронавирусами, в последние четыре года активно изучались. Расмуссен и ее коллеги обнаружили те же характерные особенности в РНК-профилях людей, которые были на рынке, и двух восприимчивых видов животных — енотовидных собак и свиных барсуков.

Таким образом, на рынке Хуанань в то самое время, когда большое количество людей заразилось COVID-19, животные, восприимчивые к коронавирусу, страдали от вирусной инфекции.

«Это еще одно косвенное доказательство, которое предполагает связь происхождения пандемии SARS-CoV-2 с рынком Хуанань», — комментирует для Nature Кристиан Дростен, вирусолог из университетской клиники Шарите в Берлине, который также присутствовал на конференции.

Тем не менее комментаторы отмечают, что доказательства активации иммунной системы, основанные на транспкриптомике, не равнозначны прямому обнаружению вируса. Кей Сато, вирусолог из Токийского университета, говорит, что планирует изучить транскриптомы тканей енотовидных собак, инфицированных SARS-CoV-2 и другими родственными вирусами, чтобы получить более четкую сигнатуру инфекции.

Комитет Палаты представителей США заявил о лабораторном происхождении коронавируса