Ближайшие известные родственники денисовцев живут на Филиппинах

После выхода из Африки анатомически современные люди скрещивались с древними гомининами, в частности, с неандертальцами и денисовцами. Следы этих встреч можно найти в геномах людей и сейчас. Например, в геномах всех евразийцев процент неандертальских генов примерно одинаковый, а в геномах австралазийцев (филиппинских негритосов и австралийских папуасов) вклад предков-денисовцев выше, чем у каких-либо других популяций на земле.

Изначально считалось, что денисовцы скрестились с людьми только один раз, и это была встреча денисовца с предком группы австралазийцев. Позже стало ясно, что популяции денисовцев были крайне разнообразны и расселились на огромные территории: небольшой процент денисовских генов обнаружили у народов Восточной и Южной Азии, Сибири и даже в популяциях коренных американцев. Из этого следовало, что денисовцы скрещивались с людьми как минимум дважды. Наконец, была выявлена третья вероятная интрогрессия денисовцев в популяцию современных людей: гены денисовцев были обнаружены у папуасов. Однако до сих пор вклад денисовцев в популяции островов Юго-Восточной Азии до сих пор не был оценен. Именно это и сделала в новой работе международная команда под руководством ученых из Уппсальского университета (Швеция).

Ученые проанализировали более 2,3 млн. однонуклеотидных полиморфизмов в геномах 1 107 жителей Филиппин. Участники представляли 118 этнических групп, в том числе 25 популяций филиппинских негритосов. Из всех этносов наибольший вклад денисовцев наблюдался у представителей этноса айта магбукон (Ayta Magbukon) — денисовская ДНК составляет около 5% их генома. Полногеномное секвенирование пяти представителей айта магбукон и сравнение полученных последовательностей с публично доступными геномами древних и современных людей подтвердило результат.

Айта магбукон входят в группу филиппинских негритосов айта общей численностью около 50 тыс. человек и проживают в западной части острова Лусон. Результаты иследования говорят о том, что айта магбукон несут в своих геномах на 30-40% больше денисовских генов, чем предыдущие рекордсмены — коренные жители высокогорных районов Папуа — Новой Гвинеи, то есть их родство с денисовцами ближе, чем у любой из всех ныне существующих человеческих популяций.

Авторы предполагают, что столь высокий вклад денисовцев в геномы айта магбукон связан со значительно изоляцией этой популяции и редкими контактами с другими популяциями, проживающими в регионе. Возможно, острова Юго-Восточной Азии когда-то были населены несколькими денисовскими или родственными денисовским популяциями, к которым мог принадлежать и недавно описанный вид Homo luzonensis. Филиппинские негритосы позже смешались с мигрантами из Восточной Азии, несущими незначительный процент денисовских генов, что уменьшило долю денисовской ДНК в геномах негритосов. Однако отдельные группы аборигенов, практически не вступавшие в контакт с мигрантами, сохранили высокий процент генов от своих предков-денисовцев. К таким группам относились и айта магбукон.

«Если мы продолжим секвенировать геномы, мы сможем лучше отвечать на множество вопросов: в частности, как унаследованные древние участки генома влияют на нашу биологию и как они способствовали нашей адаптации как вида», — говорит первый автор работы Максимилиан Ларена, сотрудник Уппсальского университета.