Происхождение вируса гепатита E человека проследили до грызунов

Вирус гепатита E (HEV) ежегодно заражает 20 млн и приводит к гибели 44 000 человек по всему миру. Всего существует восемь генотипов HEV, но зоонозные генотипы 3 и 4 — основной источник инфекции в индустриальных странах. Зоонозные инфекции обычно передаются от копытных и иногда от крыс. Международная группа исследователей, включающая авторов из России, охарактеризовала различные гепевирусы (вирусы, подобные вирусу гепатита Е) грызунов в неисследованных регионах.

Авторы проанализировали 7,67 млн прочтений, включая 3,52 млн прочтений от млекопитающих, из них 1,74 млн от приматов, 1,65 млн от грызунов, 102 427 от парнокопытных, 3096 от летучих мышей и 395 от землероек. В открытых данных идентифицировали 137 гепевирусов, из них только четыре отличались от известных гепевирусов. Два были ассоциированы с грызунами, два — с летучими мышами.

Однако гепевирусы грызунов были описаны только в небольшом количестве стран. Поэтому авторы протестировали 2565 животных, относящихся к 108 видам грызунов и землероек, которых отловили с 2011 по 2018 год в Сьерра-Леоне, Гвинее, Нигерии, Эфиопии, Монголии, Казахстане и Мексике. Методом ОТ–ПЦР они выделили 63 положительных образца печени — 61 у 12 видов грызунов и два у двух видов землероек. Доля положительных образцов варьировала в зависимости от страны и вида. У грызунов была высокая вирусная нагрузка.

Всего авторы получили 24 почти полных генома гепевирусов. Организация у них была типичной для гепевирусов с ORF1, ORF2 и ORF3, характерными функциональными доменами и мотивами. Предполагаемая ORF4 обнаруживалась не во всех геномах. Два тарбаганчика (Pygeretmus pumilio) из семейства тушканчиков были коинфицированы двумя гепевирусами, у которых наблюдалось расхождение транслируемых аминокислотных последовательностей более 20%.

Вирус гепатита E крыс и гепевирусы грызунов формировали пять клад. Гепевирусы грызунов более разнообразны, чем гепевирусы летучих мышей и птиц, формирующие монофилетические клады. Анализ показал недавнее происхождение HEV от гепевирусов свиней и верблюдовых и более отдаленное — от гепевирусов грызунов.

До сих пор нет модельного животного для изучения HEV человека. Но иммунокомпетентные песчанки инфицируются как зоонозными, так и не зоонозными генотипами HEV. Скорее всего, потребуется всего несколько генетических изменений, чтобы HEV-1 смог их заразить. Также, по мнению авторов, нужно оценить риски и установить наблюдение за гепевирусами грызунов.

Вирус гепатита Е «ворует» РНК хозяина, чтобы успешнее реплицироваться