В иммунитете растений задействованы производные NAD

У многих организмов белки, функционирующие в клетках иммунной системы, имеют домены рецептора Toll/интерлейкина 1 (TIR-домены). У растений в распознавании патогенов и связанных с ними эффекторных молекул задействованы внутриклеточные нуклеотид-связывающие обогащенные лейцином домены (NLR-домены). Один из основных подклассов NLR на N-конце несет TIR-домен. Белки обоих групп играют важнейшую роль в работе растительного иммунитета, в частности, запускают реакцию гиперчувствительности первого типа. Авторы новой работы, опубликованной в Science, показал, что TIR синтезируют особые эффекторные молекулы, также задействованные в фитоиммунитете.

Сначала авторы работы идентифицировали малые молекулы, активирующие сигнальный путь EDS1-SAG101-NRG1. Все три компонента являются консервативными белками иммунной системы растений. Экстракция из клеток арабидопсиса и последующий анализ с помощью хроматографии и масс-спектрометрии позволили выделить и охарактеризовать новые сигнальные молекулы — АДФ-рибозилированные АТФ (ADPr-ATP).

Далее ученые выяснили, каким именно образом ADPr-ATP распознается EDS1-SAG101. Для этого они с помощью криоэлектронной микроскопии получили структуру комплексе, попутно проверив, как на связывание с ADPr-ATP и EDS1-SAG101 влияют мутации в предполагаемом кармане взаимодействия с ADPr-ATP. Полученная структура помогла авторам детально описать механизм, по которому ADPr-ATP активирует EDS1-SAG101.

Последующие эксперименты показали, что именно TIR-домен ответственен за образование ADPr-ATP. Авторы работы показали, что TIR-домен катализирует реакцию АДФ-рибозилирования, используя только NAD+ или NAD+ и АТФ в качестве субстрата. В результате образуются ADPr-ATP, а также молекула, состоящая из двух АДФ-рибозилированных групп (ADPR). Обе они функционируют как вторичные посредники в иммунной системе растений.