Высокое разнообразие кишечной микробиоты новорожденных снижает риск тяжелых вирусных инфекций дыхательных путей

Вирусные инфекции нижних дыхательных путей (vLRTI) — основная причина госпитализаций младенцев в возрасте до года. Ранее было показано, что кишечный микробиом влияет на развитие иммунной системы ребенка, включая легочный иммунный ответ через ось «кишечник-легкие». Однако данных по ассоциации состава кишечной микробиоты с тяжестью детских вирусных респираторных инфекций было недостаточно.

Исследование, проведенное в рамках Baby Biome Study в Великобритании, включало более тысячи младенцев, у которых в первую неделю жизни отбирали образцы кала и проводили их метагеномное секвенирование. Целью работы было выявить, связаны ли особенности микробиоты кишечника с частотой госпитализаций по поводу vLRTI в первые два года жизни ребенка. Ученые оценивали разнообразие микробиоты (альфа-разнообразие) и выделяли типы бактериальных сообществ.

По результатам исследования авторы выделили три кластера микробиоты: смешанный (кластер 1), с преобладанием Bifidobacterium breve (кластер 2) и с преобладанием Bifidobacterium longum (кластер 3). Третий кластер встречался только у детей, рожденных естественным путем, характеризовался более высоким содержанием B. longum, B. bifidum, B. adolescentis и Bacteroides dorei и повышенным альфа-разнообразием. Оказалось, что более высокое альфа-разнообразие микробиоты было ассоциировано со снижением риска госпитализации с vLRTI (скорректированное HR по индексу Шеннона 0,57). Дети с микробиотой кластера 3 имели значительно более низкие показатели госпитализации по сравнению с остальными детьми: скорректированное HR для детей с микробиотой кластера 1 и 2 составило 3,05 и 2,80 соответственно при сравнении с кластером 3. Стоит отметить, что присутствие Bacteroides dorei было ассоциировано с защитой, а Rothia mucilaginosa — с повышенным риском госпитализации с vLRTI.

Авторы подчеркивают важную роль раннего формирования микробиоты для иммунитета и перспективы профилактики тяжелых инфекций дыхательных путей через воздействие на микробиоту.

Аллергические заболевания связаны с нарушением кишечной микробиоты в младенчестве