Компания Mynvax, образовавшаяся на базе Индийского научного института (г. Бангалор), разработала термотолерантную вакцину против COVID-19. Субъединичная вакцина создана на основе RBD S-белка SARS-CoV-2 и представлена в двух вариантах: мономерном и тримерном. Дизайн термостабильных комбинаций адъювантов и вакцин был описан ранее. В лиофилизированном виде препараты сохраняли функциональную стабильность при нагревании до 100°C в течение 90 минут и при хранении на 37°C в течение четырех недель.
В новой работе, опубликованной в Viruses, ученые продемонстрировали иммуногенность вакцин Mynvax на мышах. Вакцины индуцировали высокие титры нейтрализующих антител против вариантов коронавируса D614G, дельта и омикрон. При этом уровень нейтрализующих антител против омикрона по сравнению с D614G был в среднем в 14,4 раз ниже для мономерного варианта препарата и в 16,5 раз ниже для тримерного. В случае дельты эти показатели составили 2,5 и 3,0 соответственно. По мнению авторов, мономерный вариант подходит для запланированного КИ фазы 1.
Термостабильная вакцина против COVID-19 станет хорошей опцией для стран с низким и средним уровнем дохода, где соблюдение холодовой цепи затруднено.
Китайские ученые сравнили способность к репликации и клеточный тропизм у штаммов SARS-CoV-2 дикого типа, D614G, альфа, бета, дельта и омикрон. Эксперименты проводились ex vivo на тканях человеческих бронхов и легких. Оказалось, что омикрон реплицируется в клетках бронхов быстрее остальных штаммов. При этом его репликация в паренхиме легких была менее эффективна. Клеточный тропизм всех штаммов не отличался от такового для вируса дикого типа. Омикрон зависел от клеточных катепсинов больше остальных, а значит, можно предположить, что он проникает в клетку по иному пути, чем другие штаммы. Сниженная способность омикрона к репликации в легких может объяснить менее тяжелое течение инфекции, вызванной этим штаммом.
Ученые из США и Японии проверили эффективность моноклональных антител к SARS-CoV-2, предназначенных для клинического использования, против варианта вируса омикрон. Исследование проводилось на клетках, зараженных клиническим изолятом омикрона. В качестве контроля использовали штамм D614G. Ученые оценивали нейтрализующую активность антител Vir Biotechnology (S309, предшественник VIR-7831), AstraZeneca (COV2-2196 и COV2-2130, предшественники AZD8895 и AZD1061), Regeneron (REGN10933 и REGN10987), Lilly (LY-CoV555 и LY-CoV016) и Celltrion (CT-P59). Большинство моноклональных антител (LY-CoV555, LY-CoV016, REGN10933, REGN10987 и CT-P59) не были способны нейтрализовать омикрон. Нейтрализующая активность AZD8895 и AZD1061 по отношению к омикрону была снижена примерно в 12 раз относительно таковой против исходного штамма, S309 — в шесть раз. Таким образом, коммерческие моноклональные антитела могут быть неэффективны против варианта омикрон. Работа принята к публикации в Nature Medicine.
Компания Moderna, создавшая вакцину mRNA-1273 против SARS-CoV-2, объявила об обновлениях своей стратегии по устранению вызывающих опасения вариантов (VOC) коронавируса, с учетом появления штамма B.1.1.529 (омикрон). Геном B.1.1.529 включает мутации, наблюдаемые в дельте и увеличивающие ее трансмиссивность, а также мутации, которые встречаются в бете и дельте и способствуют ускользанию от иммунного ответа.
В настоящее время бустерная доза уже существующей вакцины — единственная доступная стратегия борьбы с новым штаммом. Вакцина mRNA-1273 в дозе 50 мкг разрешена в качестве бустера в США. Компания проверяет, способна ли бустерная доза нейтрализовать вариант омикрон, и планирует получить данные в ближайшие недели. На случай если надежность защиты не подтвердится, предложены три варианта стратегии.
1. Повысить дозу бустера для здоровых взрослых до 100 мкг. Этот вариант изучается в настоящее время, и он создает наивысшие нейтрализующие титры против известных штаммов SARS-CoV-2.
2. Использовать созданные ранее мультивалентные бустеры-кандидаты против штаммов с мутациями, подобными тем, что содержаться в омикроне. Эти вакцины уже проходят клинические исследования: mRNA-1273.211, нацеленная на бету (4 идентичные или сходные замены в S-белке: K417N, E484K/A, N501Y, D614G), и mRNA-1273.213 против беты и дельты (8 идентичных или сходных замен: T95I, G142D, K417N, T478K, E484K/A, N501Y, D614G, P681R/H). Moderna проведет тестирование сывороток крови участников испытаний, чтобы оценить их нейтрализующие свойства против омикрона.
3. Быстрая разработка кандидатной вакцины, специфичной против омикрона — mRNA-1273.529. Компания не раз демонстрировала способность продвигать новых кандидатов на клинические испытания за 60-90 дней, отмечается в пресс-релизе.
Первые участники фазы 2-3 испытания вакцины COVID-19 AZD2816 были вакцинированы 27 июня.
AZD2816 разработана с использованием той же платформы, что и Vaxzevria, предыдущая вакцина против коронавируса от AstraZeneca, нацеленная на старые штаммы (вектор на основе аденовируса шимпанзе). Однако ген S- белка в векторе содержит изменения, аналогичные тем, что наблюдаются у бета-варианта коронавируса (B.1.351, впервые обнаружен в Южной Африке). Многие из них также присутствуют в других вариантах, вызывающих опасения. Эти мутации снижают способность антител против исходного вируса блокировать проникновение в клетки нового варианта (K417N, E484K, N501Y), повышают инфекционность (D614G), снижают чувствительность нейтрализующих антител (L452R). Обновленный S-белок содержит в общей сложности десять замен, говорится в пресс-релизе компании.
В испытании примут участие около 2250 человек из Великобритании, Южной Африки, Бразилии и Польши. Оценивается безопасность и иммуногенность как для ранее вакцинированных, так и для невакцинированных взрослых.
Те, кто ранее был вакцинирован двумя дозами вакцины Vaxzevria (также известной как ChAdOx1 nCoV-19, AZD1222) или мРНК-вакциной, получат AZD2816 не ранее чем через три месяца после второй дозы. Те, кто ранее не прививался, будут вакцинированы двумя дозами AZD2816 с интервалом в четыре или 12 недель. Лица, получившие одну дозу Vaxzevria, через четыре недели получат вторую дозу AZD2816.
В JAMA Network Open опубликованы результаты геномного исследования клинических образцов от семи пациенток учреждения длительного ухода в США, инфицированных SARS-CoV-2. Значения порогового цикла при ПЦР-анализе образцов варьировало от 17 до 27, что говорит о высокой вирусной нагрузке. Вирусные геномы в этой группе отличались друг от друга менее, чем на три нуклеотидных замены. При этом сравнении их с референсным штаммом Wuhan-Hu-1 выявило 13–15 замен. Геномы отнесли к кладе 20С (к этой же кладе относится «калифорнийский» штамм коронавируса, ). Замена D614G в S-белке присутствовала во всех семи образцах. Другие мутации давали различия в 7–8 аминокислот на уровне белка. По оценкам ученых, аминокислотные замены K854N в S-белке и N36Y в ORF9b потенциально ассоциированы с изменениями функций белка и снижением инфекционности вируса.
Авторы письма, опубликованного в NEJM, проверили, действуют ли вакцины mRNA-1273 (Moderna) и NVX-CoV2373 (Novavax) против «калифорнийского» штамма SARS-CoV-2. Штамм, также известный как B.1.429, несет мутации в S-белке, что вызывает опасение в недостаточной эффективности индуцированных вакцинами нейтрализующих антител против него. Ученые работали с образцами сыворотки крови 14 реконвалесцентных индивидов, 26 реципиентов Moderna и 23 реципиентов Novavax. Нейтрализующую активность сыворотки тестировали на псевдовирусах, имитирующих «калифорнийский» и «южноафриканский» (B.1.351) штаммы, а также SARS-CoV-2 с единственной мутацией в S-белке (D614G) для сравнения. По результатам исследования, вакцины Moderna и Novavax дают нейтрализующие антитела против штамма B.1.429, но эффективность их против B.1.351 вызывает сомнения.
Первая инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2, в Южной Африке была выявлена 5 марта 2020 года, а к 26 марта в стране введены строгие карантинные меры, тем не менее к ноябрю года более 785000 человек в ЮАР были инфицированы. Авторы исследования, опубликованного в Nature Medicine, проанализировали 1365 почти полных геномов вируса и сообщили об идентификации 16 линий SARS-CoV-2, выделенных в период с 6 марта по 26 августа 2020 года. Большинство линий имеют уникальные мутации, не идентифицированные где-либо еще. Три линии (B.1.1.54, B.1.1.56 и C.1) распространились в ЮАР во время первой волны, составляя около 42% всех инфекций в стране. К концу августа наиболее широко была распространена C.1 с 16 мутациями по сравнению с исходной уханьской последовательностью, включая замену аминокислоты в S-белке, D614G. Геномный надзор в ЮАР имел решающее значение для своевременной идентификации варианта 501Y.V2, способного ускользать от иммунного ответа у переболевших и вакцинированных, отмечают авторы. Они сообщают, что исследуют перекрестную реактивность между разными вариантами вируса, чтобы понять, насколько надежно защищает инфекция одним вариантом от реинфекции другим и не может ли при этом возникнуть антителозависимое усиление инфекции (повторное заболевание, более тяжелое, чем первое).
В базе препринтов bioRxiv появились результаты проверки эффективности комбинации нейтрализующих моноклональных антител REGN-COV2 против SARS-CoV-2 на макаках-резусах и сирийских хомячках. REGN-COV2 включает антитела REGN10987 и REGN10933, разработанные компанией Regeneron Pharmaceuticals. Было показано, что REGN-COV2 обладает выраженными профилактическими и терапевтическими свойствами: у животных, получавших антитела, вирусная нагрузка была ниже, а проявления инфекции — менее выраженными по сравнению с плацебо-группами. Ранее было показано, что аминокислотная замена D614G в S-белке SARS-CoV-2 не влияет на нейтрализующую способность антител REGN10987 и REGN10933. В настоящее время проходят клинические исследования комбинации REGN10987+REGN10933 (NCT04426695, NCT04425629 и NCT04452318).