15.01.2026

JP Morgan Healthcare 2026: 10x Genomics

10x Genomics планирует внедрить свои разработки в клиническую практику, а также открыть сертифицированную CLIA лабораторию в начале 2027 года. Компания совместно с Институтом онкологии Даны-Фарбера проанализирует сотни образцов солидных опухолей, а совместно с больницей Бригам-энд-Уимен Гарвардской медицинской школы — образцы периферической крови, в которых выявит маркеры аутоиммунных заболеваний.

Credit:

123rf.com

Компания 10x Genomics предпринимает усилия по внедрению в клиническую практику своих технологий анализа экспрессии генов на уровне единичных клеток и пространственной транскриптомики. На ежегодной конференции JP Morgan Healthcare в понедельник генеральный директор и соучредитель Серж Саксонов объявил о трех новых коллаборациях с фокусом на клинику и сообщил о планах компании открыть сертифицированную CLIA лабораторию в начале 2027 года.

Два из этих партнерств ориентированы на онкологию. 10x и Институт онкологии Даны-Фарбера будут анализировать сотни образцов солидных опухолей для выявления признаков, связанных с ответом на лечение, лекарственной устойчивостью и прогрессированием заболевания.

Компания 10x также сотрудничает с Институтом исследований рака для создания набора данных по иммуноонкологии, включающего 500 миллионов клеток из примерно 20 000 образцов. На пилотном этапе партнеры планируют получить данные примерно из 3000 образцов, используя платформы Chromium для анализа экспрессии генов в единичных клетках и Xenium для анализа пространственной транскриптомики, в сотрудничестве с исследователями из Университета Пенсильвании, Стэнфордского университета и Мемориального онкологического центра Слоана — Кеттеринга. Эти наборы данных будут использоваться для оценки моделей, сгенерированных искусственным интеллектом, и определения того, какие клеточные характеристики и характеристики микросреды являются наиболее предиктивными в доклинике.

Помимо онкологии, компания 10x занимается разработкой лечения аутоиммунных заболеваний, включая ревматоидный артрит, системную красную волчанку и гигантоклеточный артериит. В сотрудничестве с Кевином Вэем и другими исследователями из больницы Бригам-энд-Уимен Гарвардской медицинской школы, специалисты компании 10x проанализируют образцы периферической крови, чтобы выявить иммунные маркеры, связанные с активностью заболеваний, обострением, ремиссией и терапевтическим ответом. По словам Вэя, компания 10x обработает образцы, собранные больницей Бригам-энд-Уимен, и партнеры совместно проанализируют результаты.

Эти объявления, наряду с сотрудничеством с компанией CareDx, занимающейся диагностикой трансплантации, о котором стало известно на прошлой неделе, являются явным признаком того, что 10x рассматривает диагностическое тестирование как важную часть своего будущего.

Саксонов объяснил готовность компании к внедрению технологии 10x анализом на основе секвенирования единичных клеток Flex, который позволяет фиксировать образцы непосредственно в момент сбора и мультиплексировать их для повышения экономической эффективности крупных исследований.

Некоторые врачи-исследователи уже проявляют интерес к тестированию с использованием технологии 10x для своих пациентов. По словам Саксонова, это и есть стимул к активному участию в крупномасштабном получении клинических данных.

Помимо сбора доказательств, совместные проекты с онкологическим центром Даны-Фарбера и больницей Бригам-энд-Уимен будут посвящены применению методов выбора терапии, а также общей теме составления информативных и поддающихся интерпретации клинических отчетов.

В рамках исследования с центром Даны-Фарбера будут изучены образцы сотен пациентов для оценки новых классов терапии, включая конъюгаты антител с лекарственными препаратами, радиолигандную терапию, биспецифические антитела и ингибиторы иммунных контрольных точек, а также другие подходы, основанные на персонализированной медицине.

Сопоставляя карты экспрессии генов с известными клиническими результатами, исследователи надеются выявить биологические особенности, которые отличают пациентов, получающих пользу от лечения, от тех, кто пользы не получает.

В больнице Бригам-энд-Уимен команда Вэя будет наблюдать за как минимум 1000 пациентами в течение четырех лет, отбирая и анализируя образцы по крайней мере в 10 временных точках. «Мы знаем, что существуют определенные признаки, коррелирующие либо с активностью заболевания, либо с обострениями, либо с ответом на лечение, но как их отслеживать в реальных условиях? В этом и заключается проблема», — сказал Вэй. «Это позволит понять, где мы видим сигналы, которые могут быть преобразованы в диагностический тест, помогающий принимать обоснованные решения».

Вэй надеется, что секвенирование единичных клеток сможет предложить врачам, таким как он, функциональную оценку иммунитета, подобно тому, как пульмонолог может назначить тест на функцию легких, а кардиолог — эхокардиографию для оценки сокращений сердца. «Если мы докажем, что это работает для мониторинга иммунной системы, это можно будет применить и к другим заболеваниям, сопровождающимся воспалением, например, к сердечно-сосудистым», — добавил он. «Мы знаем, что там есть воспаление».

Задача преобразования профилей экспрессии генов в практические клинические отчеты «нетривиальна», но решаема, по словам Саксонова. В случае рака практические выводы могут включать в себя паттерны экспрессии целевых генов, иммунный контекст или показатели чувствительности к терапии.

«Мы стремимся учиться у мира генетики», — сказал Саксонов, но отметил, что, несмотря на сложность данных, генерируемых технологиями 10x, «они не должны быть пугающими или сложными для понимания».

По словам Саксонова, общая стратегия 10x заключается в том, чтобы дать возможность своим клиентам создавать лабораторные диагностические тесты (LDT), и что любые усилия по созданию распределенных китов будут основаны на потребностях клиентов.

По материалам GenomeWeb и вебсайтов компаний